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标本采集和保存技术要求一览表模板.doc

花匠小妙招
2024-12-27 02:44

文档简介

资料内容仅供您学习参考，如有不当或者侵权，请联系改正或者删除。附件1标本采集和保存技术要求一览表病人类型种类采集时间和频次采集方法保存条件备注所有病例全血1、入院后立即采集;2、间隔3－5天采集一次;3、逝前采集一次。真空采血管无菌采集血清分装2管血块单独保存低温保存,-70℃最佳,-20血块用于细菌检测抗凝血入院后立即采集真空抗凝采血管无菌采集最好在使用抗生素前采血同上传染病所要求如5天内能送达实验室,可0℃~10℃咽拭子入院后立即采集塑料杆拭子擦拭双侧咽扁桃体及咽后壁,将拭子头分别浸入含3ml病毒或细菌采样液的螺口塑料管中同上详见表下注。漱口液入院后立即采集10ml不含抗菌素的采样液漱口,无菌螺口塑料管收集同上详见表下注。尿标本1、入院后立即采集;2、临床检查采集标本时留样无菌管采集中段尿标本10ml同上详见表下注。便标本1、入院后立即采集;2、临床检查采集标本时留样无菌管采集粪便标本同上详见表下注。下呼吸道标本气管插管时采集采集呼吸道抽取物或分泌物同上详见表下注。痰液有痰液时采集同上详见表下注。心脏穿刺组织死亡后未做尸检时采集同上详见表下注肺穿刺组织心包液胸腔积液尸检标本2份同上,1份福尔马林充分固定后,4℃应尽量多采集各器官组织标本,例如肺组织、胸腔积液、心脏组织、心包液、肝、肾、脾组织,如果有神经系统表现,还需采集脑组织以及其它可能受累的器官标本有明确脑膜脑炎或脑炎症状病例脑脊液急性期无菌采集同上有出疹症状病例疱疹液有疱疹时无菌采集同上注:1、以上标本分别用于开展病毒和细菌等病原体检测2、采集咽拭子标本、下呼吸道标本、痰液、心脏穿刺组织、肺穿刺组织、心包液、胸腔积液使用的样品保存液应不含抗生素或不用样品保存液,现场无菌接种,并将接种后剩余的标本立即冷冻(-20℃以下)保存。漱口液、尿标本和粪便标本现场无菌接种,并将接种后剩余的标本立即冷冻(-20℃以下)保存。附件2手足口病例标本送检登记表患者姓名性别出生日期年月日(阴/阳历)家长姓名家庭住址市乡(镇、街办)村(居)号家庭电话发病日期年月日初诊日期年月日;初诊单位(省级/市级/县级/乡级/村级)初步诊断:_______________________________住院治疗(是/否),如住院,则:入院日期年月日,入院诊断出院日期年月日,出院诊断病程天预后:痊愈/好转/未愈/死亡/其它;后遗症(有,;无)标本统一编号:标本类型采样日期送检日期是否冷藏标本量收样日期检测日期报告日期实验结果RDHEp-2中和抗体滴度咽拭子血清急性期恢复期粪便标本脑脊液疱疹液注:送检标本编号为”标本统一编号+标本类型”,其中”T”为咽拭子代码,”S1”为急性期血清代码,”S2”为恢复期血清代码,”F”为粪便标本代码,”CSF”为脑脊液代码,”H”为疱疹液代码。采样人:采样单位:送样人:附件3手足口病实验室检测方案(试行)为规范手足口病的标本采集、运送及实验室检测操作程序,提高检测准确性,从而为手足口病的明确诊断和相关实验研究提供可靠的依据,特制定本方案。手足口病的实验室检测原则和程序手足口病的诊断一般是经过采集适当的临床标本后进行病毒分离和病毒鉴定,如果没有采到合适的临床标本,或无法进行病毒分离,也能够经过血清学检测(如中和实验)来检测血清中的中和抗体,或直接从临床标本中检测病毒的核酸来诊断(见下图:手足口病的实验室诊断流程图)。一般是由省级病毒实验室进行病毒的分离,爆发疫情范围较大时,国家参比实验室也能够提供技术支持。病毒分离成功后,送至国家参比实验室进行鉴定或复核,同时对全国手足口病的病原进行病毒学监测。国家参比实验室接到标本后,在30日内将结果反馈给省级实验室。很多血清型的肠道病毒能引起手足口病,不同细胞系对不同病毒的敏感性是有所不同的,而不同时期肠道病毒的流行株也不同。