分享一个好用的植物单细胞数据库
scPlantDB是一个特异性的植物单细胞综合数据库，收集了丰富的单细胞转录组数据集。scPlantDB包含细胞标记模块，能够分析同一物种不同实验细胞标记基因的表达和功能。
数据库链接：
https://biobigdata.nju.edu.cn/scplantdb/home
scPlantDB当前收录了17个植物物种的67个高质量的单细胞转录组数据集。单击感兴趣的植物图标，可以进入Marker菜单页面。
这里以拟南芥为例，点击相应的植物图标即可进入Marker菜单页面，在该页面我们可以下载当前物种的基因组数据和细胞标记基因数据。
点击左侧分类树中的任意细胞类型，如这里的Root hair，可以查看当前细胞类型对应的标记基因信息。在细胞类型面板中，除了标记基因表格，scPlantDB以词云图的形式展示每个标记基因的源数据集数量。
此外，用户还可以使用top标记基因列表进行基于GO和KEGG数据库的GSEA分析，并显示前10个GO term或pathway。此外，scPlantDB提供了各种物种细胞类型的比较结果，直系同源基因也被视为相同细胞类型的细胞标记。
在Browser菜单页面中，scPlantDB为每个数据集提供了详细的元数据信息，包括数据集、项目、物种、组织、年龄、样本等，点击浏览按钮或下载按钮可轻松查看数据集。
而在Tools菜单页面，scPlantDB提供了3个在线小工具。例如，Blast工具可用于序列的同源比对，如下图。
而Cell type Comparator工具，可以比较同一物种的两种细胞类型，点击热图中的气泡可用维恩图的方式展示比较结果。
另外，Cell type Predictor工具可用于细胞类型的预测，只需上传Marker基因列表即可查到相应的细胞类型。
好啦，本次的植物单细胞数据库就分享到这里啦！
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