对染色体规模基因组组装的分析揭示了栽培菊花的起源和进化,Nature Communications
对染色体规模基因组组装的分析揭示了栽培菊花的起源和进化
Nature Communications ( IF 14.7 ) Pub Date : 2023-04-11 , DOI: 10.1038/s41467-023-37730-3
Aiping Song 1 , Jiangshuo Su 1 , Haibin Wang 1 , Zhongren Zhang 2 , Xingtan Zhang 3 , Yves Van de Peer 1, 4, 5 , Fei Chen 6 , Weimin Fang 1 , Zhiyong Guan 1 , Fei Zhang 1 , Zhenxing Wang 1 , Likai Wang 1 , Baoqing Ding 1 , Shuang Zhao 1 , Lian Ding 1 , Ye Liu 1 , Lijie Zhou 1 , Jun He 1 , Diwen Jia 1 , Jiali Zhang 1 , Chuwen Chen 1 , Zhongyu Yu 1 , Daojin Sun 1 , Jiafu Jiang 1 , Sumei Chen 1 , Fadi Chen 1
菊花（Chrysanthemum morifolium Ramat.）是一种具有重要经济、文化和象征价值的全球重要观赏植物。然而，由于其复杂的遗传背景，对菊花的研究具有挑战性。在这里，我们报告了包含 27 条假染色体（8.15 Gb；支架 N50 为 303.69 Mb）的百叶草近乎完整的组装和注释。比较和进化分析揭示了大约 600 万年前菊花物种共有的全基因组三倍体 (WGT) 事件(Mya) 和C. morifolium大约 3 Mya 的可能谱系特异性多倍体化。多层次证据表明C. morifolium很可能是节段异源多倍体。此外，基因组学和转录组学方法的结合证明了C. morifolium基因组可用于识别关键观赏性状的基因。CmCCD4a的系统发育分析追溯了栽培菊花的花色育种历史。这项研究产生的基因组资源可能有助于加速菊花的遗传改良。
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更新日期：2023-04-12
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