一、文章的基本信息
在线/发表时间 2026年2月17日 第一单位和通讯作者 第一单位:School of Pharmacy, Xianning Medical College, Hubei University of Science and Technology, Xianning 437100, China(湖北科技学院咸宁医学院药学院) 通讯作者:Yingting Zhang、Jingjing Zou 发表的英文题目 The OfJAZ gene family in Osmanthus fragrans: IV-OfJAZs regulate petal senescence via hormonal crosstalk 发表的中文题目 桂花OfJAZ基因家族:IV-OfJAZs通过激素交叉对话调控花瓣衰老 发表期刊 Industrial Crops & Products二、摘要
作为茉莉酸(JA)信号通路中的植物特异性阻遏蛋白,茉莉酸ZIM结构域(JAZ)蛋白对植物的生长发育及逆境响应至关重要。在桂花(Osmanthus fragrans)中,花瓣衰老影响观赏品质和瓶插寿命,但其背后的分子机制尚未得到充分解析。本研究利用RNA-seq技术分析了桂花花瓣六个发育阶段,共鉴定出15,045个差异表达基因(DEGs)。加权基因共表达网络分析(WGCNA)揭示了一个包含ETHYLENE INSENSITIVE 3 (EIN3)-LIKE(OfEIL7)与OfJAZ的共表达模块,该模块与JA及乙烯信号通路相关基因呈显著关联。全基因组分析共鉴定出23个OfJAZ基因,系统发育分析将其聚为四个亚家族。大多数OfJAZ蛋白的TIFY和Jas结构域保守,但各亚家族在结构特征和基序组成上存在特异性变异。OfJAZ家族起源于纯化选择,并主要通过片段复制实现扩张。单倍型分析显示不同品种间存在显著遗传变异,其中部分IV-和V-OfJAZs表现出保守的单倍型。IV-OfJAZs富含茉莉酸甲酯(MeJA)响应顺式作用元件,且主要表现为低DNA甲基化水平。表达谱分析表明,OfJAZ3、OfJAZ7、OfJAZ15和OfJAZ17等多个IV-OfJAZs在花瓣衰老后期上调表达,其受MeJA诱导的表达模式与自然花瓣衰老过程相似,而乙烯处理通常会抑制这些基因的表达。转基因烟草、桂花及酵母双杂交(Y2H)实验证实,OfJAZ3和OfJAZ17与OfEIL7的互作可能在JA-乙烯激素交叉调控下延缓叶片衰老。本研究系统阐明了OfJAZ基因家族在花瓣衰老中的功能特征,为通过分子育种技术改良观赏性状和延长花期提供了理论基础。
三、结果描述
3.1 WGCNA揭示OfJAZ基因在花瓣衰老调控中的关键作用
为探究桂花(O. fragrans)开花与衰老过程中的基因表达动态,本研究对六个代表性阶段(S1–S6)的花瓣进行了RNA-seq分析,共鉴定出15,045个差异表达基因(DEGs)。为揭示花瓣衰老过程中的潜在转录调控机制,研究排除了变异度较低的基因(SD ≤ 0.5),并采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别高共表达基因模块(Fig. 1A,B)。结果显示,6,637个DEGs被划分为八个 distinct 模块,其中“blue”和“green”模块在衰老期表达上调(Fig. 1C)。基于KEGG通路的功能富集分析表明,这些模块显著富集于激素信号转导通路(Fig. 1D,E)。热图可视化进一步显示,大多数激素信号相关基因在衰老晚期(S5和S6)上调(Fig. 1F,G)。
Figure 1
基于这些基因构建的调控网络识别出一个与JA和乙烯信号相关的模块,包含OfEIL7(LYG033507)及多个OfJAZ基因(LYG005255、LYG013720和LYG025853)(Fig. 1H)。这些发现提示,OfJAZ基因可能作为JA信号通路的核心调控因子,协调JA与乙烯信号之间的互作,从而调控桂花花瓣衰老。
3.2 OfJAZ基因的鉴定与理化性质分析
