农作物病原卵菌基因组数据库资源概述.pdf
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也觉侨、]; 20日， 39(6):1 - 6 Plant Protectiun 专论与综述 Reviews 农作物病原卵菌基因组数据库资源概述 高亚梅I ， 2 ， 王相晶l ， 向文胜l 持 (1.东北农业大学生命科学学院，哈尔滨 150030; 2. 黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院，大庆 163319) 摘要 卵菌包含许多严重危害农作物的病原菌，目前已经积累了一些重要病原卵菌的基因组数据，这些数据资源对 于卵菌的功能基因纽研究具有重要意义。本文对农作物病房、卵菌基因组数据库资源及数据库检索方法做一概述， 以期促进卵菌基因组数据资源的利用，加快其功能基因学研究。 关键词 卵菌; 功能基因组学; 数据库资源; 检索 中固分类号: Q 75 文献标识码: A 四)1: 10. 3969/j. Îss且 0529 - 1542. 2013. 06. 001 Review of genome database resources of oomycete Gao Yamei 1• 2 , Wang Xiangjing 1 , Xiang Wensheng 1 (1. Northeast Agricultural University , Schω1 of Life Sciences , Harbin 150030 , China; 2. Heilongjiang Bayi Agricultural University , College of Life Science and Technology , Daqing 163319 , China) Abstract Oomycete includes many destructive pathogens of plants. Several genome databases of important ∞my cete species had been constructed , which are significant for genomics research. In this paper , the current progr巳s ses of these resources were reviewed and the data mining methods were introduced , to facilitate the utility of ∞ mycete genom巳 data resources and accelerate the research of functional genomics. Key words oomycete; functional genomics; database resource; query 卵菌(Oomycetes) 属于色藻界(Chromista) ，包 1 卵菌结构基因组学数据库资源及检索方法 括腐生菌及植物、动物和许多微生物的病原菌。病 原卵菌导致许多作物、花卉等发生灾难性病害，例如 随着测序技术的不断发展，高通量测序使得测 O 引起大豆疫霉根腐病的大豆疫霉(伊Ph句ytωopμht仇hora 阳s 序成本不断降低，越来越多的基因组计划启动，甚 jαe Kaufm口nann et Ge盯rd世emann) ;引起的马铃薯晚疫病 至可以用宏基因组学(metagenomics) 技术测定一 的致病疫霉
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