一种鉴定高产贵妃鸡种质资源的分子身份证及其应用
摘要： 本发明涉及一种鉴定高产贵妃鸡种质资源的分子身份证及其应用，所述分子身份证为鉴定高产贵妃鸡的特异性分子标记组合；所述分子标记组合包括表1中的SNP位点；所述SNP位点在鸡参考基因组GRCg6a(Ensemble release 104)的位置和突变类型见表1所示。本发明通过SNP分子标记对高产贵妃群体进行研究，筛选并构建高产贵妃鸡群体的分子身份证，可以简单地区分高产贵妃鸡群体和非高产贵妃鸡群体，为高产贵妃鸡的种质资源鉴定和保护提供科学有力的依据。在进行鸡鉴定评价时，只需要将待测鸡与已有的分子身份证比较分析，即可确定其是否为高产贵妃鸡，这不仅节约了品种鉴定的成本和时...
分类号：
C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6869(2018.01)C12N15/11(2006.01)C12Q1/6888C12Q1/6869C12N15/11
申请人地址：
450000 河南省郑州市金水区花园路116号
权利要求：
1.一种鉴定高产贵妃鸡种质资源的分子身份证，其特征在于：所述分子身份证为鉴定高产贵妃鸡的特异性分子标记组合；所述分子标记组合包括表1中的SNP位点；所述SNP位点在鸡参考基因组GRCg6a(Ensemble release 104)的位置和突变类型见表1所示。 表12.一种如权利要求1所述的分子身份证在鉴定高产贵妃鸡种质资源中的应用。 3.根据权利要求2所述的分子身份证在鉴定高产贵妃鸡种质资源中的应用，其特征在于：包括如下步骤： (1)对待测鸡样本进行全基因组重测序，获得原始数据； (2)将步骤(1)获得的原始数据与鸡参考基因组比对后得到待测鸡样本分子身份证上的SNP位点的基因型数据；所述鸡参考基因组的版本为GRCg6a(Ensemble release 104)； (3)将待测鸡样本分子身份证上的SNP位点的基因型数据与包含高产贵妃鸡群体的所述分子身份证上的SNP位点的基因型数据进行合并，进行主成分分析和系统进化树分析，以判断待测鸡样本是否为高产贵妃鸡种质资源。
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