竹节参达玛烷合成酶基因的克隆和生物信息学分析
竹节参达玛烷合成酶基因的克隆和生物信息学分析
【摘要】：达玛烷合成酶(dammarenediol synthase, DS)是三萜类皂苷化合物进入达玛烷型皂苷合成途径的首个关键酶,对人参属植物三萜皂苷的生物合成具有重要的调控作用。本实验以6年生栽培种竹节参为实验材料,基于竹节参转录组数据,利用RT-PCR方法克隆得到DS基因的全长cDNA序列,命名为pjDS。该基因序列长度为2 556 bp,其中包含一段完整开放阅读框,长达2 310 bp,一共编码了769个氨基酸。经生物信息学分析后得出,该基因编码的蛋白质分子量为88.40 kD,理论等电点为5.84,为亲水性蛋白质,并含有跨膜区,具有56处磷酸化位点。其二级结构主要由α-螺旋(44.21%)和无规则线圈(34.72%)构成,并具有QW (QXXXXXW)和DCTAE这2种氧化鲨烯环化酶(OCS)家族的特征性保守基序。pjDS蛋白序列与人参(ACZ71036.1)、西洋参(AGK62449.1)、三七(AIK21788.1)、锡金三七(ANB82450.1)和越南人参(AGS16975.1)氨基酸序列的相似性分别为99%、99%、99%、99%和98%。实时荧光定量PCR的结果表明,pjDS基因在竹节参的根状茎、茎、叶和花等各器官组织均有所表达,进一步发现该基因在花中表达量最高,而在根状茎中的表达量最低。本研究为进一步研究竹节参中三萜皂苷生物合成机制提供理论依据。
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