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分子标记辅助选择育种剖析.pdf

第十七章 分子标记辅助选择育种 传统的育种主要依赖于植株的表现型选择 (Phenotypieal selection)。环 境条件、基因间互作、基因型与环境互作等多种因素会影响表型选择效 率。例如抗病性的鉴定就受发病的条件、植株生理状况、评价标准等影 响;品质、产量等数量性状的选择、鉴定工作更困难。一个优良品种的 培育往往需花费 7~8 年甚至十几年时间。如何提高选择效率,是育种 工作的关键。 育种家在长期的育种实践中不断探索运用遗传标记来提高育种的选 择效率与育种预见性。遗传标记包括形态学标记、细胞学标记、生化标 记与分子标记。棉花的芽黄、番茄的叶型、抗 TMV 的矮黄标记、水稻 的紫色叶鞘等形态性状标记,在育种工作中曾得到一定的应用。以非整 倍体、缺失、倒位、易位等染色体数目、 结构变异为基础的细胞学标记, 在小麦等作物的基因定位、连锁图谱构建、染色体工程以及外缘基因鉴 定中起到重要的作用,但许多作物难以获得这类标记。生化标记主要是 利用基因的表达产物如同工酶与贮藏蛋白, 在一定程度上反映基因型差 异。它们在小麦、玉米等作物遗传育种中得到应用。 但是它们多态性低, 且受植株发育阶段与环境条件及温度、电泳条件等影响,难以满足遗传 育种工作需要。以 DNA 多态性为基础的分子标记,目前已在作物遗传 图谱构建、重要农艺性状基因的标记定位、种质资源的遗传多样性分析 与品种指纹图谱及纯度鉴定等方面得到广泛应用, 尤其是分子标记辅助 选择 (molecular marker-as—sisted selection,MAS) 育种更受到人们的重视。 第一节 分子标记的类型和作用原理 一、分子标记的类型和特点 按技术特性,分子标记可分为三大类。第一类是以分子杂交为基础的 DNA 标记技术, 主要有限制性片段长度多态性标记 (Restriction fragment length polymorphisms,RFLP 标记 );第二类是以聚合酶链式反应 (Polymerase chain reaction,PCR 反应 )为基础的各种 DNA 指纹技术。PCR 是 Mullis 等(1985)首创的在模板 DNA 、引物和 4 种脱氧核糖核苷酸存在 的条件下,依赖于 DNA 聚合酶的体外酶促反应,合成特异 DNA 片段 的一种方法。 PCR 技术的特异性取决于引物与模板 DNA 的特异结合。 PCR 反应分变性 (denaturation)、复性 (annealling)、延伸 (exten—sion)三步 ( 图 17— 1)。变性指的是通过加热使 DNA 双螺旋的氢键断裂, 双链解离 形成单链 DNA 的过程;复性 (又称退火 )是指当温度降低时,单链 DNA 回复形成双链的过程,由于模板分子结构较引物要复杂得多,而且反应 体系中引物 DNA 大大高于模板 DNA ,容易使引物和其互补的模板在局 部形成杂交链;延伸是指在 DNA 聚合酶和 4 种脱氧核糖核苷三磷酸底 物及 Mg2+ 存在的条件下, 在聚合酶催化下进行以引物为起始点的 5 -3 的 DNA 链延伸。以上三步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一 个循环的模板, 经 25~30 个循环后, 介于两个引物之间的特异 DNA 片 段得到大量的复制,数量可达 2 ×106-7 拷贝。按照 PCR 所需引物类型又

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