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观赏植物基因组与多组学数据库合集｜兰花、菊花、桂花、百合、杜鹃、莲

花匠小妙招
2024-11-18 02:04

兰

福建农林大学兰思仁教授/刘仲健教授团队联合台湾成功大学蔡文杰教授/吴谓胜教授团队在国际期刊BMC Plant Biology在线发表了题为OrchidBase 5.0: updates of the orchid genome knowledgebase的研究论文，正式发布第五版兰科植物基因组数据库OrchidBase5.0（https://cosbi.ee./orchidbase5）

文章地址：https:///10.1186/s12870-022-03955-5

菊

华中农业大学梅之南教授和杨庆勇教授团队合作在国际期刊Nucleic Acids Research发表题为AMIR: a multi-omics data platform for Asteraceae plants genetics and breeding research的文章。研究构建了一个集数据整合、分析和可视化为一体的菊科植物的多组学数据库AMIR（https://yanglab./AMIR）

文章地址：https:///10.1093/nar/gkae833

南京农业大学菊花遗传与种质创新利用团队在Horticulture Research期刊在线发表了题为CGD: A multi-omics database for Chrysanthemum genomic and biological research的研究论文。本研究基于已发表的菊属植物多组学数据，开发了比较基因组、基因表达可视化、基因编辑靶标设计等分析模块，创建了菊属植物综合性数据分析平台CGD（http://210.22.121.250:8880/asteraceae/homePage）

‍文章地址：https:///10.1093/hr/uhae238

桂花

湖北科技学院陈洪国教授团队联合华中农业大学杨庆勇教授团队在Horticultural Plant Journal期刊在线发表了题为A multi-omics database for the biological study of Osmanthus fragrans的研究论文。通过整合127份桂花种质资源表型和基因型信息，构建了桂花多组学数据库OfIR（http://yanglab./OfIR/home）

文章地址：https://www./science/article/pii/S2468014124001870

百合

韩国国立顺天大学等研究人员在Preprints网站发布了题为Lily Database: A Comprehensive Genomic Resource for the Liliaceae Family的报道，建立了百合属植物数据库（http://www./lilidb）

文章地址：https:///10.20944/preprints202310.0220.v1

杜鹃

中国科学院昆明植物研究所章成君研究院团队联合云南省农科院花卉所王继华研究员团队在国际期刊BMC Plant Biology在线发表了题为The Rhododendron Plant Genome Database (RPGD): a comprehensive online omics database for Rhododendron的文章，构建的一个杜鹃花属数据库RPGD（http://bioinfor./RPGD)。

文章地址：https:///10.1186/s12864-021-07704-0

莲

中国科学院武汉植物园水生植物研究中心石涛副研究员和陈进明研究员国际学术期刊Scientific Data上发表了题为Nelumbo genome database, an integrative resource for gene expression and variants of Nelumbo nucifera的文章，共享了莲基因组数据库NGD（http://nelumbo.）

文章地址：https://www./articles/s41597-021-00828-8

综合数据平台

南京农业大学菊花遗传与种质创新团队在国际期刊The Plant Journal在线发表了题为GERDH: an interactive multi-omics database for cross-species data mining in horticultural crops的研究论文，报道了比较基因组学挖掘关键基因数据库（https://），该数据库提供了一种跨物种、多组学、交互式比较基因组学分析平台，整合了一系列基因表达调控及功能分析模块，助力功能基因挖掘和解析。