一般见于肠道病毒分离的细胞系为RD细胞(对CA16和EV71敏感)、HEp-2细胞(对某些柯萨奇B组病毒敏感)等,联合使用上述两种或更多细胞(如Vero细胞)有助于分离到更多的肠道病毒。使用血清型特异性的中和抗血清进行的中和实验是肠道病毒鉴定的基本方法,如果使用了适当的抗血清,实验结果是比较可靠的。因为肠道病毒包括若干个血清型,一般使用组合抗血清进行鉴定,有些组合抗血清已经商品化。当无法进行病毒分离或得不到适用于病毒分离用的标本时,血清学检测能够为肠道病毒的感染提供一个间接的证据。一般用急性期血清与恢复期血清的检测结果进行比较,抗体滴度呈四倍或以上增高证明有急性感染。可是,无症状的肠道病毒感染也是常见的,因此对检测结果的解释要慎重一些。为了提高检测速度,也为了辅助中和实验法进行毒株鉴定,最近很多实验室都使用分子生物学方法。当前,用分子生物学方法对肠道病毒进行定型还没有统一的标准,而且要根据检测目的选择使用适用的方法。检测结果的评价如果从临床标本中分离到肠道病毒,特别是分离自脑脊液、疱疹液,那么很可能该病毒就是病因病原。当无法进行病毒分离或未分离到病毒时,血清学诊断方法能够作为病毒感染的间接证据。对于难以分离到的肠道病毒,分子生物学方法如RT-PCR是很有用的。肠道病毒有时引起无症状感染,因此实验结果的实际意义应结合临床过程和流行病学资料进行解释。实验室诊断标准根据手、足、口等部位典型皮疹即可作出HFMD临床诊断,流行病学接触史有助于诊断,临床诊断病例中符合下列之一,即为实验室诊断病例:1,患者的粪便标本、咽拭子标本中病毒分离阳性率远高于对照人群;2,肠道病毒型特异性中和抗体滴度≥1∶256;或恢复期血清中肠道病毒型特异性中和抗体较急性期有4倍或4倍以上增高;3,在病变组织中如疱疹液或脑脊液中分离到病毒;4,自患者血清、疱疹液或脑脊液等标本中检测到病原体核酸。一、标本采集对象标本采集对象是暴发疫情出现时手足口病的临床诊断病例和病例发病所在社区(村)的临近无病例的社区(村)或托幼机构的5岁以下的儿童(作为健康对照人群)。用于病毒分离的标本包括粪便、咽拭子和疱疹液,如果患者出现神经系统症状,能够采集脑脊液标本。对于血清学诊断,需要在急性期和恢复期采集双份血清标本。临床标本在运输和贮存过程中要避免重复冻融,如果不能确保-20℃的条件,应该在0~8℃运输和保存。标本应冷冻运输,运输时要附有必要的信息,如标本编号、发病日期和标本采集日期。二、标本种类及采集、运送(一)粪便标本采集病人发病7日内的粪便标本,用于病原检测。粪便标本采集量5~8g/份,采集后立即放入无菌采便管内,4℃暂存立即(12h内)送达实验室,－20℃以下低温冷冻保藏,需长期保存的标本存于－70℃冰箱。(二)咽拭子标本采集病人发病3日内的咽拭子标本,用于病原检测。用专用采样棉签,适度用力拭抹咽后壁和两侧扁桃体部位,应避免触及舌部;迅速将棉签放入装有3~5ml保存液(维持液或生理盐水,推荐使用维持液)的采样管中,在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密封,以防干燥。4℃暂存立即(12h内)送达实验室,－20℃以下低温冷冻保藏,需长期保存的标本存于－70℃冰箱。(三)血清标本采集急性期(发病0~3d)和恢复期(发病14~30d)双份配对血清用于抗体检测。静脉采集3~5ml全血,置于真空无菌采血管中,自凝后,分离血清,将血清置于－20℃以下冰箱中冷冻保存。(四)疱疹液在手足口病的实验室诊断中,从疱疹液中分离到病毒具有很高的诊断价值,可同时采集多个疱疹作为一份标本。先用75%的酒精对疱疹周围的皮肤进行消毒,然后用消毒针将疱疹挑破用棉签蘸取疱疹液,迅速将棉签放入内装有3~5ml保存液(维持液或生理盐水,推荐使用维持液)的采样管中,在靠近顶端处折断棉签杆,旋紧管盖并密封。