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时间转录组分析为红肉火龙果的花发育提供了分子见解,Electronic Journal of Biotechnology

背景

火龙果因其众多的健康益处而成为全球重要的经济水果。系统地了解花发育的机制对于获得更高的果实产量和质量至关重要。然而,尚未研究火龙果花发育的遗传机制。在此,通过利用花发育的九个不同阶段,进行转录组分析以确定红肉火龙果花发育过程中的转录变化。

结果

总共产生了 95,412 个 unigenes,平均长度为 913 nt,N50 值为 1878 nt。比较转录组分析显示在花的生长阶段有许多差异表达的基因(DEGs)。此外,一系列关键的 DEG 富含激素信号传导、转录、碳水化合物转运和能量产生途径。特别是吲哚-3-乙酸、脱落酸、乙烯反应性转录因子、类常数、类蜀黍分支 1/cycloidea/增殖细胞核抗原因子、apetala1-like、agamous-like MADS-box 蛋白、sepallata、生长-调节因子、推定的轴向调节剂 yabby、多叶/花卉同系物和MYB基因相关转录因子表现出改变的表达,表明它们在火龙果花器官发育中的关键作用。此外,与糖合成、运输和利用相关的基因介导火龙果的花生长调节。选择 11 个基因进行 qRT-PCR 分析以验证 RNA 测序的结果。

结论

我们的结果为火龙果花发育的转录调控提供了重要的见解。这些数据资源将成为未来研究的基石,旨在探索火龙果花卉发育的遗传控制。

引用方式: Wu Z, Huang L, Huang F, et al. 时间转录组分析为红肉火龙果的花发育提供了分子见解。电子 J 生物技术 2022;58 https://doi.org/10.1016/j.ejbt.2022.05.005

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