近日,中国、土耳其和比利时等国科学家完成了野生油橄榄树基因组测序和组装,组装基因组大小为1.48 Gbp。研究结果于2017年10月9日在线发表于《PNAS》上。
野生油橄榄树(Olea europaea var. sylvestris)被认为是栽培油橄榄树的祖先。基因组测序及组装预测野生油橄榄树基因组超过50,000个蛋白质编码基因,其中大多数基因可归为通过新构建遗传图谱获得的23个假染色体。野生油橄榄树基因组包含两个木犀科谱系特异的古多倍化事件,约为2千8百万年前和5千9百万年前。这些事件有助于在油生物合成中起重要作用的基因于基因家族的扩大及新功能化。油生物合成基因(如FAD2、SACPD、EAR和ACPTE)的功能差异与重复,是与另一种密切相关的油料作物芝麻积累油酸和亚油酸差异的重要原因。来自转座元件富集区的siRNA可抑制野生油橄榄树FAD2重复基因的表达。此外,SACPD基因家族的新功能化使SACPD2/3/5/7的表达水平升高,从而导致硬脂酸的去饱和化增加。总结而言,FAD2表达降低和SACPD表达增加可能解释了野生油橄榄中超高水平的油酸积累。野生油橄榄树基因组为油生物合成的进化提供了重要信息,并将成为油料作物基因组有价值的资源。
Figure 1. The genomic landscape of oleaster.
Figure 2. Oleaster genome evolution.
Figure 3. Oleic-acid biosynthesis pathway in oleaster.
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