所采集标本4℃暂存立即(12h内)送达实验室,－20℃以下低温冷冻保藏,需长期保存的标本存于－70℃冰箱。(五)脑脊液标本出现神经系统症状的病例,要采集脑脊液标本,进行病原和抗体检测,从脑脊液中分离病毒也具有很高的诊断价值。采集时间为出现神经系统症状后3天内,采集量为1.0~2.0ml。采集后立即装入无菌带垫圈的冻存管中,4℃暂存立即(12h内)送达实验室,－20℃以下低温冷冻保藏,需长期保存的标本存于－70℃冰箱。(六)病例密切接触者的标本采集选择典型病例所在的托幼机构、或所在村,以新发病例密切接触者为采样对象,采集单份粪便和血清标本。(七)健康对照的标本采集选择患儿发病所在社区(村)的临近无病例的社区(村)或托幼机构。采集5岁以下的儿童单份粪便和血清标本。三、标本采集注意事项在手足口病的实验室诊断中,从疱疹液或脑脊液中分离病毒具有很高的诊断价值,但对于不同血清型的肠道病毒,脑脊液中的病毒分离率是大不相同的。用于采集咽拭子的无菌拭子要放在适当的保存液中,如维持液或生理盐水,以防干燥。用于分子生物学诊断的标本采集与病毒分离标本的采集方法一样。为了保证检测结果的准确性和有效性,标本应在病例发病后尽早采集,尽快检测。不能立即检测的标本应冷冻保存。对于血清学诊断,急性期血清应该在发病后尽早采集,恢复期血清在发病两周后采集。四、实验室检测操作流程(一)病毒分离1.试剂配置(1)细胞的生长液、维持液的配制见下表生长液(GM)维持液(MM)Eagle`s液(MEM)86.5ml92.5mlL-谷氨酰胺200mM1.0ml1.0ml胎牛血清10.0ml2.0ml7.5%NaHCO3溶液2.5ml3.5mlP.S溶液*(青霉素及链霉素)1.0ml1.0ml(2)粪便标本的处理液完全PBS液中加入P．S溶液,终浓度为青霉素500单位/ml,链霉素为500μg/ml。2．病毒分离细胞系许多细胞系可支持人肠道病毒(如EV71、CA16)生长。对于检测手足口病的病原来说,建议所有怀疑含EV71、CA16的标本均需接种到以下两种细胞系:RD细胞,来源于人横纹肌肉瘤细胞。HEp-2细胞,来源于人喉癌上皮细胞。3．标本的处理(1)粪便标本的处理操作步骤:1.1在离心管上标记标本号;1.2每管中加入10mlPBS、1g玻璃珠、1ml氯仿;1.3在生物安全柜中将每一份粪便标本取大约2g加入标记好的离心管中(确保离心管上的标号与原始标本的标号一致);1.4剩余的原始标本最好留在原容器中,冻存于－20℃1.5确保拧紧离心管,用机械震荡器剧烈震荡20min;1.6在确保离心机的盖子盖好和离心桶密封的情况下,用冷冻离心机在1500g条件下离心20min;1.7在生物安全柜中将每一份标本的上清液分别吸入2个有外螺旋盖的冻存管中(如果上清液不清澈,应再用氯仿处理一次);1.8一管粪便悬液冻存于－20℃作为备份,另一管存于4~8(2)疱疹液标本的处理疱疹液标本一般直接用于病毒分离。(3)脑脊液标本的处理脑脊液标本一般直接用于病毒分离。(4)咽拭子标本的处理咽拭子要在标本运输(保存)液中充分搅动(至少40下),以洗下拭子上粘附的病毒及含有病毒的细胞等,然后在4℃条件下,10000rpm离心20min,用上清接种到细胞上,如果发现有细菌污染,须用滤器过滤除菌。4．接种和观察(病毒分离)(1)显微镜下观察单层细胞,以确保细胞是健康的。一个健康的单层细胞会在传代后3d左右形成;(2)倒掉生长液(GM),换上1~1.2ml的维持液(MM);(3)每一份标本需要同时接种2支RD细胞和2支HEp-2细胞,正确标记每支细胞培养管(包括标本的编号、日期、传代数);(4)每一种细胞至少标记一管作为阴性对照;(5)每支试管接种0.2ml的标本悬液,培养温度要求36℃(对于AHC标本的病毒分离,特别是EV70的分离培养,强烈建议降低培养温度,一般可为34~35℃);(6)使用倒置显微镜每天观察细胞培养管,以观察有特征性的肠道病毒致细胞病变效应(CPE)的出现(如细胞变圆,折光增强并脱离管壁等);(7)记录接种管和对照管细胞所发生的变化至少一周,记录CPE(1+~4+)、提示细胞受毒性反应、老化或污染的影响而发生的变化(1+,<25%;2+,25%~50%;3+,50%~75%;4+,75%~100%);(8)如果有特征性的肠道病毒CPE出现,要如实记录,并观察直到75%的细胞发生变化(3+CPE),然后储藏在－20℃以备二次传代。