月季花瓣丝氨酸蛋白酶基因RhSep1的克隆及生物信息学分析

• 花匠小妙招
• 2024-11-20 17:10

【摘要】：利用RT-PCR技术,从切花月季品种"Samantha"中克隆丝氨酸蛋白酶基因RhSep1。利用生物信息学技术对所得到的丝氨酸蛋白酶RhSep1序列进行结构与功能预测。结果表明:RhSep1基因全长2 442 bp,开放阅读框编码769个氨基酸,推定该丝氨酸蛋白酶分子质量为80.48 kD。通过NCBI和MEROPS肽酶数据库等对Rh-Sep1进行Protein Blast,发现RhSep1具有肽酶S8_3家族SA的典型结构域Petidase_S8_3(序列为Tyr-108-Leu-341)和PA_subtilisin_like的结构域(序列为Tyr-348-Ile-474)。预测RhSep1可能具有信号肽、明显疏水区和典型跨膜区,同时RhSep1氨基酸序列中存在较多蛋白激酶C和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、豆蔻酰化位点。这些活性位点往往与蛋白的磷酸化、G蛋白相互作用等信号转导事件有关,RhSep1可能存在复杂的蛋白水平调控机制。

1 颜永杰;吴宽;张珏;高云芳;谢海峰;马铃薯卷叶病毒陕西分离物外壳蛋白(CP)的生物信息学分析[J];西北大学学报(自然科学版);2010年03期 2 段艳芳;宋任涛;王飞;酪蛋白激酶2的亚基结构与生理功能[J];生命的化学;2009年01期 3 郑柳城;朱宏波;水稻水溶性环氧化合物水解酶的生物信息学分析[J];生物信息学;2009年02期 4 赵喜亭;丛日晨;刘晓静;高俊平;失水胁迫对月季花瓣内肽酶活性的诱导及对花朵衰老进程的影响[J];中国农业科学;2008年02期 5 郑斌,詹希美信号肽序列及其在蛋白质表达中的应用[J];生物技术通讯;2005年03期 6 邱建丁,梁汝萍,谭学才,邹小勇,莫金垣膜蛋白跨膜区段的预测分析[J];高等学校化学学报;2004年05期 7 桂俊豪,刘家云,贾林涛,仇东辉,余伍忠,何江AD7C-NTP基因的染色体定位及其产物的跨膜区预测[J];细胞与分子免疫学杂志;2004年05期 8 丛日晨,赵喜亭,刘晓辉,高俊平月季切花采后花瓣内肽酶活性的变化[J];园艺学报;2003年02期 9 曹慧,韩振海,许雪峰水分胁迫诱导平邑甜茶叶片衰老期间内肽酶活力的变化及其生化特性研究[J];中国农业科学;2002年12期 10 季星来,孙之荣基于结构的丝氨酸蛋白酶超家族进化分析[J];电子学报;2001年S1期

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