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辰山植物园在荷花花蕾转录组分析研究中获进展

  11月7日,上海辰山植物园(中国科学院上海辰山植物科学研究中心)“观赏植物资源与创新利用研究组”(田代科研究员组)张微微博士等在国际学术期刊PLoS ONE 上在线发表荷花花蕾转录组分析及SSR标记开发相关研究论文Characterization of Flower-Bud Transcriptome and Development of Genic SSR Markers in Asian Lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.)。

  荷花作为中国十大名花之一,全身都是宝,集观赏、食用和药用价值于一身,具有很高的经济价值。目前全球荷花品种已达2000个,花型多样,但花色较为单一,缺乏蓝色、紫色、深黄色品种,复色、香气浓郁、高产莲子等重要观赏和经济性状的品种也还很少。由于荷花品种基因组杂合度较高、遗传背景复杂,导致其重要性状的分子生物学研究相对滞后。研究组通过对3个荷花品种花蕾进行转录组测序和数据分析,以期挖掘出与花器官发育(花色、花型、开花时间等)相关的功能基因及转录调控因子,为阐明荷花重要观赏性状形成的分子机理奠定了基础。

  研究组依据转录组测序获得的大量序列信息,成功开发了3,059个genic-SSRs标记,这些标记的释放将大大促进荷花遗传多样性分析、遗传图谱构建、基因图位克隆、分子辅助育种等研究进程。

  该项研究得到上海市绿化和市容管理局科技攻关项目(F112421)经费资助。

  论文链接 

 

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