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探案丨超级细菌的克星来了

原创 武渊 李娜等 SIFIC感染视界 

作者:武渊 李娜 金文婷 马玉燕

审阅:胡必杰 潘珏

一、病史简介

男性,63岁,上海人,2022-11-23第2次入中山医院感染病科。

主诉:留置导尿伴反复尿色浑浊2月,再发8天。

现病史:

2022-09-19 因乏力纳差、排尿困难就诊上海某医院,查WBC 10.12X10^9/L,N 87.6%, Hb 53g/L,hsCRP 135.22mg/L,ESR 62mm/H,白蛋白 30.1g/L,Scr 589μmol/L,K 2.1mmol/L;尿常规:WBC 3892/ul,隐血3+/RBC 5579/ul,蛋白2+;胸部CT:双侧胸腔积液,双肺下叶部分膨胀不全;腹盆CT:双侧输尿管中上段扩张及肾盂肾盏扩张,右侧部分肾盏内斑片稍高密度影,膀胱壁增厚,左肾周脂肪囊、回盲部周围少许絮状模糊影,盆腔少许积液。予留置导尿,引流出大量浑浊尿液,尿培养:肺炎克雷伯菌阳性,考虑尿路感染、急性肾损伤、低钾血症、重度贫血,予抗感染、膀胱冲洗、抗氧化、补钾、输血等对症支持治疗,患者症状好转,尿液稍澄清。10-18复查尿常规:WBC3+、RBC3+、蛋白1+,Scr 263μmol/L。

2022-10-19 收治我科,血常规:WBC 5.08X10^9/L,N 66.1%,炎症标志物:ESR 19mm/H,hsCRP 52.3mg/L,PCT 0.52ng/ml,Scr 257μmol/L,尿常规:WBC 28493/μl,RBC 177/μl,细菌计数 88853/μl;泌尿系彩超:双肾积水,双侧输尿管扩张,膀胱壁显著增厚;腹盆CT:两侧肾盂肾脏及输尿管扩张积水,输尿管管壁增厚(炎症改变),膀胱及两输尿管炎症改变可能大,两肾体积增大,实质菲薄。予美罗培南1g q12h经验性抗感染,泌尿外科会诊考虑感染急性期,不宜置入双J管,必要时可肾盂穿刺造瘘,但对肾功能改善不大,建议膀胱冲洗。10-20中段尿培养(10-19采样):肺炎克雷伯菌阳性,10-22尿培养药敏:碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP),调整为头孢他啶阿维巴坦2.5g q12h抗感染,每日膀胱冲洗。治疗后患者尿色逐渐变清,随访尿白细胞及细菌计数逐渐减少,11-01、11-04尿细菌培养均为阴性。11-09复查尿常规:WBC 28/uL,RBC 4/uL,尿蛋白+,细菌计数 29/ul;血WBC 7.64X10^9/L,N 76.5%,hs-CRP 0.4mg/L,ESR 25mm/H,PCT 0.18ng/mL,Scr 175μmol/L,较入院时明显改善。11-11停头孢他啶阿维巴坦,予以出院。

2022-11-15 患者再次出现尿色浑浊,无发热等其他不适,11-23为再次诊治收入院。

既往史:1991年9月因高坠伤致T12-L1粉碎性骨折行内固定手术,术后因尿失禁留置导尿管半年,后恢复自主排尿拔除导尿管,期间无尿路感染发作。糖尿病16年,胰岛素治疗,血糖控制可;高血压5年,口服氨氯地平降压,血压控制可。

二、入院检查( 2022-11-23入院)

【体格检查】

T:36.2℃ P:90次/分 R:20次/分 BP:176/105mmHg

卧床,神清气平,体型消瘦,下肢肌肉萎缩;双肺呼吸音粗,未闻及干湿啰音;心律齐,腹软,无压痛及反跳痛,未及包块,双肾区无叩击痛,输尿管点、肋脊肋腰点无压痛,下腹部未触及增大膀胱。留置导尿中,集尿袋中尿液浑浊,较多白色絮状物沉积。四肢不肿。

