广西农业科学院迄今最连续的茄子基因组序列
广西农业科学院迄今最连续的茄子基因组序列
广西农业科学院茄属植物茄科植物蔬菜研究所基因组序列组装技术基因组研究基因组测序
摘要：2019年10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所王益奎研究员领衔的研究团队,于BioRxiv在线了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该基因组采用了当下最先进的基因组测序与组装技术,堪称茄科植物中最连续的基因组,标志着茄子基因组研究迈入了高清时代。茄子(Solanum melongena L.)是茄科最重要的作物之一,在茄属植物中产量和经济价值居第三位。本次公布的茄子参考基因组,Contig N50达到了5.3 Mb,Scaffold N50更是达到了93.9 Mb,序列总长度1155.8 Mb,是迄今最连续的茄子基因组。研究团队采用PacBio测序技术,结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法,成功获得了染色体级别的连续基因组,将对茄子的基因组学研究产生深远的影响。
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