同一病例的二次传代的病毒分离物能够放到一起用于进一步的鉴定;(9)第1代培养见可疑细胞病变时继续传代,待细胞病变稳定出现后－20℃或－70℃冻存;(10)一代阳性分离物再传二代,如果又有明显的CPE出现,将病毒保存在－20℃冰箱(二代病毒)。因二代病毒滴度高于用一代病毒,因此选用二代病毒进行鉴定。(11)如果7d之后没有CPE出现,那么盲传1代继续观察7d。(注意:同一病例标本的细胞培养物不能混在一起再传代,例如:不同细胞的培养物应单独传代);(12)盲传2代后,依然没有出现CPE的,则判定为阴性;(13)注意:如果接种后24h内出现CPE,很可能是标本中的非特异性成分导致的毒性反应。取100μl阳性分离物传二代,继续观察;或者在接种标本吸咐1h后用维持液清洗细胞层,可能会降低毒性反应。(14)几个概念:A:毒性反应:如果在接种后1~2d内细胞快速地调亡,这可能是由于标本中含有毒性物质而导致的非特异性毒性反应。这些已接种标本的试管应在－20℃冻存,融化后取0.2ml接种到同一类型细胞中(此时是第二代)。如果又出现了毒性反应,那么应该取原始标本用PBS稀释10倍,再次接种到同种细胞中。这时应被认为是第一代。B:微生物污染:由于细菌污染而造成培养液混浊或细胞死亡经常使病毒造成的CPE无法确定或根本无法出现。重新取原始标本,用氯仿处理,按上述步骤重新接种到新鲜细胞上。C:盲传:有时一周之后传代细胞会老化,甚至细胞对照也出现了病变。这时已接种标本的试管应在－20℃冻存,融化后取0.2ml接种到同一类型的新鲜单层细胞中,再观察7~10d。如果盲传两代后依然没有产生CPE,那么认为这个标本是阴性的。5．病毒分离结果解释:RD细胞支持HFMD的主要病原体——CA16和EV71的复制,CA16和EV71均能在RD细胞培养中引起特殊的肠道病毒致细胞病变效应(CPE),表现为细胞圆缩、分散、胞浆内颗粒增加,最后细胞自管壁脱落。但相同滴度的CA16和EV71在RD细胞中生长的速度不同,EV71的生长速度要快于CA16,表现为EV71感染RD细胞后出现CPE的时间比CA16早,EV71接种细胞后出现CPE很快,但CA16一般要经过2次以上传代才出现明显的CPE。若在使用RD细胞分离的同时再增加HEp-2细胞,可提高肠道病毒的分离率(分离出其它可能致HFMD的病原体,如一些柯萨奇B组病毒)。但CA16和EV71在HEp-2细胞中均不繁殖。从HFMD患儿的脑脊液、血液、疱疹液等临床标本中分离出病毒有诊断价值,但单从咽拭子或粪便中分离到病毒不能确诊。从有上述临床症状群患者的咽拭子或粪便中重复分离到同一型病毒,且从周围患同样疾病者中也检出相同的病毒,且病毒分离率远高于正常人群,则有诊断的参考价值。(二)测定人双份血清标本的中和抗体滴度比较患者急性期血清与恢复期血清中和抗体滴度,可作为肠道病毒感染的血清学诊断方法,最常见的是中和实验,即用微量板法测定抗体滴度,是当前人肠道病毒抗体检测的最常见方法,该方法精确且具有型特异性。作为肠道病毒感染的诊断方法之一,能够测定血清(或脑脊液)中肠道病毒中和抗体的滴度,一般见急性期血清与恢复期血清滴度进行比较,抗体滴度4倍或4倍以上增高证明病毒感染。可是,不明显的肠道病毒感染(隐性感染)也很常见,因此在评估检测结果时就要小心一些。在中和实验中,一般要用人肠道病毒参考毒株(即原型株,EV71原型株为BrCr株,CA16原型株为G-10株),有时同时(或单独)使用临床分离株会有助于得到更准确的检测结果。