通过BLAST和HMMER搜索,并结合NCBI-CDD和SMART数据库的域验证,本研究共鉴定出23个OfJAZ基因,并命名为OfJAZ1–OfJAZ23(Table 1; Figure S1)。预测结果显示(Table 1),OfJAZ蛋白长度为122(OfJAZ6)至389个氨基酸(OfJAZ8),分子量介于13.457 kDa(OfJAZ6)至41.044 kDa(OfJAZ8),理论等电点(pI)为5.13(OfJAZ23)至10.28(OfJAZ6)。脂肪族指数(aliphatic index)介于53.69(OfJAZ6)至78.91(OfJAZ2),大部分蛋白位于60–75区间。除OfJAZ2、OfJAZ5、OfJAZ11和OfJAZ18外,其余OfJAZ蛋白的不稳定性指数均大于40,且所有蛋白均显示负的亲水性平均值(GRAVY)。值得注意的是,91.3%的OfJAZ蛋白预测定位于细胞核。
二级和三级结构预测显示,OfJAZ蛋白主要由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲构成(Figures S2, S3)。α-螺旋含量为6.70%–21.49%,β-折叠为4.16%–9.09%,无规卷曲为69.42%–86.45%(Table S4)。
3.3 JAZ蛋白的系统发育关系
为评估JAZ蛋白的进化关系,研究利用23个OfJAZ蛋白和12个AtJAZ蛋白构建了系统发育树(Fig. 2)。JAZ基因家族被划分为五个 distinct 亚组,OfJAZ成员分布于其中四个。具体而言,Cluster I包含6个OfJAZ蛋白(OfJAZ2、4、8、10、16和20),Cluster II包含1个(OfJAZ21),Cluster IV包含6个(OfJAZ3、7、9、14、15和17),Cluster V包含10个(OfJAZ1、5、6、11–13、18、19、22和23)。
Figure 2
3.4 OfJAZ蛋白的基因结构与基序组成特征
为表征OfJAZ蛋白的结构特征与进化多样性,研究系统分析了其保守结构域和基序组成。结果显示,Cluster I、II和IV均含有Jas和TIFY结构域(Fig. 3A,B)。具体而言,Cluster I成员含有6–7个编码序列(CDS),均包含基序1和2,以及额外的基序15、18、19或9(偶见17);Cluster II成员含有6个CDS,仅检测到基序2和9;Cluster IV成员含有5个CDS,均具有基序1和2,且大多数还含有基序8和11(Fig. 3A–C)。Cluster V成员结构多样性更高,含有3–11个CDS。OfJAZ1、6、12和22同时含有Jas和TIFY结构域,而OfJAZ5、11、13、18、19和23则含有ZnF_GATA、CONSTANS、CO-like、TOC1(CCT)及TIFY/Jas结构域(Fig. 3B)。该亚组所有成员均包含基序2,并与其他基序形成多种组合,如基序1、7、13、20、9或1、4、5(Fig. 3B)。这些观察表明,同一进化亚组内的蛋白具有相似的基因结构和基序排布,提示OfJAZ家族在保持保守结构特征的同时,亦表现出功能分化。
Figure 3
3.5 顺式调控元件的特征分析
为阐明OfJAZ的调控潜力,研究分析了其启动子区的顺式作用元件。共鉴定出45类与光、激素及胁迫响应相关的顺式元件(Fig. 4A)。所有OfJAZ启动子均含有多种调控元件(Fig. 4B,C),其中光响应元件最为丰富(315个),其次为激素响应元件(200个)和胁迫响应元件(118个)(Fig. 4B)。
Figure 4
激素响应顺式元件在OfJAZ启动子中广泛分布,包括响应ABA、MeJA、生长素(auxin)、赤霉素(GA)和水杨酸(SA)的元件(Fig. 4B)。其中,ABA响应元件ABRE数量最多(95个)且分布广泛。除OfJAZ20和OfJAZ13外,所有OfJAZ基因均含有1–10个ABRE,Cluster I(OfJAZ4和8)、IV(OfJAZ7、9、14、15和17)及V(OfJAZ1、6和23)成员含有5个及以上(Fig. 4B)。MeJA响应基序也高度富集,主要为CGTCA-基序(33个)和TGACG-基序(33个),二者常在同一启动子中成对出现(Fig. 4B)。值得注意的是,Cluster IV的OfJAZ基因(OfJAZ3、7、9、14、15和17)含有最多数量的MeJA响应基序(Fig. 4B)。这些发现表明,OfJAZ启动子富含多样的激素响应元件,提示其转录可能受激素信号网络的协同调控。
