褐藻糖精中隐花色素/光解酶家族的全基因组鉴定和分析,Journal of Applied Phycology
褐藻糖精中隐花色素/光解酶家族的全基因组鉴定和分析
Journal of Applied Phycology ( IF 2.8 ) Pub Date : 2023-07-29 , DOI: 10.1007/s10811-023-03049-1
Yukun Wu , Pengyan Zhang , Zhourui Liang , Wenhui Liu , Yanmin Yuan , Yi Liu , Di Zhang , Fuli Liu
隐花色素/光裂解酶家族（CPF）是一个分布广泛且高度保守的基因家族。其中包括修复 UV（紫外线）引起的 DNA 损伤的光裂合酶，以及在陆地植物中充当蓝光受体的隐花色素。本研究以具有经济价值的褐藻Saccharina japonica的CPF成员为研究对象，追踪了CPF成员在多种藻类中的进化关系和分布。在S. japonica和Undaria pinnatifida的基因组中发现了 6 个不同的 CPF 成员。为了进行系统发育分析，从另外 24 个不同的物种中收集并鉴定了 94 个 CPF 成员。系统发育分析表明CPF家族由五个主要分支组成。值得一提的是，Ectocarpus siliculosus和U. pinnatifida的 CPF 成员由两种类型组成，分别由 (6–4) 嘧啶-嘧啶酮加合物 [(6–4) 光产物] 光裂合酶 [(6–4) 光裂合酶] 和环丁烷演化而来。 II 型嘧啶二聚体（CPD II 型）光裂合酶。在S. japonica中鉴定的 CPF 成员完全由 CPD II 型光裂合酶进化而来。Sj Cryptochrome - DASH1 (CRY-DASH1) 和SjCPD基因在不同光质条件下具有明显的差异表达模式。Sj CPF 成员可以利用蛋白质-蛋白质相互作用来调节下游Timeless基因。尽管如此，这还需要额外的实验证实。这些发现为藻类中 CPF 的功能和调控途径提供了新的线索。
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更新日期：2023-07-29
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