野牡丹 MYB 基因家族的全基因组鉴定、表征和表达模式,Horticulturae
MYB 基因家族在植物中非常重要，在许多植物发育过程中发挥着作用，包括新陈代谢、激素信号转导、细胞身份以及生物和非生物胁迫。由于最近获得了白牡丹基因组，这是首次在该物种中鉴定出 MYB 基因家族。本研究使用 HMMER 搜索和 BLASTp 方法鉴定了 M. candidum 基因组中的 421 个 MYB 基因成员。这些MYB进一步分为10个亚型，包括R2R3、RR、CPC-like、CCA1-like、TBP-like、R1R2R3、I-box、非典型MYB、MYB-CC和MYB-like。结构域和保守性分析表明，每种类型的 MYB 都具有不同数量和组合的 SANT/myb DNA 结合结构域。共线性分析揭示了 MYB 基因家族内的几个基因重复事件。Ka与Ks的比率表明大多数MYB基因在进化过程中经历了纯化选择。三个物种的系统发育分析证实了我们的发现，并显示了不同物种中 MYB 基因的进化关系。花的三个发育阶段的 RNA-seq 和 WGCNA 分析确定 McMYB113h、McMYB21b 和 McGLK1c 在 M. candidum 的花发育过程中发挥着关键作用。最后，我们对 9 个组织中的 20 个与花发育相关的 MYB 进行了 qRT-PCR 实验，以说明它们在 M. candidum 中的表达模式。本研究为探索白花蜜MYB基因资源及其在白花花相关产业中的潜在应用奠定了基础。三个物种的系统发育分析证实了我们的发现，并显示了不同物种中 MYB 基因的进化关系。花的三个发育阶段的 RNA-seq 和 WGCNA 分析确定 McMYB113h、McMYB21b 和 McGLK1c 在 M. candidum 的花发育过程中发挥着关键作用。最后，我们对 9 个组织中的 20 个与花发育相关的 MYB 进行了 qRT-PCR 实验，以说明它们在 M. candidum 中的表达模式。本研究为探索白花蜜MYB基因资源及其在白花花相关产业中的潜在应用奠定了基础。三个物种的系统发育分析证实了我们的发现，并显示了不同物种中 MYB 基因的进化关系。花的三个发育阶段的 RNA-seq 和 WGCNA 分析确定 McMYB113h、McMYB21b 和 McGLK1c 在 M. candidum 的花发育过程中发挥着关键作用。最后，我们对 9 个组织中的 20 个与花发育相关的 MYB 进行了 qRT-PCR 实验，以说明它们在 M. candidum 中的表达模式。本研究为探索白花蜜MYB基因资源及其在白花花相关产业中的潜在应用奠定了基础。McGLK1c 在 M. candidum 的花发育过程中发挥着关键作用。最后，我们对 9 个组织中的 20 个与花发育相关的 MYB 进行了 qRT-PCR 实验，以说明它们在 M. candidum 中的表达模式。本研究为探索白花蜜MYB基因资源及其在白花花相关产业中的潜在应用奠定了基础。McGLK1c 在 M. candidum 的花发育过程中发挥着关键作用。最后，我们对 9 个组织中的 20 个与花发育相关的 MYB 进行了 qRT-PCR 实验，以说明它们在 M. candidum 中的表达模式。本研究为探索白花蜜MYB基因资源及其在白花花相关产业中的潜在应用奠定了基础。
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