华大基因发布“千种动植物基因组计划” 最新研究成果
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2011年7月11日，由华大基因举办的“2011国际‘千种动植物基因组计划’二期成果发布会”在深圳大梅沙京基海湾大酒店隆重召开。该计划于2010年1月正式启动，旨在构建一个全球最大的动植物基因组数据库，为各物种的进一步研究奠定基础，同时为育种及医学相关应用提供指导。
2011年7月11日，由华大基因举办的“2011国际‘千种动植物基因组计划’二期成果发布会”在深圳大梅沙京基海湾大酒店隆重召开。该计划于2010年1月正式启动，旨在构建一个全球最大的动植物基因组数据库，为各物种的进一步研究奠定基础，同时为育种及医学相关应用提供指导。来自美国国立癌症研究院、马来西亚大学、格里菲斯大学、韩国首尔大学、荷兰Keygene N.V.研究所、美国国立生物技术信息中心（NCBI）、中山大学等全球知名科研院所的近百位专家学者参加了本次会议。
上午九点整，会议在华大基因市场部总监杨碧澄的主持下正式开幕。美国国立健康研究院、国立肿瘤研究所基因组多样性实验室主任Stephen J. O'Brien博士和中国工程院院士、中山大学林浩然教授发表致辞。
华大基因“千种动植物基因组计划”负责人尹烨表示：“随着基因组学的迅速发展，越来越多的物种基因组被解码，基因组学正在改变着整个世界——每一个基因组，多一次改变”。在发言中，他特别介绍了华大基因与日本理化学研究所（Riken）、英国Ensembl等科研院所于今年5月份启动的“中华鳖基因组项目”。他指出，“中华鳖是古老的水生爬行动物，在动物界占有独特的进化地位，具有重要的科学研究价值。目前该项目已完成前期的测序分析，下一步的工作重点将转向精细图谱构建和相关功能基因的深入分析。”据悉，这是世界上首次对淡水龟鳖目动物进行全基因组测序，对于研究龟鳖类动物结构基因组、功能基因组具有重要意义。此外，“华大基因即将启动狒狒基因组计划，该计划是第一个通过公共募捐的方式进行的基因组计划，我们相信在公众的支持下将会更多物种的基因组研究项目开展。”尹烨补充说。
华大基因的杨碧澄博士为大家介绍了“千种动植物基因组计划”取得的丰硕成果及其所带来的新的机遇。她指出，“到目前为止，华大基因及其合作伙伴共启动了505种动植物基因组测序项目，其中，植物基因组项目有152个，动物基因组项目有353个。水稻、熊猫、黄瓜、家蚕及蚂蚁的基因组研究成果分别已在《科学》和《自然》系列杂志上发表，而牡蛎、半滑舌鳎、阿拉伯骆驼、石斑鱼、朱鹮、浙东白鹅等物种的测序工作已经完成。众多动植物基因组项目的完成，将为生物多样性、动植物进化机制、分子育种研究等，建立丰富的遗传信息数据库，为全球动植物研究者提供前所未有的基础资源。”杨博士还指出，“千种动植物计划”的相关进展，包括目前正在进行测序的物种以及待启动测序计划的物种的详细信息可以在其网站www.ldl.genomics.cn上查询。
美国国立健康研究院、国立肿瘤研究所基因组多样性实验室主任Stephen J. O'Brien博士结合哺乳动物比较基因组学研究前景介绍了“万种脊椎动物基因组计划（G10K）”的详细情况。Stephen J. O'Brien博士说：“目前为止30多种哺乳动物的测序工作已经完成，从鸭嘴兽到大熊猫到人以及“万种脊椎动物”等基因组项目与计划，将会为动物学家提供丰富、有价值的资源。”
随后，与会专家学者们也围绕“动植物基因组最新研究进展”分享了一系列精彩报告。主要包括“基因组组装数据的管理”、“小菜蛾转录组从头组装测序研究揭示其抗药性机制”、“人参的基因组测序研究”和“芦笋基因组学研究”等等。与会专家表示，“千种动植物基因组计划”自启动以来，取得了丰硕的成果，完成了多种重要动植物物种的基因组测序，也逐渐吸引了更多国内外科学家的加入，该项目为全球动植物研究领域的研究者提供了一个良好的合作与交流平台，极大地推动了国际范围内的科学发现进程，加快了相关科研应用的发展。
据悉，自2010年5月“千种动植物基因组计划”一期成果发布会以来，华大基因还参加了“芦笋基因组计划”、“万种脊椎动物基因组计划”等。对于“万种脊椎动物基因组计划”，华大基因主要选择并启动了101种新物种的测序工作。在于2011年6月30日召开的“2011国际社会性昆虫基因组会议”上，深圳华大基因研究院比较基因组研究中心负责人张国捷博士曾指出华大基因目前正在筹划启动“百种社会性昆虫基因组计划”。
此外，在7月6日的“生物信息软件发布会”上，华大基因还发布了可免费下载使用的最新版本的从头组装软件SOAPdenovo2，其为SOAPdenovo软件的升级版，在性能和适应性方面均有较大提高，能够更高效的支持动植物基因组序列的组装应用。SOAPdenovo2的推出也将为推动“千种动植物基因组”的解码进程发挥重要的作用。
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