首页 > 分享 > 四照花亲缘地理学与景观遗传学的初步研究

四照花亲缘地理学与景观遗传学的初步研究

花匠小妙招
2024-11-02 09:36

四照花亲缘地理学与景观遗传学的初步研究

【摘要】： 四照花(Cornus kousa subsp.chinensis)隶属山茱萸属(Comus)四照花亚属(Cornus subg.Syncarpea),为东亚特有种。对于四照花的分子研究可以为物种杂交渗入、分化以及亲缘地理学等研究提供了一个不可多得的模式系统。本研究利用叶绿体间隔区的基因(cpDNA)、微卫星分子(SSR)标记联合分析四照花的19个群体的谱系关系、遗传多样性、冰期避难所。研究内容和主要结果如下:1.亲缘地理学研究对cpDNA间隔区引物进行筛选,选出了条带单一、多态性高的两对引物trn L-trn F和rpl14-rpl36,对其19个群体135个个体进行测序。其中rpl14-rpl36的序列长度为605bp,trn L-trn F的序列长度为961bp。以灯台树为外类群,共有10个单倍型。四照花的遗传多样性较高,单倍型多态性(Hd)为0.689,核苷酸多态性(π)为0.002。IBD分析结果表明四照花的遗传分化是由地理距离造成的。本研究利用8对引物进行SSR分析得到153个个体的等位基因,平均观测杂合度(H_o)是0.673,平均期望杂合度(H_e)为0.578。基因流(N_m)为1.099,遗传分化系数F_(st)=0.185,Structure分析显示四照花来自两个基因库,基因交流频繁。瓶颈效应显示四照花近期未经历了瓶颈效应。内繁系数分析(F)分析显示:四照花群体杂合子过剩。经哈迪-温伯格检验发现四照花偏离了平衡,可能杂合子过剩造成其偏离平衡。四照花没有明显的谱系地理结构,遗传变异主要在群体内(73.04%)。从四照花的PCoA分析得到安福的成分和其他的群体不一致,UPGMA聚类分析也得到相同的结果。2.景观遗传学研究通过对四照花分布点的收集,模拟不同时期四照花的潜在分布区、群体之间的连通性,探究20个环境因子对四照花的潜在分布的影响的研究。结果表明:影响四照花分布的主要是最冷月份最低温、降水量变异系数、温度季节变化、冷季度平均温度这四个因子。四照花的潜在分布图显示末次盛冰期到现在的分布区有明显的扩张,现在到2080年没有明显的变化。短时间内并未导致大面积的变化。3.冰期避难所的推测利用cpDNA单倍型构建的TCS网络表明Hap1和Hap2为广布单倍型,湖北的宣恩具有多种广布单倍型,湖北的武当山具有特有单倍型。结合四照花的分布模拟推测四照花的冰期避难所是武当山和宣恩,湖北宣恩和武当山是四照花的起源中心。

【学位授予单位】：南昌大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018

1234187246572142592

1 管毕财;陈微;刘想;蔡奇英;刘以珍;葛刚;四照花物种分布格局模拟及冰期避难所推测[J];西北植物学报;2016年12期 2 李丽卡;李象钦;谢国文;李海生;郑毅胜;藤婕华;高锦伟;基于cpDNA片段探讨中-日间断分布双花木属植物的系统发育学[J];生物技术通报;2016年01期 3 胡兆锋;向秋云;黄宏文;四照花亚属的nrDNA ITS致同进化不完全[J];热带亚热带植物学报;2013年01期 4 张克丽;云祖军;花色素苷在秋季四照花叶片中积累提高氮素回收效率[J];陕西林业科技;2009年06期 5 傅伯杰;吕一河;陈利顶;苏常红;姚雪玲;刘宇;国际景观生态学研究新进展[J];生态学报;2008年02期 6 文自翔;赵团结;郑永战;刘顺湖;王春娥;王芳;盖钧镒;中国栽培和野生大豆农艺品质性状与SSR标记的关联分析 I.群体结构及关联标记[J];作物学报;2008年07期 7 沈传波;梅廉夫;徐振平;汤济广;田鹏;大巴山中—新生代隆升的裂变径迹证据[J];岩石学报;2007年11期 8 王利刚;虞德兵;杜文兴;徐银学;刘红林;练春兰;候水生;王林云;利用双重抑制PCR技术分离鸭微卫星标记[J];扬州大学学报;2006年02期 9 易朝路,崔之久,熊黑钢中国第四纪冰期数值年表初步划分[J];第四纪研究;2005年05期 10 冯芳君,罗利军,李荧,周立国,徐小艳,吴金红,陈宏伟,陈亮,梅捍卫水稻InDel和SSR标记多态性的比较分析[J];分子植物育种;2005年05期

1289887145204383744