昆明植物研究所在唇形科分类学方面取得重要进展
唇形科（Lamiaceae）为被子植物第六大科，全球有230余属7000余种，世界广布，中国是其多样性分布中心之一。该科植物具有重要的经济价值，在烹饪、药用、园艺、建材等方面有着广泛应用，与人类健康生活息息相关。
自上世纪90年代唇形科与马鞭草科 (Verbenaceae) 进行系统重排以后，唇形科的范畴及分类系统发生了剧烈变化。近年来，随着分子系统学的发展，唇形科系统学研究取得了重要进展，其中中国分类学者做出了重要贡献。如，中国科学院昆明植物研究所陈亚萍博士等先后确定了该科8个系统位置未定属的系统位置，即歧唇花属Acrymia Prain、歧伞花属 Cymaria Benth.、辣莸属 Garrettia Fletch.、全唇花属Holocheila (Kudo) S. Chow、膜萼藤属Hymenopyramis Wall. ex Griff.、喜雨草属 Ombrocharis Hand.-Mazz.、漱齿木属 Peronema Jack及东芭藤属Petraeovitex Oliv的系统学位置（Chen et al., 2014, 2016）。在此基础上，江西农业大学李波博士等联合中国、美国及英国的唇形科分类专家，进一步提出了将唇形科划分为12个亚科的新观点（Li et al., 2016，Li & Olmstead 2017），引起了广泛关注。然而，荆芥亚科Nepetoideae及筋骨草亚科Ajugoideae在该科中的系统位置及与其它亚科（如柚木亚科Tectonoideae、豆腐柴亚科Premnoideae等）的亲缘关系仍未得到解决。
为了深入探讨唇形科的起源、性状演化、历史生物地理学及物种多样性的形成机制，构建唇形科稳固的系统发育关系迫在眉睫。在此科学问题的驱动下，中国科学院昆明植物研究所、江西农业大学唇形科研究团队联合中国、伊朗、美国、澳大利亚、挪威、奥地利、土耳其等八国的唇形科分类学者，对唇形科开展了全球范围的广泛取样。历经四年时间，获得了79属175个代表类群的叶绿体全基因组序列，取样覆盖了目前已界定的12个亚科。在此基础上，基于79个蛋白质编码基因重建了唇形科系统发育框架，验证了12个亚科的单系性，明确了荆芥亚科、筋骨草亚科与其近缘类群的系统发育关系，提出了唇形科12个亚科22个族的新分类系统，其中本研究建立了三个新族（图1）。同时，还对各亚科和各族的分类历史、地理分布、形态特征、属种多样性等内容进行了全面阐述和系统总结。
该研究成果于2021年1月8日以“An updated tribal classification of Lamiaceae based on plastome phylogenomics”为题发表在生物学1区期刊BMC Biology上。中国科学院昆明植物研究所赵飞博士、陈亚萍博士并列为文章第一作者，江西农业大学李波博士、中国科学院明植物研究所向春雷博士为论文的共同通讯作者。该文章是BMC Biology上接受发表的第一篇分类学论文，主编及审稿人对该研究结果给予了高度评价，认为本研究是一项“里程碑”式的工作。上述研究工作得到了云南省优青（2019FI009）、中国科学院“西部之光”等项目的资助。
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图1 唇形科最新分类系统
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