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综合多组学数据和分析揭示了康乃馨花关键观赏性状的潜在途径,Plant Biotechnology Journal

综合多组学数据和分析揭示了康乃馨花关键观赏性状的潜在途径
Plant Biotechnology Journal ( IF 10.1 ) Pub Date : 2022-03-05 , DOI: 10.1111/pbi.13801
Xiaoni Zhang 1, 2 , Shengnan Lin 1 , Dan Peng 2 , Quanshu Wu 1 , Xuezhu Liao 2 , Kunli Xiang 2 , Zehao Wang 1 , Luke R Tembrock 3 , Mohammed Bendahmane 1, 4 , Manzhu Bao 1 , Zhiqiang Wu 2 , Xiaopeng Fu 1


康乃馨(Dianthus caryophyllus)是世界上最受欢迎的观赏花卉之一。尽管对康乃馨有大量研究,但花色、香味和双花形成的潜在机制仍然未知。在这里,我们采用综合多组学方法来阐明康乃馨花最重要的观赏特征背后的遗传和生化途径。首先,我们组装了D的高质量染色体规模基因组(636 Mb,重叠群 N50 为 14.67 Mb)。石竹,“猩红女王”。接下来,使用来自多个发育阶段的花的不同部分的各种仪器类型生成了一系列代谢组数据集,以评估色素和挥发性化合物积累的空间和时间差异。最后,生成转录组数据以将基因组、生物化学和形态学模式联系起来,提出一组形成花瓣着色、重瓣花和香味产生等观赏性状的途径。其中,转录因子bHLHs、MYBs和WRKY44同源物被认为在控制花瓣颜色图案中发挥重要作用,松柏醇乙酰转移酶和丁子香酚合酶等基因参与丁子香酚的合成。本文提供的基因组学、转录组学和代谢组学的综合数据集为理解花朵发育和着色的潜在途径提供了重要基础,进而可用于选择性育种和基因编辑,以开发新的康乃馨品种。

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更新日期:2022-03-05

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