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第二章土壤微生物

花匠小妙招
2024-11-23 22:25

Caulobacter——柄杆菌Corynebacterium——棒杆菌属?Bdellovibrio-——蛭弧菌土壤放线菌actinomyces土壤放线菌：是生活于土壤中呈丝状单细胞、革兰氏阳性的原核微生物。在自然界分布很广，绝大多数为腐生，少数寄生。产生种类繁多的抗生素，据估计，已发现的4000多种抗生素中，有2/3是放线菌产生的，如链霉素、庆大霉素、利福霉素等。

放线菌（原核生物）多分布在有机物较丰富的碱性土壤中。放线菌的生长使土壤带有特殊的土腥气味。放线菌也是原核微生物，菌丝比真菌细，通过断裂菌丝繁殖或无性孢子繁殖土壤中放线菌数量仅次于细菌105-107/克土壤放线菌占土壤微生物总数的5％~30%由于菌体大，其生物量与细菌接近。土壤中主要的放线菌优势属:链霉菌属（streptomyces)诺卡氏菌属(Nocardia)小单孢菌属(Micromonospora)土壤真菌：菌体多呈分枝丝状，少数菌丝不发达或缺乏，具真正细胞核——真核生物。生态习性：适宜酸性；好气性微生物；化能有机营养型作用：是土壤中糖类、纤维类、果胶和木质素等含碳物质分解的积极参与者。菌体粗大，菌丝最长可达40米，其生物量是所有微生物类群中最高的，。土壤霉菌为好氧性微生物，一般分布于土壤表层，深层较少发育，以丝状体和孢子体形式存在于土壤中，103-104/克土壤，喜欢酸性土壤，如森林土壤中数量多真菌属异氧型微生物。土壤真菌的多少与土壤有机质含量密切相关。根据真菌的营养过程将真菌分为三类：寄生真菌：引发植物的病害；腐生真菌：分解有机残体；共生真菌：与植物体共生，也叫菌根菌。土壤中真菌主要类群：青霉(Penicillium)曲霉(Aspergillus)镰刀霉(Fusarium)木霉(Trichoderma)根霉(Rhizopus)毛霉（Mucor）。酵母菌真核生物单细胞，有时候为假菌丝主要存在于果园土壤中，酵母在果园土壤里含量几十万个／g土壤。藻类（植物还是微生物？）含叶绿素，能进行光合作用，合成有机质。由于需要光，它们主要生活在土壤表层。地表藻类能够和土壤颗粒粘结在一起，增加土壤表面的强度，可使土壤侵蚀明显减轻。另外蓝绿藻可固定N素。藻类包括单细胞或多细胞的原核或真核生物土壤中的藻类主要是绿藻和硅藻。在土壤微生物总量中不足1%。土壤藻类是土壤生物的先行者，可通过光能自养的能力,成为地球上有机物质制造者之一。荒地和沙漠土壤中的腐殖质多来自土壤藻类。根据藻类的生长状况，可判断出土壤的肥力状况和性质。肥沃土壤，藻类生长旺盛，土表常出现黄褐色或黄绿色的薄藻层，硅藻多则是土壤营养丰富的证明Botrydiopsisarhiza

原生动物原生动物:３万个／克土纤毛虫，鞭毛虫、肉足虫等为主，它们以其它微生物和有机物碎片为食，对其它几类微生物的数量起调节作用。第四节土壤微生物个体生态学与原位研究群体生态学(synecology)研究由多种生物构成的群落(Community)及与环境的相互关系个体生态学(autecology)研究一种生物(甚至一株植物或一个动物)与环境的相互关系一、细菌个体生态学研究技术个体生态学不但要区分土壤中不同的细菌种，而且还要分别研究种内不同类型菌株和个体的动态，但土壤是细菌数量众多的诸种微生物共居的异质体，因此要求采用特异性很高的方法和手段来跟踪研究对象。用特异的DNA或RNA序列作为核酸探针检测引入环境中的目标微生物，探针与从土壤中提取的DNA或RNA杂交，根据杂交信号的有无、强弱分析目标微生物；或者和经过培养后的菌落杂交，可以检测目标微生物的数量。目标微生物的检测方法1、核酸探针法用探针和环境中的DNA杂交。菌落原位杂交（colonyinsituhybridization）：是将环境中的细菌培养后，再将菌落转移到硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后将膜上的菌落裂解以释放出DNA，DNA经烘干固定后与标记的探针杂交，检测杂交信号2、PCR-baseddetectionmethods常规PCR法的检测是根据所设计的引物对特异性片段进行PCR扩增，通过对产物琼脂糖凝胶电泳，看是否能扩增出特异性条带来检测样品中是否含有目标微生物现已发展了许多衍生技术，如原位PCR、套式PCR、荧光定量PCR以及real-timePCR等3、免疫学方法根据微生物自身的特异性蛋白或外源基因能产生的蛋白，制备相应的抗体，再用相应的抗体去检测，以此同其它微生物相区别。免疫荧光菌落染色