烟草抗番茄斑萎病毒基因筛选与生物信息学分析
烟草抗番茄斑萎病毒基因筛选与生物信息学分析
【摘要】：通过同源克隆的方法在TSWV高感烟草品种NC89、TSWV耐病烟草品种中烟100中分别克隆出一个疑似抗番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)的基因,分别命名为NtSw-5~(NC89)和NtSw-5~(zy100)。序列分析表明,NtSw-5~(NC89)长3819bp,包含1个完整的读码框,编码1273个氨基酸,理论等电点和相对分子质量分别为5.64和147529.5Da;NtSw-5~(zy100)长3165bp,包含1个完整的读码框,编码1054个氨基酸,理论等电点和相对分子质量分别为6.75和122032.9Da;NtSw-5~(NC89)和NtSw-5~(zy100)均不含信号肽,均无明显跨膜区,二者均含有大多数植物抗性蛋白所共有的CC-(NB-ARC)-LRR典型结构。系统进化树分析表明,NtSw-5~(NC89)与马铃薯假定晚疫病抗性蛋白同源R1A-3近源关系最近,NtSw-5~(zy100)与烟草假定晚疫病抗性蛋白同源R1A-3同型X2近源关系最近。该结果可为烟草番茄斑萎病毒抗性研究和烟草番茄斑萎病毒的防治提供理论基础。
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