3.6 JAZ基因家族种内及种间共线性分析
基因组染色体定位分析显示,22个OfJAZ基因在桂花基因组14条染色体上呈不均匀分布(Figure S1; Fig. 5A)。7号和14号染色体携带的OfJAZ基因最多(各3个),3、13、16和19号染色体各含2个,其余染色体(1、2、5、6、8、9、10和23号)各含1个。
Figure 5
基因复制是基因家族扩张的核心机制,通过促进功能分化助力植物适应。在OfJAZ家族中检测到10对片段复制(segmental duplication)基因对(Fig. 5A)。此外,种间共线性分析揭示了AtJAZ与OfJAZ基因间存在8对保守的片段复制对(Fig. 5B)。所有18对片段复制基因对的Ka/Ks值均小于1(Table 2),提示JAZ家族主要受纯化选择(purifying selection)驱动进化。
3.7 OfJAZ基因的单倍型多样性
研究对OfJAZ基因家族在季节组和栽培品种组中的单倍型频率进行了分析,仅保留频率≥2的单倍型。当样本按“秋桂(autumn)”和“四季桂(seasons)”分组时,20个OfJAZ基因(包括Cluster I的OfJAZ2、4、8、10、16和20,Cluster IV的OfJAZ3、7、9、14、15和17,以及Cluster V的OfJAZ1、5、6、11–13、18和22)表现出明显的单倍型组成差异(Fig. 6A)。总体而言,秋桂组的单倍型多样性更高,而四季桂组的单倍型更倾向于集中为少数优势单倍型(Fig. 6A)。例如,OfJAZ1在秋桂组以低频单倍型(归为“others”)为主,而在四季桂组中高频单倍型(如Hap相关类型)比例显著增加(Fig. 6A)。此外,大多数OfJAZ基因由1–2个高频优势单倍型主导,仅少数基因在多个单倍型间分布较为均匀(Fig. 6A)。值得注意的是,对于OfJAZ14,单一单倍型(绿色标记)在四季桂组中占比超过50%。
Figure 6
按栽培品种(丹桂、金桂、四季桂和银桂)分组时,15个OfJAZ基因(包括Cluster I的OfJAZ2、4、10、16和20,Cluster IV的OfJAZ3、7、9、14、15和17,以及Cluster V的OfJAZ6、11、13和18)表现出明显的品种特异性单倍型模式(Fig. 6B)。优势单倍型在不同品种间差异显著(Fig. 6B)。例如,OfJAZ14在丹桂中主要为Hap25,而在金桂、四季桂和银桂中则以Hap24和Hap26为主。就单倍型多样性而言,除OfJAZ3、OfJAZ14和OfJAZ18外,银桂对大多数OfJAZ基因表现出最高的多样性(Fig. 6B)。相比之下,丹桂对大多数基因多样性最低,但OfJAZ7和OfJAZ18例外(Fig. 6B)。有趣的是,Cluster IV的OfJAZ基因(OfJAZ3、7和14)及Cluster V的OfJAZ18在各品种间共享保守单倍型(Fig. 6A,B),提示这些单倍型可能与OfJAZ基因的核心生物学功能相关。
3.8 OfJAZ基因的甲基化分析
研究对OfJAZ基因在CpG、CHH和CHG三种序列环境下的DNA甲基化水平进行了分析(Fig. 7)。CpG甲基化分析将22个OfJAZ基因分为三类。低CpG甲基化的Cluster II包含7个基因,包括Cluster IV的6个成员(OfJAZ3、7、9、14、15和17)及Cluster V的1个成员(OfJAZ12)(Fig. 7A)。基于CHH和CHG甲基化的聚类也识别出三类(Fig. 7B,C)。低CHH甲基化的Cluster III包含15个基因,包括Cluster IV的6个成员(OfJAZ3、7、9、14、15和17)、Cluster V的5个成员(OfJAZ1、5、12、19和23)、Cluster II的1个成员(OfJAZ21)及Cluster I的3个成员(OfJAZ2、4和16)(Fig. 7B)。CHG甲基化的Cluster II包含16个基因(Fig. 7C),与低CHH的Cluster III largely 重叠,并包含Cluster V的6个成员(OfJAZ1、11–13、19和23)(Fig. 7B,C)。