使用对肠道病毒敏感的细胞,如RD细胞。用病毒(血清)稀释液(下面液体配制中的C液,可用维持液代替)稀释血清和制备病毒悬液,因为是用病毒来确定血清(CSF)中抗体的滴度,因此要使用参考病毒(原型株),但有时使用所分离到的毒株(临床分离株)有助于得到更准确的检测结果,当然,分离株的滴度(100CCID50/0.05ml)要事先测定。中和实验的检测原理:病毒感染敏感靶细胞后,引起细胞形态学变化,出现致细胞病变效应(CPE),特异性中和抗体与病毒结合后,可使病毒颗粒失去感染性,抑制CPE的出现。1．液体配制A液:血清处理液:(100ml中含下列液体)MEM85ml3%L-谷氨酰胺1ml7.5%碳酸氢钠2ml胎牛血清2ml青、链霉素(各10000U/ml)10mlB液:细胞营养液:(按生长液配方配制,100ml中含下列液体)MEM85ml3%L-谷氨酰胺1ml7.5%碳酸氢钠2mlHEPES1ml胎牛血清10ml青、链霉素(各10000U/ml)1mlC液:病毒(血清)稀释液:(按维持液配方配制,100ml中含下列液体)MEM93ml3%L-谷氨酰胺1ml7.5%碳酸氢钠2mlHEPES1ml胎牛血清2ml青、链霉素(各10000U/ml)1ml2．攻击病毒CCID50滴定和滴度梯度制备(1)将增殖后的病毒悬液冻融3次,然后在4℃、1rpm条件下离心10min,取上清液分装于2支冻存管中,每管1.5ml,一般每管应在一次试验中用完,有剩余者应废弃;(2)加Eagle液10倍系列稀释为10-1至10-8病毒液,各加入细胞板内,每孔50μl,每稀释度4孔细胞;(3)每孔加细胞悬液50μl,同时设细胞对照(50μl稀释液+50μl细胞悬液),36℃培养7d,观察细胞病变;(4)按Behrens-Kärber公式计算出分离病毒株的CCID50;logCCID50=L-d(S-0.5),其中:L=实验中使用的最低稀释度的log值;d=稀释梯度的log值;S=终判时阳性部分的总和(即出现CPE的细胞孔所占的比例之和)。(5)正式试验前应先滴定攻击病毒2~3次,取其平均值,求出每0.05ml中含100CCID50的病毒载量;(6)按照计算好的稀释比例配制攻击病毒,求出试验所需的病毒总量(即100CCID50/0.05ml);(7)取3支小试管,每只加病毒稀释液(液体配制中的C液)0.9ml;(8)用带滤芯的吸尖(ART吸尖)吸0.1ml已经稀释好的攻击病毒液(即10CCID50/0.05ml)到第一支小试管中,换另一支ART吸尖,轻轻并彻底地混匀,避免产生大量气溶胶,按照此方法依次稀释至1CCID50/0.05ml和0.1CCID50/0.05ml。3．稀释血清(1)发病1~3d内采取患者急性期血清,发病后2~4周采取恢复期血清,分别－20℃冻存备检。(2)取无菌小试管若干支(每份血清使用一支)置试管架上,每管加血清处理液(上面液体配制中的A液)0.3ml,加待测血清0.1ml,盖紧塞子,震摇混匀,放4℃冰箱过夜,即为1:4稀释血清。次日56℃、30min灭活。(3)打开独立无菌包装48孔组织培养板,纵向使用,每孔加血清稀释液(上面液体配制中的C液)0.3ml,每份血清使用一排,每排4孔。使用移液器取处理过的血清0.1ml加入第一孔(即为1:16),吹吸8~10次,吸0.1ml加入第二孔(即为1:64),依次至1:1024,血清稀释的过程中不必换吸尖。即每份血清标本进行4倍倍比稀释,即1:4、1:16、1:64、1:256、1:1024。(4)每份血清标本的每个稀释度都要平行做两孔。4．病毒中和抗体测定的操作步骤:(1)取一块96孔板横向使用,每块板能够做8份(4对)待测血清,版面设计如下图所示。