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鉴定榕树的分子标记。基于韩国无花果(Ficus L.,桑科)的完整质体序列,Diversity

质体序列在植物研究中至关重要,因为它们在检查基因组进化、理解系统发育关系和开发分子标记方面发挥着重要作用。尽管收集了有关韩国无花果的信息,但其基因组数据仍未得到充分探索。我们利用下一代测序和 PCR 技术来研究基因组数据并开发和验证分子标记。在这项研究中,我们描述了韩国无花果的完整质体:F.ectera、F.ectera var。sieboldii, F. sarmentosa var. 变种 nipponica 和 F. sarmentosa var. thunbergii,长度范围为 160,276 至 160,603 bp。这些基因组包含 78 个质体蛋白编码基因、30 个 tRNA 和 4 个 rRNA,但 1 个假基因 infA 除外。我们发现了 F.直立和 F.直立变种。sieboldii 具有相同的质体序列。系统发育基因组分析表明榕树属单系,但其亚属之间的关系仍不清楚。我们发现,与其他桑科类群相比,榕属植物的质体蛋白编码基因具有 467 个分子诊断特征,而榕树则具有 33 个分子诊断特征。ndhD、petA 和 rbcL 中的单核苷酸多态性被有效地用于开发分子标记,以区分 F.直立无花果和其他无花果。此外,我们还提供了一个简单的 PCR 方案来利用这些新开发的分子标记。

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