Figure 7
综合三种甲基化环境,低甲基化的Cluster I包含7个基因:Cluster IV的6个成员(OfJAZ3、7、9、14、15和17)及Cluster V的1个成员(OfJAZ1)(Fig. 7D)。值得注意的是,若干基因(OfJAZ3、7、9和15)的总体甲基化水平极低,接近零(Fig. 7D)。这些结果表明,OfJAZ基因表现出 distinct 的甲基化聚类模式,低甲基化基因可能具有更高的转录可塑性和功能响应性。
3.9 OfJAZ家族成员的表达谱分析
3.9.1 OfJAZ的组织特异性及花瓣发育阶段表达
为探究OfJAZ在不同组织及花瓣发育过程中的潜在作用,研究采用qRT-PCR检测了其表达情况(Fig. 8)。大多数OfJAZ基因在各组织中呈组成型表达(Fig. 8A)。除OfJAZ16外,大多数基因在茎中表达水平最高(Fig. 8A)。在花瓣开放与衰老过程中,观察到 distinct 的表达模式(Fig. 8B)。OfJAZ16、OfJAZ21和OfJAZ22表达下调,而OfJAZ2、OfJAZ3、OfJAZ7、OfJAZ8、OfJAZ12、OfJAZ15和OfJAZ17表达上调(Fig. 8B)。值得注意的是,在S6阶段(花瓣脱落期),OfJAZ3、OfJAZ7、OfJAZ8、OfJAZ15和OfJAZ17的表达水平较S1阶段显著上调,倍数变化介于1.62至13.53之间(Fig. 8B),提示它们可能参与调控花瓣衰老。
Figure 8
3.9.2 OfJAZ响应非生物胁迫的表达谱
为探究OfJAZ在非生物胁迫适应中的参与情况,研究对桂花叶片在低温、盐和干旱处理下的表达进行了qRT-PCR定量。在低温与干旱胁迫下,OfJAZ2、OfJAZ8、OfJAZ12和OfJAZ15–17表达下调,峰值出现在0小时(Fig. 9A,B)。相反,OfJAZ21和OfJAZ22表现出先上调后下调的模式,在12或24小时达到最大表达(Fig. 9A,B)。OfJAZ3和OfJAZ7在低温和干旱胁迫下表现出差异响应;例如,OfJAZ7在低温胁迫下短暂上调后下调,而在干旱胁迫下持续下调(Fig. 9A,B)。在盐胁迫下,OfJAZ15和OfJAZ17持续下调,而OfJAZ7、OfJAZ8、OfJAZ12、OfJAZ16、OfJAZ21和OfJAZ22则短暂上调,在3小时达到峰值,相对0小时的倍数变化分别为1.27、1.65、1.31、1.07、30.08和3.80倍(Fig. 9C)。
Figure 9
3.9.3 外源激素处理下OfJAZ的表达谱
为探究OfJAZ对外源激素的响应,研究在ABA、MeJA和乙烯利(ethephon)处理后进行了qRT-PCR定量。ABA处理后,包括OfJAZ7、OfJAZ8、OfJAZ12、OfJAZ15–17、OfJAZ21和OfJAZ22在内的大多数基因下调(Fig. 10A)。相反,OfJAZ2和OfJAZ3呈现动态响应:先下调,后上调,再下调,在24小时达到峰值(Fig. 10A)。MeJA处理后,OfJAZ基因表现出多样响应(Fig. 10B)。具体而言,7个基因(OfJAZ2、3、7、12、15、16和22)被强烈上调,表达增幅超过10倍。相反,OfJAZ8和OfJAZ17下调,而OfJAZ21先上调后下调,在12小时达到峰值。乙烯利处理后,大多数OfJAZ基因(OfJAZ2、3、7、12和15–17)下调,而OfJAZ8、OfJAZ21和OfJAZ22呈现瞬时表达模式,先上调后下调(Fig. 10C)。
Figure 10
3.10 Y2H与亚细胞定位实验