A1-A2孔(B1-B2、C1-C2、D1-D2、E1-E2、F1-F2、G1-G2、H1-H2)中每孔加入1:1024稀释度的待测血清0.05ml,不必换吸尖,在A3-A4孔(B3-B4、C3-C4、D3-D4、E3-E4、F3-F4、G3-G4、H3-H4)中每孔加入1:256稀释度的待测血清0.05ml,A5-A6孔(B5-B6、C5-C6、D5-D6、E5-E6、F5-F6、G5-G6、H5-H6)中每孔加入1:64稀释度的待测血清0.05ml,A7-A8孔(B7-B8、C7-C8、D7-D8、E7-E8、F7-F8、G17-G8、H7-H8)中每孔加入1:16稀释度的待测血清0.05ml,A9-A10孔(B9-B10、C9-C10、D9-D10、E9-E10、F9-F10、G9-G10、H9-H10)中每孔加入1:4稀释度的待测血清0.05ml,A11-A12孔(B11-B12、C11-C12、D11-D12、E11-E12、F11-F12、G11-G12、H11-H12)为每份待测血清对照孔,每孔中补加稀释液0.05ml;(2)上述孔中分别加入病毒0.05ml(病毒滴度事先已经稀释为100CCID50/0.05ml);(3)盖好盖子后用微量板混匀器混匀,放入36℃CO2孵箱中孵育2h;(4)另取一块96孔板纵向使用,做100CCID50/0.05ml病毒滴度的核实(每次实验都必须做)。每孔先加病毒稀释液(试剂配制中的C液)0.05ml,然后从0.1CCID50/0.05ml加起,每孔0.05ml,每个稀释度8孔,不必更换吸尖,一直加至100CCID50/0.05ml;同时留出4孔做为细胞对照孔,每孔加入0.1ml病毒稀释液,然后放入4℃(5)在孵育期间,用消化液消化细胞,准备细胞悬液,细胞悬液的浓度为2×105个/ml,每块96孔板至少需要准备10ml;(6)孵育结束后每个待测血清孔、血清对照孔(待检标本板)和病毒回滴孔和细胞对照孔(病毒回滴板)分别加入0.1ml细胞悬液,然后用微量板混匀器混匀,放入36℃CO2孵箱中孵育培养;(7)使用倒置显微镜每天观察CPE,并记录病毒滴定结果,以不产生细胞病变的血清最高稀释度的倒数为终点效价。当100CCID50/0.05ml的病毒对照孔出现完全病变时,判定最终结果(约5~7d);(8)注意:如果病毒对照结果(病毒回滴)不在32~320CCID50/0.05ml的范围内,实验无效,就要重复实验。5．结果判定:当最高稀释度血清的2孔中有1孔出现细胞病变,另一孔不出现细胞病变,该稀释度的倒数计即为该血清标本的中和抗体效价;当高稀释度2孔完全病变,相邻低稀释度2孔完全不病变,则两者平均稀释度的倒数即为该血清标本的中和抗体效价;当两个相邻稀释度血清均出现1孔细胞病变,另1孔不出现细胞病变,则两者平均稀释度的倒数即为该血清标本的中和抗体效价。对于HFMD的双份血清中和实验结果来说,如果恢复期血清较急性期血清EV71或CA16中和抗体滴度出现4倍或4倍以上增高即可确诊;如果恢复期血清较急性期血清其它肠道病毒中和抗体滴度出现4倍或4倍以上增高可证实该肠道病毒感染,是否为病因需要其它相关实验证实;如果单份血清中和抗体滴度大于1:256也有诊断意义,血清中和抗体滴度为1:128判定为可疑阳性。(三)逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)1．RNA提取可使用商业化试剂盒来提取RNA,如使用QIAGENViralRNAMiniExtractionKit(CAT:52904)从临床标本或病毒分离培养物中提取病毒RNA;(1),向一支1.5ml离心管中加入560μl的AVL缓冲液(含CarrierRNA);(2),再向这支离心管中加入140μl临床标本或病毒分离培养物,充分混匀至少15s;(3),室温下(15℃~25℃)放置10min,然后瞬时离心;(4),加入560μl纯酒精,充分混匀至少15s,瞬时离心;(5),小心加入约630μl的混合溶液至QIAamp柱中(试剂盒附带),将QIAamp柱套在收集管上,然后8000rpm离心5s,使液体经过滤膜;(6),弃去收集管中的液体,