家蚕茧丝产量性状差异品种的后部丝腺非编码RNA和转录组比较分析及蚕丝性能改良的研究

• 花匠小妙招
• 2024-11-12 12:48

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第1章 文献综述

1.1 家蚕丝腺的概述

1.1.1 家蚕丝腺发育和丝蛋白合成

1.1.2 家蚕丝腺生物反应器的应用

1.2 非编码RNA的由来

1.3 lncRNA的研究进展

1.3.1 lncRNA的发现

1.3.2 lncRNA的命名与分类

1.3.3 lncRNA的功能

1.3.4 家蚕lncRNA的研究现状

1.4 MicroRNA的研究进展

1.4.1 miRNA的发现

1.4.2 miRNA的命名

1.4.3 miRNA的生物合成

1.4.4 miRNA的作用机制

1.4.5 家蚕miRNA的研究现状

1.5 家蚕piggyBac转基因研究

1.6 蚕丝性能改良的研究进展

1.7 本研究的目的意义、研究内容和技术路线

1.7.1 研究目的和意义

1.7.2 研究内容

1.7.3 技术路线

第2章 家蚕后部丝腺转录组和lncRNA研究

2.1 引言

2.2 实验材料和方法

2.2.1 实验材料

2.2.2 实验方法

2.3 结果与分析

2.3.1 家蚕后部丝腺、蛹和蚕茧形态、重量差异统计分析

2.3.2 转录本组装和lncRNA鉴定

2.3.3 lncRNA的基因组特征

2.3.4差异表达基因/lncRNA分析

2.3.5 miRNA前体的分析

2.3.6 lncRNA顺式/反式调控功能的分析

2.3.7 差异表达基因GO和KEGG富集分析

2.3.8 差异表达lncRNA靶基因GO和KEGG富集分析

2.4 讨论

2.4.1 lncRNA和mRNA的表达谱

2.4.2 差异表达基因/lncRNA分析

2.4.3 差异表达基因/lncRNA靶基因GO和KEGG富集分析

2.5 结论

第3章 家蚕后部丝腺转录组和miRNA研究

3.1 引言

3.2 实验材料和方法

3.2.1 同2.2.1 所述。

3.2.2 实验方法

3.3 结果与分析

3.3.1 家蚕后部丝腺和蚕茧形态、重量差异统计分析

3.3.2 small RNA文库构建和高通量测序

3.3.3 测序结果分析

3.3.4 已知miRNA的鉴定

3.3.5 新miRNA的鉴定

3.3.6 差异表达的已知miRNA和新miRNA

3.3.7 序列变异和种子区碱基的编辑

3.3.8 miRNA靶基因预测

3.3.9 差异表达miRNA靶基因功能分析

3.3.10 差异表达miRNA靶基因的GO和KEGG富集分析

3.4 讨论

3.4.1 不同品种家蚕后部丝腺组织中miRNA的差异

3.4.2 已知miRNA的鉴定

3.4.3 新miRNA的预测

3.4.4 差异表达miRNA比较分析

3.4.5 miRNA靶基因及其功能分析

3.4.6 差异表达miRNA靶基因GO和KEGG富集分析

3.5 结论

第4章 piggyBac转基因技术介导的蚕丝机械性能改良的研究

4.1 引言

4.2 实验材料和仪器

4.2.1 实验蚕及饲养条件

4.2.2 试剂及配方

4.2.3 主要仪器与设备

4.3 实验方法

4.3.1 piggyBac表达元件的设计与合成

4.3.2蜘蛛丝Masp1基因32倍type1（32x type1）质粒构建

4.3.4连接轻链启动子序列

4.3.5 piggyBac表达载体构建

4.3.6 菌液PCR鉴定阳性克隆

4.3.7 piggyBac表达质粒和Helper辅助质粒纯化

4.3.8 显微注射及阳性蚕筛选

4.3.9 外源基因插入位点分析

4.3.10 外源基因mRNA表达水平检测

4.3.11 重组蛋白免疫印迹检测（Western Blot）

4.3.12 蚕丝和茧壳电镜扫描

4.3.13 傅立叶转换红外光谱

4.3.14 重组丝机械性能测定

4.4 结果与分析

4.4.1转基因质粒构建和转基因家蚕品系建立

4.4.2 基因组插入位点分析

4.4.3 外源基因表达检测

4.4.4 电镜观察和傅立叶转换红外光谱

4.4.5重组丝力学性能

4.5 讨论

4.6 结论

第5章 全文总结与研究展望

5.1 全文总结

5.2 特色与创新

5.3 不足与展望

参考文献

附录

个人简历

相关知识

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