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国家动物标本资源库馆藏2024年4月云南采集访花昆虫标本COI序列数据集

花匠小妙招
2025-01-18 00:00

基本信息

名称：国家动物标本资源库馆藏2024年4月云南采集访花昆虫标本COI序列数据集

标识符：CSTR:19715.10.6.INSECTA.DNA.00001

作者：中国科学院动物研究所国家动物标本资源库

发布日期：2025-01-06

介绍页面链接：http://museum.ioz.ac.cn/topic_detail.aspx?id=72599

引用格式：

中文：中国科学院动物研究所国家动物标本资源库. 国家动物标本资源库馆藏2024年4月云南采集访花昆虫标本DNA序列数据集. 2024.

CSTR:19715.10.6.INSECTA.202404.Yunnan.FlowerVisitingInsects.DNASequence. http://museum.ioz.ac.cn/topic_detail.aspx?id=72599

英文：National Animal Collection Resou rce Center, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences. Dataset of DNA sequence of flower visiting insect specimens in Yunnan in April 2024 of National Animal Collection Resource Center. 2024. CSTR:19715.10.6.INSECTA.202404.Yunnan.FlowerVisitingInsects.DNASequence. http://museum.ioz.ac.cn/topic_detail.aspx?id=72599

数据信息

数据集负责人及联系方式：

邵丽丽（中国科学院动物研究所），shaolili@ioz.ac.cn；

数据采集人及单位：

邵丽丽，中国科学院昆明动物研究所

实物标本保藏单位：中国科学院动物研究所国家动物标本资源库

实物标本采集人及单位：邓涛，中国科学院昆明植物研究所

时间范围：2024年4月

空间范围：云南

关键词：云南;访花昆虫;COI序列

学科类别：180.57 动物学

涉及生物类群：脊索动物门昆虫纲

主题分类：昆虫DNA序列

数据类型：文本数据

文件格式：.fas

涉及标本数量：81号

数据大小：53KB

包含字段（内容）：COI基因条形码序列

数据采集方式：使用NEB生物公司的基因组提取试剂盒对标本腿部或头胸部组织进行DNA的提取。对DNA溶液进行检测后使用COI基因通用引物或通过文献查找使用类群特定引物对条形码区域进行PCR扩增，扩增时根据引物调整退火温度或PCR循环数。PCR完成后对扩增的条带进行凝胶电泳检测，送天一辉远生物公司利用Sanger法进行双端测序，测序完成后根据测序峰图对序列进行校对拼接，去掉双端引物序列，形成最终的条形码序列。

资助情况：标本的采集获得了第二次青藏高原综合科学考察研究（2019QZKK05002）、国家基金委区域创新基金等项目的支持；标本的管理和数字化以及DNA数据的获取得到了国家动物标本资源库（National Animal Collection Resource Center, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences）和中国科学院战略生物资源计划（Biological Resources Programme，Chinese Academy of Sciences，BRP CAS）的资助。

应用方向举例：本数据集可用于访花昆虫的物种鉴定等研究。

数据集摘要

对2024年4月在云南采集的访花昆虫标本的腿部或头胸部组织进行了DNA的提取、扩增和测序，获得了COI基因条形码序列，可用于访花昆虫的物种鉴定等研究。