重复第6步骤;(7),弃去收集管中的液体,小心加入750μl的AW1缓冲液,8000rpm离心5s,使液体经过滤膜;(8),弃去收集管中的液体,小心加入750μl的AW2缓冲液,8000rpm离心5s,使液体经过滤膜;(9),弃去收集管中的液体,13000rpm再次离心1min;(10),将QIAamp柱放入一支干净的1.5ml的离心管中;(11),向膜上加入40μl的EB缓冲液,然后室温下静置2~5min;(12),在离心机中以8000rpm的速度离心1min,离心下来的液体即为所需的核酸溶液。2．RT-PCR扩增(1)引物序列合成1)人肠道病毒(包括EV71、CA16)核酸检测通用引物序列:PE2(上游):5`-TCCGGCCCCTGAATGCGGCTAATCC-3`PE1(下游):5`-ACACGGACACCCAAAGTAGTCGGTCC-3`2)EV71核酸检测引物序列:EV71-S(上游):5`-GCAGCCCAAAAGAACTTCAC-3`EV71-A(下游):5`-ATTTCAGCAGCTTGGAGTGC-3`3)CA16核酸检测引物序列:CoxA16-S(上游):5`-ATTGGTGCTCCCACTACAGC-3`CoxA16-A(下游);5`-TCAGTGTTGGCAGCTGTAGG-3`(2)实验设计1)在PCR记录纸(实验记录纸)上记录本次实验操作者姓名,实验日期,所鉴定标本的名称以及标本的顺序,与PCR仪排列的顺序一致。2)标记好加标本和对照的PCR管(阳性对照,阴性对照和试剂对照)。A:阳性对照:无感染性的对照RNA。B:细胞对照:使用未接种病毒的细胞悬液,最好使用与扩增病毒所用的细胞类型与代数相同的细胞。每一次实验设2个细胞对照。C:试剂对照:用去离子水代替标本。(3)RT-PCR扩增1)在冰面上融化病毒标本和各种PCR试剂;2)配下列试剂主溶液:10×PCRBuffer···································································5.0μldNTPs(2.5mMeach)·······················································2.0μl上游引物(0.1μg/μl)·························································1.0μl下游引物(0.1μg/μl)·························································1.0μlRNA酶抑制剂(RNasin,40U/μl)······································0.5μlTaqDNA聚合酶(5U/μl)·················································0.5μlAMV逆转录酶(10U/μl)··················································1.0μl模板RNA··········································································3.0μlRNaseFreedH2O···························································36.0μl50.0μl3)在PCR仪上进行RT-PCR反应,反应步骤如下:42℃························45min95℃························3min95℃························20s45℃························25s×32个循环72℃························30s72℃························10min4℃························Soak3．