菊花枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性比较
菊花枯萎病(Fusarium oxysporum f. sp. chrysanthemi)是目前影响菊花产业发展的一种侵入土壤根部传播的病害。笔者利用Illumina MiSeq高通量测序技术探讨菊花患枯萎病的发病植株和菊花健康植株的土壤根际微生物群落结构的差异。结果表明，菊花枯萎病的发生对根际土菌落丰富度存在明显影响。健康菊花植株和患病菊花植株根际细菌OTU数分别是1831和1723个，两者共有为1661个，菊花健株根际土壤中细菌OTU总数比菊花病株增加6.23%，特有OTUs数是患病植株的2.74倍。从土壤根际群落结构的多样性水平上看，菊花患枯萎病植株低于菊花健康植株。Alpha多样性指数显示，菊花病株根际土壤的Shannon、Ace以及Chao1指数比健株降低1.60%、5.71%和6.62%。此外，菊花患枯萎病植株与健康植株在土壤细菌群落多样性的结构上也有明显差异，菊花健康植株根际土中，主要α-变形菌纲(α-proteobacteria)、芽孢杆菌纲(Bacilli)、绿弯菌纲(Chloroflexia)，其相对丰富度分别比病株高10.27%、1.51%、9.54%；在属水平上，病株根际土中芽孢杆菌属(Bacillus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、节杆菌属(Arthrobacter)相对丰富度比健株分别低4.14%、0.45%、39.24%。上述结果说明，在菊花根际土中，细菌群落结构的改变以及物种多样性的降低是菊花枯萎病发生的关键因素，研究结果可为更早防治菊花枯萎病提供理论依据。 （共8页)
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