核盘菌诱导下向日葵转录组构建及防卫相关基因功能研究
摘要
英文摘要
目录
1绪论
1．1．2向日葵菌核病病原及为害症状
1．1．3向日葵菌核病发病规律
1．1．4向日葵菌核病的防治
1．2植物抗病机制研究进展
1．2．1植物抗病类型
1．2．2植物抗病的物质基础
1．2．3植物抗病相关基因
1．2．4植物抗病反应基本信号通路
1．3向日葵抗菌核病机制研究概况
1．4转录组学及其在植物抗病研究中的应用
1．4．1转录组学
1．4．2转录组研究的主要技术
1．4．3RNA-Seq技术在植物抗病方面的应用
1．5研究的目的意义、技术路线及研究内容
1．5．1研究的目的意义
1．5．2技术路线
1．5．3研究的主要内容
2核盘菌诱导下向日葵转录组的构建及分析
2．1实验材料
2．1．1供试菌株及向日葵
2．1．2试剂及培养基
2．1．3供试仪器设备
2．2实验方法
2．2．1核盘菌诱导向日葵及其样品处理
2．2．2向日葵叶、茎、根总RNA提取和质量检测
2．2．3核盘菌诱导向日葵转录组构建
2．2．4序列拼接
2．2．5基因表达注释
2．2．6差异表达基因分析
2．2．7差异表达基因RT-qPCR验证
2．3结果与分析
2．3．2向日葵叶、茎、根RNA的质量检测
2．3．3核盘菌诱导向日葵转录组测序质量分析
2．3．4核盘菌诱导向日葵转录组Unigenes表达差异分析
2．3．5差异表达基因RT-qPCR验证
2．3．6核盘菌诱导向日葵差异表达基因分析
2．4讨论
2．4．1关于转录组测序数据质量
2．4．2关于Unigene的生物信息学注释问题
2．4．3关于核盘菌诱导向日葵差异表达基因分析
2．5本章小结
3核盘菌诱导向日葵防卫及激素信号传导相关基因差异表达
3．1实验材料
3．1．1供试菌株及向日葵
3．1．2试剂及培养基
3．1．3供试仪器
3．2实验方法
3．2．1植物材料培养及接菌处理
3．2．2向日葵总RNA的提取及反转录
3．2．3向日葵防卫及激素信号相关基因RT-qPCR检测
3．3结果与分析
3．3．1内参基因的筛选
3．3．2核盘菌诱导对向日葵防御相关基因转录水平的影响
3．3．3核盘菌诱导对向日葵激素转导途径相关基因的影响
3．4讨论
3．4．1核盘菌对向日葵防卫相关基因的诱导表达
3．4．2核盘菌对向日葵激素信号途径相关基因的诱导
3．5本章小结
4核盘菌诱导下向日葵GSTs家族基因表达特性分析
4．1实验材料
4．1．1供试菌株及向日葵
4．1．2试剂及培养基
4．1．3供试仪器
4．2实验方法
4．2．2植物材料培养及诱导处理
4．2．3向日葵总RNA的提取及反转录
4．2．4不同诱导处理向日葵GSTs的RT-qPCR
4．3结果与分析
4．3．1向日葵GSTs基因cDNA全长特性分析
4．3．2向日葵GSTs多序列比对及系统进化分析
4．3．3向日葵GSTs在不同组织中的表达特性
4．3．4生物和非生物胁迫对向日葵GSTs基因诱导表达分析
4．4讨论
4．4．1向日葵GSTs基因分类
4．4．2向日葵GSTs的系统进化与功能分化
4．5本章小结
5向日葵病程相关蛋白基因HaPR-1的克隆及功能研究
5．1实验材料
5．1．1供试菌种及植物材料
5．1．2供试试剂
5．1．3培养基
5．1．4供试仪器
5．2实验方法
5．2．1向日葵总RNA提取与cDNA合成
5．2．2向日葵HaPR-1基因全长cDNA扩增
5．2．3向日葵HaPR-1基因核酸测序
5．2．4向日葵HaPR-1基因生物信息学分析
5．2．5向日葵HaPR-1基因表达特性分析
5．2．6植物表达载体的构建
5．2．7农杆菌介导的遗传转化
5．2．8烟草转基因植株Nu-HaPR-1的PCR及RT-PCR检测
5．3．3HaPR-1基因cDNA转化大肠杆菌后PCR检测
5．3．4HaPR-1基因全长cDNA及氨基酸序列分析
5．3．5HaPR-1编码蛋白性质与结构特征分析
5．3．6HaPR-1蛋白多序列比对及系统进化
5．3．7HaPR-1基因的表达特性分析
5．3．8HaPR-1烟草转化载体的构建及鉴定
5．3．9转基因烟草Nu-HaPR-1的获得
5．3．10转基因烟草Nu-HaPR-1的检测
5．3．11转基因烟草Nu-HaPR-1抗病性测定
5．4讨论
5．4．1向日葵HaPR-1基因结构
5．4．3向日葵NaPR-1基因功能
5．5本章小结
6向日葵HaGSTta1和HaGSTp3基因克隆及功能研究
6．1实验材料
6．1．1供试菌株及植物材料
6．1．2试剂及培养基
6．1．3供试仪器
6．2实验方法
6．2．4向日葵HaGSTta1和HaGSTp3基因表达特性分析
6．2．5植物表达载体的构建
6．2．6农杆菌介导的遗传转化
6．2．7转基因烟草植株的PCR及RT-PCR检测
6．2．8转基因烟草的抗病性及防御酶活生测定
6．3．3HaGSTta1和HaGSTp3基因cDNA转化大肠杆菌转化子PCR检测
6．3．4HaGSTta1和HaGSTp3基因全长cDNA及氨基酸序列分析
6．3．5HaGSTta1和HaGSTp3编码蛋白性质与结构特征分析
6．3．6HaGSTta1和HaGSTp3编码蛋白多序列比对及系统进化分析
6．3．7HaGSTta1和HaGSTp3基因的表达特性分析
6．3．8HaGSTta1和HaGSTp3烟草转化载体的构建及鉴定
6．3．9转基因烟草Nu-HaGSTta1和Nu-HaGSTp3的获得
6．3．10转基因烟草Nu-HaGSTta1和Nu-HaGSTp3的PCR检测
6．3．11转基因烟草Nu-HaGSTta1和Nu-HaGSTp3的抗病性测定
6．4讨论
6．4．3HaGS7b1和HaGSTp3基因的功能
6．5本章小结
结论
参考文献
附录
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
声明
相关知识
核盘菌诱导下向日葵转录组构建及防卫相关基因功能研究
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花生响应青枯菌侵染的转录组分析和抗病相关基因挖掘
向日葵抗旱自交系叶片转录组SNP位点信息挖掘
网址: 核盘菌诱导下向日葵转录组构建及防卫相关基因功能研究 https://m.huajiangbk.com/newsview2067271.html
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