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椭圆叶花锚叶绿体全基因组分析及谱系地理学研究

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目录

第一章 文献综述

1.1 椭圆叶花锚研究

1.1.1 椭圆叶花锚概述

1.1.2 椭圆叶花锚研究进展

1.2 叶绿体基因组研究

1.2.1 叶绿体基因组概况

1.2.2 叶绿体基因组应用

1.2.3 测序技术发展

1.3 谱系地理学研究

1.3.1 谱系地理学概况

1.3.2 谱系地理学基本理论

1.4 研究目的及意义

1.5 技术路线图

第二章 材料与方法

2.1 实验材料

2.2 实验试剂与仪器

2.2.1 试剂

2.2.2 仪器

2.3 研究方法

2.3.1 叶绿体DNA序列分析

2.3.2 谱系地理学分析

第三章 结果与分析

3.1 椭圆叶花锚叶绿体DNA序列分析

3.1.1 总DNA提取

3.1.2 椭圆叶花锚叶绿体基因大小

3.1.3 椭圆叶花锚叶绿体基因注释、基因功能及分类

3.1.4 IR边界分析

3.1.5 简单重复序列分析

3.1.6 密码子偏好性分析

3.1.7 基因组比较分析

3.1.8 系统发育分析

3.2 谱系地理学分析

3.2.1 PCR扩增

3.2.2 椭圆叶花锚的单倍型分布

3.2.3 居群遗传结构特征

3.2.4 居群历史动态分析

3.2.5 单倍型间的系统发育关系

3.2.6 生态位模拟分析

第四章 讨论

4.1 椭圆叶花锚叶绿体DNA序列分析

4.2 谱系地理学分析

4.2.1 椭圆叶花锚的居群遗传结构

4.2.2 冰期避难所及进化历史推测

4.3 椭圆叶花锚的保护策略

参考文献

致谢

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