【实验室检查】

血常规:WBC 7.85X10^9/L,N 81.3%,Hb:121g/L,PLT:170X10^9/L

尿常规:WBC 2775/μl;RBC 2/μl,细菌计数:39879/μl,亚硝酸盐阳性,白细胞酯酶+++

炎症标志物:hs-CRP 17.9mg/L,ESR 68mm/H,PCT 0.12ng/mL

生化:ALT/AST 23/21U/L,Alb 47g/L,Scr 199μmol/L,eGFR 30ml/min/1.73m2,Na/K 140/5.5mmol/L

三、临床分析

病史特点:中老年男性,留置导尿管,反复尿色浑浊、尿常规异常,1月前尿培养示CRKP,头孢他啶阿维巴坦治疗后好转,但停药3天后再次出现尿色浑浊,血炎症指标升高,尿白细胞及细菌计数明显升高,患者尿路感染诊断明确,抗菌药物治疗好转后短期复发原因考虑:

CRKP感染再发:患者留置导尿2月,可能存在导尿管生物膜形成,同时存在尿路结构异常,导致感染不易完全清除、停药后复发,可完善尿培养及药敏试验明确。

新发感染:患者存在反复尿路感染高危因素,可能每次感染病原体不同,患者前次CRKP感染治疗有效,短期内再发应考虑新病原体感染可能,待完善尿培养明确。

多重感染:患者尿路结构异常、留置导尿等危险因素不能去除,需警惕包括真菌等多种病原体合并感染可能,可重复尿细菌、支原体、真菌及分枝杆菌培养,完善尿mNGS协助明确感染病原体。

四、进一步检查、诊治过程和治疗反应

2022-11-23 中段尿涂片找细菌:中量G-杆菌,继续头孢他啶阿维巴坦2.5g q12h ivgtt抗感染,膀胱冲洗。

2022-11-26 中段尿培养(11-23采样)细菌药敏:CRKP,≥10万/ml,尿mNGS:检出大量肺炎克雷伯菌(种严格序列数 406866)。

2022-11-29 复查腹盆CT:两侧泌尿系统扩张积水伴输尿管炎性改变,两肾实质菲薄,膀胱炎性改变可能大,较22-10-20片相仿。

2022-11-30(11-29采样):粪肠球菌阳性,12-02根据药敏加用磷霉素3g qod口服,暂停头孢他啶阿维巴坦。

2022-12-03、12-04、12-06 多次尿培养:粪肠球菌阳性,CRKP阴性。

2022-12-08 复查尿WBC 38738/μl,细菌计数 43285/μl;尿培养:CRKP阳性,粪肠球菌阴性。

2022-12-08 下午起行噬菌体治疗:噬菌体鸡尾酒(由5株肺炎克雷伯菌噬菌体A103KP172、A106KP176、A121KP192、A49KP106、A58KP118各5mL混合),注入225mL生理盐水(依据估算膀胱容量),总容积250mL经导尿管膀胱灌注,后夹管30min,每日两次,间隔12小时,治疗后第1、3、5天送尿常规、尿培养及药敏试验。

2022-12-11 噬菌体治疗第3日尿常规:白细胞计数:235/uL,细菌计数:722/uL;尿细菌培养阴性。

2022-12-13 噬菌体治疗第5日尿常规:白细胞计数:279/uL,细菌计数:92/uL;尿细菌培养阴性;血WBC 6.35X109/L,N 70%, hs-CRP 0.9mg/L,ESR 26mm/H,炎症指标较前下降;复查泌尿系彩超示:双侧肾盂分离及上段输尿管扩张较前(10-20)有所好转,膀胱壁厚度有所减小(12-25mm→13mm)。

2022-12-14 予出院随访。

五、最后诊断与诊断依据

最后诊断:

复杂性尿路感染(CRKP、粪肠球菌)

神经源性膀胱、肾盂积水、输尿管积水(导尿管留置)

肾功能不全

诊断依据:

患者中老年男性,外伤截瘫致神经源性膀胱,留置导尿管,尿液浑浊伴有絮状物,CRP、PCT升高,尿WBC、细菌计数明显升高,尿培养反复多次CRKP阳性、粪肠球菌阳性,腹盆CT:双肾肾盂、输尿管扩张积水,抗感染、噬菌体治疗后炎症标志物、尿常规恢复正常,尿液变清,尿培养转阴,故复杂性尿路感染、神经源性膀胱、肾盂积水、输尿管积水诊断明确。

