春天你好呀!又到了“绿”意满大地的季节!老师们是不是已经在迫不及待地构建群体准备取样啦?难怪小编最近收到不少老师们的意向,尤其是各种作物、蔬菜、林木性状定位需求等等等等……别急,小编快马扬鞭地去为大家申请了活动,在文末哦~让我们先来了解一下百迈客遗传图谱的神通广大~
遗传图谱是进行动植物功能基因组研究的基础之一。百迈客利用自主研发的 SLAF-seq 技术和与之配套的HighMap 构图软件,形成了功能基因组挖掘完整解决方案,为群体性状到功能基因研究之间架起一道可靠的桥梁。目前,该解决方案已经成功在水产,林木,果蔬和作物中成功构建了数百张高密度遗传图谱和相应QTL定位研究,得到业内人士广泛欢迎和好评。
自主研发技术
SLAF-seq
SLAF-seq技术流程
SLAF-seq(Specific-Locus Fragment Sequencing)是百迈客自主研发的一套简化基因组测序技术,利用生物信息学寻找最合适的酶对基因组进行酶切,结合一定大小的插入片段文库,经高通量测序在全基因组范围内快速鉴定高准确性的变异标记(SNPs)信息,进行群体进化、遗传图谱构建及 QTL 定位、性状关联等分析,广泛应用于功能基因定位、分子育种和种质资源鉴定等领域。
SLAF-seq遗传图谱优势
1.上图标记数量更多
2.标记质量更高
和其他简化测序技术相比,SLAF-seq技术数据利用率,标记深度和完整性更高,标记质量因而更高。
3.图谱质量更可靠
利用HighMap软件排图,同时结合共线性评估,单体来源评估和标记热图评估,高质量图谱自然水到渠成。
4.量身定制,服务更优
根据不同物种、不同科研需要,个性化设计标记开发方案,确保实现最优性价比。
自主研发软件
HighMap
HighMap构图流程及效果
好马配好鞍,SLAF数据下机后利用百迈客自主研发的构图软件HighMap进行构图,该软件采用多种统计学算法和多轮纠错方案,保障标记间的连锁关系更准确,使图距更接近真实值。同时,HighMap软件容错能力更强,能更有效提高数据利用率。HighMap软件获得发明专利1项,数项软件著作权,利用HighMap构图发表的高水平文献有上百篇,获得学术界高度认可。
HighMap与JoinMap4.1构图对比
高质量图谱评价体系
除此之外,百迈客独创了先进的图谱评价体系,从测序准确性、分子标记准确性、基因分型准确性和完整度,以及遗传图谱相关系数,如共线性、单体来源、相邻标记连锁关系等多角度做出系统的评估来保障图谱质量。
共线性评估:大部分标记的顺序保持一致,说明共线性良好,连锁相分析准确;遗传重组率计算的准确率高。
单体来源评估:遗传分离群体是通过杂交的方式形成的,理论上在每个个体中较大区段的来源会保持一致。
相邻标记连锁热图评估:连锁群上相邻标记间的连锁关系很强,与较远标记间的连锁关系逐渐变弱,说明标记顺序正确。
百迈客自2009年成立以来深耕于群体遗传研究,在遗传图谱及性状QTL定位方面取得了骄人的成绩。目前,遗传图谱研究物种经验丰富,包括作物、林木花卉、果蔬、水产等,完成性状涉及产量、抗病、品质、株型、代谢物等。在丰富的项目经验基础上,累计发表近200篇,累计影响因子近800!
(百迈客部分已发表遗传图谱的物种)
说了这么多,答应各位老师的福利我可没忘记
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活动内容
来百迈客做遗传图谱,全场 九折!
附加优惠
额外赠送亲本20×(重测序遗传图谱:子代≥5×且≥100个样品;SLAF遗传图谱:子代10×且≥100个样品)
活动时间
即日起—2022年4月30日
参与方式
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文案:群体产品部
排版:市场部
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干货|百迈客单细胞 & 空间转录组专题系列
百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技术企业,公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术,拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块;拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队;公司自成立以来,注重创新发展,科研成果成果层出不穷,先后在《Nature》、《Cell》、《 Nature Genetics》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇,累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项,软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台,满足科研工作者多种科研需求,努力打造基因产业国际一流企业,“为世界创造新的可能!”
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