向日葵苗期抗旱性评价及全基因组关联分析
向日葵苗期抗旱性评价及全基因组关联分析
【摘要】： 干旱是目前向日葵生产中影响最大的非生物胁迫之一,受干旱胁迫影响,向日葵生产及育种面临着极大的挑战。试验共收集了122份油用向日葵材料,利用SLAF-seq技术,以向日葵基因组作为参考进行酶切预测,水稻日本晴为对照进行比对,获得多态性标签,并开发大量特异性SNP,结合苗期抗旱盆栽试验,通过表型数据分析以及抗旱相关性状关联分析,鉴定供试品种抗旱性及性状显著关联位点,对显著相关位点候选基因进行功能注释,筛选可能抗旱候选基因,为进一步研究向日葵抗旱机理及分子标记辅助育种提供了理论依据。研究主要结果如下:1.干旱胁迫条件下,株高、叶片相对含水量、SPAD、叶面积、根冠比、相对电导率、根长度、根表面积及根体积9个性状均可作为向日葵苗期抗旱性鉴定指标。其中叶面积、根长、根表面积、根体积4个性状对胁迫反应更为敏感,在向日葵苗期抗旱性评价中更具有代表性。经过综合抗旱性评价,确定材料B108综合抗旱性最强。2.运用SLAF-seq技术,共获得477.76M reads数据,1,105,347个SLAF标签,其中多态性SLAF标签86,985个,共得到群体SNP标记414,692个,其中228,987个为高质量SNP。3.以-lg(P)>6.36为阈值,共检测到43个在染色体水平上的性状显著关联SNP位点,其中4个为极显著关联位点。在染色体NC_035434.1上发现了同时控制根表面积和根体积的显著关联SNP位点,位置为130267112,NC_035443.1上发现了同时控制根表面积与根长度的显著关联位点,位置为55775524。4.对关联分析中43个显著关联标记序列进行比对,共得到109个性状相关候选基因,对候选基因功能进行注释,发现20个可能与抗旱性相关的上调表达候选基因,并发现Gene6867、Gene6868和Gene47105可同时控制多个性状。
【学位授予单位】：内蒙古农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
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