患者纳差乏力、排尿困难起病,血肌酐明显升高,腹部CT:双肾增大、皮质菲薄,两侧尿路积水,经积极控制感染、改善肾功能等治疗后血肌酐下降,故肾功能不全诊断明确。

六、经验与体会

噬菌体是自然界中靶向杀菌的病毒,“前抗生素时代”的杀菌明星。噬菌体疗法已逾百年历史,但广谱抗生素的发现和应用使其逐渐边缘化,随着细菌耐药问题日益严峻,噬菌再次获得重视,成为治疗超级细菌最有希望的补充和替代疗法。我国噬菌体临床应用开展相对较晚,但近年来发展迅速。2017年成立了上海噬菌体与耐药研究所,我科胡必杰教授任学术委员,2018年起该所开展了国内首个噬菌体治疗临床试验,目前已治疗来自全国各地的近百例耐药细菌感染患者,积累了丰富的噬菌体治疗临床经验,在国内临床噬菌体治疗领域属于领先地位。

噬菌体具有宿主菌依赖性、靶向特异杀菌、不感染真核细胞(对正常菌群影响小),同时不受细菌耐药影响,可与抗菌药物协同、能穿透生物膜等多种优点。对于急性细菌感染治愈率高,对慢性细菌感染治疗效果不亚于抗菌药物,而且噬菌体治疗安全性也极高。一项系统回顾研究表明,绝大多数接受噬菌体治疗者无或仅有轻微不良反应,86.7%的患者临床症状改善,78.8%的患者实现病原细菌清除。我们开展的临床试验也表明超70%的患者获得了较好的治疗效果,无明显不良反应案例。本例患者长期截瘫、尿路结构异常、留置导尿等多种因素,反复感染肺炎克雷伯菌,复杂性尿路感染确诊无疑,且因多重耐药、肾功能不全导致抗菌药物选择受限,采用噬菌体治疗是非常合适的。

噬菌体治疗的缺点包括宿主谱窄、需个性化制定方案(难以经验性治疗)、治疗最佳决策无统一标准、快速发生耐受等,临床通常采用噬菌体鸡尾酒、联合抗菌药物、多次治疗等方式以提高疗效。目前我们团队开展噬菌体治疗的靶向病原体主要包括:多重耐药的革兰阴性菌(肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌)、革兰阳性菌(金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌);涵盖呼吸系统、泌尿系统、腹腔、骨及关节、皮肤软组织等多种感染部位;治疗方式依据感染部位不同,静脉应用噬菌体的治疗方式尚在探索。本例患者因综合考虑临床获益不大未行经皮肾造瘘,故而采用经尿道膀胱灌注治疗,噬菌体不能均匀覆盖全尿路,虽短期内取得较好的病原学转阴结果,且耐受性良好,但其长期疗效可能不佳,需要反复、多次噬菌体治疗。

噬菌体治疗具有巨大的临床需求和广阔市场,我们团队近年来着重噬菌体治疗的临床应用(治疗及院感防控)及基础研究,以期未来不断成熟的噬菌体治疗技术成为遏制耐药菌的强大武器。

参考文献

[1] Uyttebroek S, Chen B, Onsea J, Ruythooren F, Debaveye Y, Devolder D, Spriet I, Depypere M, Wagemans J, Lavigne R, Pirnay JP, Merabishvili M, De Munter P, Peetermans WE, Dupont L, Van Gerven L, Metsemakers WJ. Safety and efficacy of phage therapy in difficult-to-treat infections: a systematic review. Lancet Infect Dis. 2022 Aug;22(8):e208-e220.

[2] Chegini Z, Khoshbayan A, Taati Moghadam M, Farahani I, Jazireian P, Shariati A. Bacteriophage therapy against Pseudomonas aeruginosa biofilms: a review. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2020 Sep 30;19(1):45.

[3] Lusiak-Szelachowska M, Weber-Dabrowska B, Gorski A. Bacteriophages and Lysins in Biofilm Control[J]. Virol Sin, 2020,35(2):125-133.

每周一晚

上海复旦大学附属中山医院感染病科与你不见不散!

图文:小小

原标题:《探案丨超级细菌的克星来了》

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