IV-OfJAZ基因具有保守的结构特征、富集的MeJA响应顺式元件、低甲基化水平,并在花瓣衰老期间显著上调(Figs. 3, 4, 6–8)。WGCNA分析进一步表明,OfJAZ3和OfJAZ17与OfEIL7强相关(Fig. 1H)。因此,选择OfJAZ3、OfJAZ17和OfEIL7进行转基因烟草和桂花的验证实验,以及Y2H互作实验。共表达OfEIL7与OfJAZ3或OfJAZ17的重组酵母菌株在SD/-Leu/-Trp平板及含或不含X-α-gal的SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp培养基上均能 robust 生长(Fig. 11A),证实OfEIL7与OfJAZ3及OfJAZ17均存在直接互作。
Figure 11
亚细胞定位分析显示,eYFP标记的OfJAZ3和OfJAZ17主要定位于细胞核(Fig. 11B),支持其作为核内调控因子参与转录网络的功能。
3.11 转基因烟草与桂花的表型及生理分析
将烟草叶片分别转化OfJAZ3、OfJAZ17或对照载体(121-eGFP),并用水、MeJA、乙烯、STS(硫代硫酸钠,乙烯作用抑制剂)或DIECA(二乙基二硫代氨基甲酸,茉莉酸生物合成抑制剂)处理。MeJA和乙烯处理后,OfJAZ3-和OfJAZ17-转基因植株及121-eGFP对照的叶绿素含量、CAT(过氧化氢酶)活性和POD(过氧化物酶)活性均降低,而EL(电解质渗漏)和MDA(丙二醛)水平升高(Fig. 12A–D,G,H)。相反,DIECA和STS处理后,EL和MDA水平降低,而叶绿素含量、CAT活性和POD活性较对照(CK)升高(Fig. 12D–H)。值得注意的是,OfJAZ3-和OfJAZ17-转基因植株的叶片较121-eGFP对照呈现更绿的表型(Fig. 12A–C)。与对照相比,这些转基因植株表现出更高的叶绿素含量、CAT活性和POD活性,以及更低的EL和MDA水平(Fig. 12D)。
Figure 12
在桂花花瓣中瞬时过表达OfJAZ3和OfJAZ17,结果显示转基因花瓣的衰老症状较对照显著减轻(P<0.05)(Fig. 13A)。NBT染色和EL测定进一步支持了这一延迟衰老的表型,显示转基因花瓣中ROS积累和膜损伤更低(Fig. 13B,C)。此外,OfEIL7、OfWRKY57(LYG004259)和OfWRKY33(LYG010683)的转录水平在OfJAZ3-和OfJAZ17-过表达花瓣中较对照显著降低(P<0.05)(Fig. 13D–F)。这些发现表明,OfJAZ3和OfJAZ17可能在JA-乙烯信号交叉调控下延缓叶片衰老。
Figure 13
四、此文总结
本研究旨在阐明桂花(Osmanthus fragrans)花瓣衰老的分子调控机制,重点解析茉莉酸(JA)信号通路核心抑制因子JAZ蛋白家族在此过程中的功能。研究团队通过RNA-seq与加权基因共表达网络分析(WGCNA),从六个花发育阶段中鉴定出23个OfJAZ基因,并发现IV-OfJAZs亚家族成员(OfJAZ3、OfJAZ7、OfJAZ15和OfJAZ17)在花瓣衰老后期显著上调。这些基因富含茉莉酸甲酯(MeJA)响应顺式作用元件且DNA甲基化水平较低,其表达受MeJA诱导而被乙烯抑制。进一步的酵母双杂交与转基因烟草实验证实,OfJAZ3与OfJAZ17可与乙烯信号关键因子OfEIL7发生蛋白互作,通过JA-乙烯激素交叉调控延缓叶片衰老。该研究系统刻画了桂花OfJAZ基因家族的特征与表达模式,为通过分子育种手段延长花期、提升桂花观赏品质及经济价值提供了重要的理论依据。
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网址: 【一区家族】桂花OfJAZ基因家族:IV-OfJAZs通过激素交叉对话调控花瓣衰老 https://m.huajiangbk.com/newsview2594379.html
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