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向日葵基因组提供了对油代谢、开花和 Asterid 进化的见解,Nature

花匠小妙招
2024-11-25 20:34

向日葵基因组提供了对油代谢、开花和 Asterid 进化的见解
Nature ( IF 50.5 ) Pub Date : 2017-05-22 , DOI: 10.1038/nature22380
Hélène Badouin , Jérôme Gouzy , Christopher J. Grassa , Florent Murat , S. Evan Staton , Ludovic Cottret , Christine Lelandais-Brière , Gregory L. Owens , Sébastien Carrère , Baptiste Mayjonade , Ludovic Legrand , Navdeep Gill , Nolan C. Kane , John E. Bowers , Sariel Hubner , Arnaud Bellec , Aurélie Bérard , Hélène Bergès , Nicolas Blanchet , Marie-Claude Boniface , Dominique Brunel , Olivier Catrice , Nadia Chaidir , Clotilde Claudel , Cécile Donnadieu , Thomas Faraut , Ghislain Fievet , Nicolas Helmstetter , Matthew King , Steven J. Knapp , Zhao Lai , Marie-Christine Le Paslier , Yannick Lippi , Lolita Lorenzon , Jennifer R. Mandel , Gwenola Marage , Gwenaëlle Marchand , Elodie Marquand , Emmanuelle Bret-Mestries , Evan Morien , Savithri Nambeesan , Thuy Nguyen , Prune Pegot-Espagnet , Nicolas Pouilly , Frances Raftis , Erika Sallet , Thomas Schiex , Justine Thomas , Céline Vandecasteele , Didier Varès , Felicity Vear , Sonia Vautrin , Martin Crespi , Brigitte Mangin , John M. Burke , Jérôme Salse , Stéphane Muños , Patrick Vincourt , Loren H. Rieseberg , Nicolas B. Langlade

驯化的向日葵 Helianthus annuus L. 是一种全球油料作物，有望适应气候变化，因为它可以在包括干旱在内的各种环境条件下保持稳定的产量。通过从相容的野生向日葵近缘种（包括许多极端微生物物种）中挖掘抗性等位基因，可以实现更大的恢复力。在这里，我们报告了向日葵基因组（3.6 gigabases）的高质量参考，以及来自营养和花卉器官的大量转录组数据。基因组主要由高度相似的相关序列和成功组装所需的单分子实时测序技术组成。基因组分析使阿斯特里德斯的进化历史得以重建，进一步确定了大约 2900 万年前在 Asterids II 进化枝底部存在全基因组重复和向日葵特异性全基因组重复的存在。结合数量遗传学、表达和多样性数据的综合方法允许开发针对两个主要育种性状、开花时间和油代谢的综合基因网络，并在这些网络中揭示新的候选基因。我们发现开花时间的基因组结构是由最近的全基因组复制塑造的，这表明古老的旁系同源物可以在相同的调控网络中保留数千万年。该基因组是未来研究计划的基石，旨在利用遗传多样性来提高生物和非生物胁迫抗性和石油产量，

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更新日期：2017-05-22