藿香蓟为一年生草本,高50到100厘米,但少数植株会不足10厘米,没有明显的主根,茎部比较粗壮。
藿香是多年生草本植物,茎比较直立,高度在50到150厘米,上面部分有极其短的细毛,下方无毛。
藿香蓟叶片对生,上部分可能会有叶片互生,叶片形状为卵形或者长圆形。
藿香叶片长度大约在4.5到11厘米,宽为3到6.5厘米,叶片边缘有比较粗的齿状裂口,几乎没有小毛的分布,叶柄大约长1.5到3.5厘米。
藿香蓟花朵一般排列紧密,极少数有松散的伞房花序样式的,花梗长大约0.5到1.5厘米。
藿香的花序为圆筒形穗状花序,长度大约在2.5到12厘米,花梗极短,一般为3毫米左右。
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