基于全球人类肠道微生物组的细菌胆汁盐水解酶(BSH)基因的分类学分析和种群模式。
Microbiome ( IF 13.8 ) Pub Date : 2019-01-25 , DOI: 10.1186/s40168-019-0628-3
Ziwei Song 1 , Yuanyuan Cai 1, 2 , Xingzhen Lao 1 , Xue Wang 1 , Xiaoxuan Lin 1 , Yingyun Cui 1 , Praveen Kumar Kalavagunta 1 , Jun Liao 2 , Liang Jin 1, 2 , Jing Shang 1, 2 , Jing Li 1
背景技术胆汁盐水解酶在胆汁酸介导的信号传导途径中起重要作用,其调节脂质吸收,葡萄糖代谢和能量稳态。几份报告表明,在由菌群失调引起的许多疾病中均发现了胆汁酸成分的变化。结果在这里,我们介绍了人类微生物群中胆盐水解酶(BSH)的分类学鉴定,并阐明了来自六大洲的11个不同人群中各种细菌BSH的丰度和活性差异。首次,我们揭示了胆盐水解酶蛋白序列(BSHs)分布在人类微生物群中117属的591肠道细菌菌株中,其中27.52%的细菌菌株含有BSH旁系同源物。在不同人群之间,BSH分布模式存在显着差异。基于系统发育分析,我们将这些BSH重新分类为8种系统型,并研究了不同种群之间这些系统型的丰度模式。通过检查不同BSH系统型之间的酶活性,BSH-T3表现出最高的酶活性,仅在乳杆菌中发现。BSH-T5和BSH-T6的系统型主要来自具有较高旁系同源物比例的拟杆菌属,表现出不同的酶活性和去结合活性。此外,我们发现健康个体与动脉粥样硬化和糖尿病患者在某些系统型BSH上存在显着差异,尽管相关性是多效的。结论这项研究揭示了人肠道微生物组中BSH的分类和丰度图谱,并提供了一个基于系统发育的系统,通过将靶序列分类为特定系统型来评估BSH的活性。此外,目前的工作揭示了不同地理区域人群和健康/疾病人群中BSH的变异模式,这对于了解BSH在相关疾病的发展和进展中的作用至关重要。
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更新日期:2019-01-23
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