通过测序进行基因分型，以确定药用植物洋甘菊的遗传结构，并通过全基因组关联作图鉴定开花时间和与α
背景技术洋甘菊（Matricaria recutita L.）在草药中具有多种应用的悠久历史，并且头状花序包含许多具有药用活性的次级代谢产物。在主要的农作物中，下一代测序（NGS）方法被广泛应用于开发遗传资源，开发基因组资源和增强育种。在这里，按基因分型法（GBS）已用于非模型药用植物洋甘菊中，以评估栽培品种/种群的遗传结构，并进行全基因组关联研究（GWAS），重点研究具有显着影响的基因开花时间和药用重要的α-双糖醇含量。结果GBS分析可在我们的91 M小组中鉴定6495个高质量SNP标记。来自德国Gatersleben温室的33种起源的recutita植物（每种都有2-4个基因型）和4种M. discoidea植物。证实M. recutita与外面的群体明显不同，如使用SNP标记的不同聚类和主坐标分析所证明的。相同来源的甘菊基因型在遗传上大多相似。基于模型的聚类分析揭示了一大类四倍体基因型，其遗传分化低，包括来自14个起源的39株植物。四倍体倾向于表现出比二倍体更低的遗传多样性，这可能反映了它们仅通过有限的遗传背景进行人工多倍体化而起源。对开花时间的分析表明，二倍体的开花时间通常比四倍体的开花时间早，对α-bisabolol的分析确定了几种具有高含量的四倍体基因型。GWAS鉴定出开花时间（9）和α-bisabolol（71）的SNP高度显着（P <0.01）。据报道，一个带有与开花时间相关的SNP的序列在拟南芥的自花授粉中起作用，而已鉴定出四个与α-bisabolol相关的带有SNP的序列参与了多种植物物种的植物生物和非生物胁迫反应。结论创造了第一个基因组资源，供将来用于增强洋甘菊育种的应用，并且对多样性的分析将促进这些遗传资源的开发。GWAS数据为未来研究洋甘菊重要性状的遗传学奠定了基础，
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