上交卢江教授团队在葡萄花性别早期鉴定的研究方面取得新进展

• 花匠小妙招
• 2024-11-20 11:50

花性别是葡萄遗传育种以及生产中重点关注的性状之一。利用分子标记辅助筛选可以在葡萄幼苗期对花性别进行预测，提升育种的效率与精度。关于葡萄花性别位点的研究已有一定进展，然而，目前的结果尚不能用于葡萄分子辅助育种。

近日，Fruit Research在线发表了上海交通大学卢江教授团队题为Identification of sex determination locus and development of marker combination in Vitis based on genotyping by target sequencing的研究论文，该研究揭示了华东葡萄的花性别决定位点，并鉴定出由两个SNP标记构成的分子标记组合，通过该标记组合的基因型可以较为准确的预测葡萄花性别。

图1 性别决定位点定位

(a) Chr2区间作图；(b) Chr2复合区间作图；(c) Chr2上IM和MQM的重叠区域与峰值标记，位点的边界由侧翼最接近阈值(LOD = 30)的标记确定。

该研究使用欧亚种葡萄‘赤霞珠’（双性花）与野生华东葡萄单株‘华东1058’（雄花）分别作为母本与父本进行杂交，获得包含有131个子代、且性别分离的F1代杂交群体，使用自主开发的GBTS葡萄液体芯片对上述群体进行了测序。根据测序数据与两年的性别统计结果，在2号染色体的3.29-5.78 Mbp范围定位到一个主效位点，峰值位于4.83 Mbp，表型变异解释率高达98.6%（图1）。通过对该位点的进一步分析，鉴定到由两个SNP组成的标记组合（“Chr02_4825970”与“Chr02_4758220”），利用该标记组合可以准确预测葡萄花性别（图2）。

图2 性别鉴定标记组合模型

“A”、“T”、“C”和“G”分别代表四种核苷酸类型，“X”代表任何一种核苷酸类型；每个性别类型的两条虚线代表2号染色体的两个姐妹染色单体；右侧照片分别为对应性别的葡萄花穗。

综上所述，该研究展示了在葡萄育种中应用GBTS技术探索了葡萄花性别决定位点，并为葡萄育种中的花性别早期选择提供了可靠的分子标记。

团队介绍

博士生杨博涵为论文的第一作者，卢江教授与傅佩宁助理研究员为本文共同通讯作者。该研究得到了新疆自治区重点研发计划、上海市农委科技兴农、国家自然科学基金等项目的资助。

https://doi.org/10.48130/FruRes-2023-0031

关于 Fruit Research

Fruit Research是一本开放获取的国际期刊，致力于传播果树研究领域的最新进展，专注于发表本领域原创研究文章、综述和方法和观点。期刊主编由南京农业大学程宗明教授担任。目前期刊已被Scopus、CABI等数据库收录。

期刊官网：

www.maxapress.com/frures

投稿网址：

mc03.manuscriptcentral.com/frures

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