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如何让你的科研示意图锦上添花?

最近在文献中看到一个好看TME信号转导示意图,如下:

Fig1(Nat Commun,2023)

Fig2(Nat Commun,2023)

仔细观察,发现绘制起来不算难,主要通过将不同类型的细胞可视化+不同背景色块组合叠加,从而让原本的示意图观感更加丰富,做到了锦上添花。这样的方式也可作为日常示意图美化的学习参考。

今天我们就以Fig1为例进行复现,主要学习不同类型细胞的绘制技巧以及如何添加背景色块。话不多说,下面进入正题!

绘图软件:Adobe Illustrator 2021

PART01

配体和受体素材绘制

打开AI,菜单栏文件—新建一张合适尺寸的画板。首先我们绘制配受体素材,这里正圆和月亮代表配体和成对的受体。选择椭圆工具,鼠标拖拽的同时按住Shift键绘制正圆。月亮则需要先绘制两个部分重叠的正圆,如下图所示:

选择工具同时选中两个正圆,点击路径查找器—减去顶层,即可将两个圆创建为一个复合形状,并将顶层的图案从形状区域中减去。如果大家找不到路径查找器,可从菜单栏—窗口中找到,或直接快捷键Shift+Ctrl+F9调出。

素材绘制完成可以先放到一边待用,最后需要时拖拽到对应位置,缩放和修改颜色即可。

PART02

不同类型细胞的绘制

下面我们从简单到复杂,逐一为大家讲解常见的各类细胞是如何绘制的。

1.T细胞和B细胞

椭圆工具绘制一大一小两个圆,按需自定椭圆或正圆,最后给不同的细胞赋予不同的填充和描边颜色进行区分即可。

2.PSC

同样,先使用椭圆工具绘制稍扁平的椭圆,切换到直接选择工具,选中椭圆路径上左右两侧的锚点,随后在上方属性调整栏中点击‘将所选锚点转换为尖角’,即可将椭圆转换为梭形。

使用直接选择工具分别选中左右两端的锚点,向下和向上拖拽,再赋予不同的描边和填充颜色进行区分,即可完成该类梭形细胞的绘制。

3.Endothelium

首先,椭圆工具绘制椭圆,工具栏中找到添加锚点工具,在绘制好的椭圆路径上单击两下增加新的锚点,具体位置见下图。

切换到直接选择工具,选中新增的锚点往下拖拽,椭圆下方中心处的锚点选中向上拖拽,形成一个小山状,如下图:

最后再绘制细胞核并进行颜色填充即可。上皮细胞画法类似,更多细节可戳往期:《七大类上皮组织细胞画法一次全hold住!》

4.CAF等不规则形状细胞

最后,涉及到一些边缘较为不规则的特殊形态细胞,我们一般会选择使用铅笔或钢笔工具完成绘图。这里我们以铅笔工具为例。

双击铅笔工具,在工具选项中将保真度调整到最右侧平滑处,然后鼠标长按直接鼠绘。如果大家觉得鼠绘效果不理想,可以选择导入细胞参考照片,或者自己手绘后,将照片导入进行描摹,会更加得心应手。绘制后如果觉得线条还不够平滑流畅,可切换到平滑工具,在路径不平滑处反复涂抹使之达到满意的平整程度。

外轮廓绘制完成后,剩下操作就和前文一致,即绘制细胞核与颜色填充。

其它不规则细胞的画法类似,难点都在于不规则外轮廓,大家可多多尝试,篇幅原因这里不再赘述,更多可戳往期:《如何绘制Nature同款含不同细胞的示意图?》

PART03

排版与美化

所需要的各类素材(配受体和不同类型细胞)绘制完毕,剩下的就是基于背景知识,完成排版和图表的美化啦。使用文字工具添加文本内容,使用钢笔工具绘制折线段(绘制时长按Shift键可辅助绘制水平垂直折线段),将前文绘制好的细胞缩放到合适大小后,放置到对应位置。

PS:这里建议大家把自己的原始互作网络图素材或手绘稿直接导入进行描摹,会更加高效。

使用矩形工具为细胞和通路添加背景底色块,绘制完成后,选中色块,鼠标右击—排列—置于底层,将色层置于图层的底端。

继续根据背景知识,使用圆角矩形工具添加背景大色块,并将其置于底层。将绘制的配受体图形缩放并放置到对应位置,如下:

更改连接线段和配受体的颜色:

最终效果:

好啦,今日分享毕!

参考文献

Oh, K., Yoo, Y.J., Torre-Healy, L.A. et al. Coordinated single-cell tumor microenvironment dynamics reinforce pancreatic cancer subtype. Nat Commun 14, 5226 (2023).

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