基因组重测序揭示大蒜繁殖性状的进化史,Horticulture Research
基因组重测序揭示大蒜繁殖性状的进化史
Horticulture Research ( IF 8.5 ) Pub Date : 2023-10-17 , DOI: 10.1093/hr/uhad208
Haiping Wang , Einat Shemesh-Mayer , Jiangjiang Zhang , Song Gao , Zheng Zeng , Zemao Yang , Xueyu Zhang , Huixia Jia , Yanzhou Wang , Jiangping Song , Xiaohui Zhang , Wenlong Yang , Qiaoyun He , Amir Sherman , Lin Li , Rina Kamenetsky , Touming Liu
栽培大蒜的繁殖依赖于丁香，因此花对于该物种的繁殖来说不再是必需的，从而推动了生殖特征衍生性状的进化。为了深入了解克隆繁殖的大蒜繁殖性状的进化改变，通过基因组分析探索了两个主要繁殖相关性状（大蒜抽苔和花分化）的进化历史，使用了 134 个在这两个性状上表现出广泛多样性的材料。重新测序发现了大蒜基因组中的 2.728 亿个变异，其中 1.980 亿个变异代表了新的变异。种群分析确定了五个大蒜类群，这些类群已进化为两个分支。基因表达、单细胞 RNA 测序和全基因组性状关联分析已经确定了许多与生殖转变和花发育相关的候选基因，其中一些显示出独特的选择特征。作用于B盒锌指蛋白编码Asa2G00291.1、全局转录因子E组蛋白编码Asa5G01527.1和春化不敏感3样Asa3G03399.1的选择性力似乎代表了大蒜抽苔的进化。大量新的基因组变异和性状相关候选者代表了大蒜生物学研究的宝贵资源。与两种选定的繁殖性状相关的基因的许多选择性特征为了解这种克隆繁殖作物的繁殖进化史提供了重要的见解。
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更新日期：2023-10-17
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