电泳分析1)将已经聚合的3%的琼脂糖凝胶放在电泳装置上;2)在帕拉膜(Parafilm)上加上6×电泳载样缓冲液(每个反应需1μl)。再加上5μl的PCR反应产物与之混合;3)将电泳缓冲液倒在电泳装置中,用吸尖将样品与载样缓冲液的混合溶液加到孔中;4)盖上盖子,接通电源,以10V/cm电压(恒定电压)电泳,大约35~40min,直到溴酚蓝跑到凝胶的底部的时候,停止电泳;5)将胶取出,并注意保持凝胶的方向;6)在1μg/ml的溴化乙锭溶液中染色15min,——注意:溴化乙锭溶液是有毒、致畸、而且致肿瘤的物质,操作时要加小心,并戴双层手套。如果储存在避光的容器中,溴化乙锭溶液能够重复使用;7)在蒸馏水中涮一下凝胶;8)在紫外透射仪下观察PCR产物电泳结果,并照相作记录。4．结果解释经过比较标本的PCR产物与阳性对照的PCR产物在凝胶上的位置以及大小来解释结果。RT-PCR实验结果解释表待检标本RT-PCR结果鉴定结果所有引物(－)非肠道病毒(NEV)EV(＋),EV71(－),CA16(－)非EV71、CA16的其它肠道病毒EV(＋),EV71(＋),CA16(－)EV71EV(＋),EV71(－),CA16(＋)CA16五、生物安全根据1月11日卫生部制订的《人间传染的病原微生物名录》,柯萨奇病毒、埃可病毒、肠道病毒71型和当前分类未定的其它肠道病毒均属于危害程度第三类的病原微生物。因此在保证安全的前提下,对临床和现场的未知样本检测操作可在生物安全II级或以上防护级别的实验室进行,涉及病毒分离培养的操作,应加强个体防护和环境保护。操作粪便、脑脊液和血液等临床标本时要特别注意生物安全,要在II级生物安全柜中进行标本处理、病毒分离和病毒鉴定,无脊灰疫苗免疫史的人员要进行脊灰疫苗免疫。灭活后的血清抗体检测与PCR检测可在生物安全I级实验室进行。所有操作应遵守国家相关法律法规。附件4手足口病个案调查表编号:调查单位:__________________________(按照国家标准编码:省编码＋市编码＋县编码＋病例序号)一、一般情况患者姓名性别出生日期年月日(阴/阳历)职业工作单位(就读学校或托幼机构)家长姓名家庭住址市乡(镇、街办)村(居)号家庭电话:二、发病及就诊情况1、发病日期年月日2、初诊日期年月日;初诊单位(省级/市级/县级/乡级/村级)初步诊断:_______________________________3、住院治疗(是/否),如住院,则:所住医院____________________,入院日期年月日,入院诊断,出院日期年月日,出院诊断,病程天。4、预后:痊愈/好转/未愈/死亡/其它;后遗症(有,;无)三、临床情况(一)临床症状如有请打”√”1、发热(有,℃/无);2、皮疹(有,主要部位:/无)3、口腔炎:口腔粘膜上出现红色溃疡型疱疹是□否□4、呼吸系统:流涕□咳嗽□咽痛□其它:__________________________消化系统:恶心□呕吐□腹痛□腹泻□其它:_______________神经系统:头痛□喷射状呕吐□精神异常□嗜睡□意识障碍□昏迷□惊厥□心血管系统:心律失常:有□无□(二)体征1、颈项强直:有□无□;巴氏症:有□无□;克氏症:有□无□;布氏症:有□无□2、腱反射:正常□亢进□减弱□;肌张力:正常□亢进□减弱□(三)辅助检查1、血象:有,无。有则:WBC(×104/L),N(%),L(%)2、脑脊液:压力(Pa),外观(正常/异常),细胞记数(个),蛋白()糖含量()3、X线检查结果:有□,表现为,无□4、心肌酶谱:肌钙蛋白酶肌红蛋白酶(四)合并症及并发症合并症:有□,无□;并发症:有□,无□四、流行病学资料(一)患者接触史(填写病例发病6天前与手足口病、病脑、病毒心肌炎的接触史):无□;有□:填写