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原创 
于 2023-02-03 23:37:50 发布 · 1.2w 阅读
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UpSet是一种用于数据集交集可视化的方法，尤其适合于显示多个集合间的复杂关系。相比Venn图，UpSet能更直观地比较交叉点数量，并通过柱状图排序和矩阵表示提供更多信息。在R中，可以使用UpSetR包来创建UpSet图形，如文中所示，通过示例展示了如何利用R绘制UpSet图来分析基因突变数据集。
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将几个数据集之间的交集进行可视化，除了可以利用Venn图外，还可以使用upset这种图形。这种方法是发表在2014年nature methods上面。Sets and intersections | Nature Methods
upset图形大致是这个样子
那怎么观察这种图形，或者图形的意义是什么？
例如下图对这一部分进行了展示
这是UpSet图和Venn图之间的联系
这种图的好处在于，我们可以在矩阵旁边以柱状图的形式绘制交叉点的大小，正如下面的例子中看到
这样可以对交叉点的数量进行直观比较，也可以存储更多的信息。
并且，也可以通过交叉点的数量，来对柱状图进行排序
然后将图形按照水平或者竖直方式进行排列即可。大部分文章当中都是用的水
生信小鹏 西安交通大学在读博士，专注于生物信息学数
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网址: 科研绘图——upset展示更复杂的交集情况 https://m.huajiangbk.com/newsview2500207.html
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