分享12个植物研究相关的数据库
01
AgBioData
农业研究依赖于数据，如今产生的大量农业生物数据使得科学的数据管理手段至关重要。AgBioData是一个由在农业生物数据库、数据档案和知识库上工作的人组成的联盟，致力于确定数据库开发、管理中的共同问题，创建更易查找、更易访问的数据库。
数据库链接：
https://www.agbiodata.org/
02
JGI Phytozome
Phytozome 是一个收录植物基因组数据的网站，通过将大量植物基因组数据整合成为一体，并执行统一的注释和分析，Phytozome促进了更精准的比较基因组研究。
数据库链接：
https://phytozome-next.jgi.doe.gov/
03
NGS Databases & sRNA Tools
二代测序（NGS）数据库，包括植物的RNA和基因组信息资源。
数据库链接：
https://mpss.meyerslab.org/
04
plantpromoterdb 3.0
PPDB是一个植物启动子数据库，提供有关转录起始位点（TSSs）、核心启动子结构（TATA盒、启动子、GA和CA元件）和调控元件组（REGs）等转录调控元件信息。
数据库链接：
https://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp/ppdb/cgi-bin/index.cgi
05
PRGdb 4.0
PRGdb，一个植物抗性基因数据库。植物具有识别潜在病原体和捕食者的能力，并激活防御机制来对抗它们。这些机制的激活是基于所谓的病原体识别基因（PRG）所编码的特定受体。通过研究单个基因可获得关于植物-病原体相互作用的知识。
数据库链接：
http://prgdb.org/prgdb/
06
TRY
TRY，植物性状数据库。植物性状与个体组织的形态学、解剖学、生化学、生理学或现象学特征，是理解和预测生态系统生物多样性和全球变化的关键。
数据库链接：
https://www.try-db.org/TryWeb/Home.php
07
Plant Genome Editing Database
植物基因组编辑数据库（PGED），提供CRISPR/Cas9技术相关的植物信息，用以研究经济上重要的性状。用户可以通过选择感兴趣的物种并浏览携带突变基因列表，或使用特定基因ID（例如Solyc05g053230）搜索数据库。
PGED提供的信息包括转化实验、转化植株品种名称、所使用的DNA构建包括引导RNA序列和用于表征结果突变的引物，以及突变植株系的详细信息。
数据库链接：
http://plantcrispr.org/cgi-bin/crispr/index.cgi
08
RosBREED
RosBREED旨在开发和应用现代DNA测序和相关育种方法，开发新的栽培品种，重点关注八种作物：苹果、黑莓、桃子、梨子、玫瑰、草莓、甜樱桃和酸樱桃。
数据库链接：
https://www.rosbreed.org/
09
Cacao Genome Database
可可基因组序列的发布为研究 人员提供访问最新基因组的机会，使研究更加高效，并加速育种过程，从而加快推出优良可可栽培品种。
数据库链接：
https://www.cacaogenomedb.org/
10
Citrus Genome Database
柑橘基因组数据库（Citrus Genome Database，CGD），旨在促进柑橘的基础、翻译和应用性研究。该数据库包含柑橘的基因组学、遗传学和育种数据，以及与HLB相关的生物数据。
数据库链接：
https://www.citrusgenomedb.org/
11
Pulse Crop Database
Pulse Crop Database（PCD），豆类作物数据库，旨在成为基因组辅助育种（Genomics-Assisted Breeding，GAB）资源。GAB提供了识别感兴趣性状相关基因的工具，以及其他方法来优化植物育种效率，并提供相关的遗传和育种信息。
数据库链接：
https://www.pulsedb.org/
12
AraNet
通过整合异质组学数据，为拟南芥构建了一个基因组规模的功能基因网络，实现了数据驱动方法揭示植物中复杂的基因与表型关联关系。
数据库链接：
https://www.inetbio.org/aranet/
好啦，本次的分享就先到这里啦！
*未经许可，不得以任何方式复制或抄袭本篇文章之部分或全部内容。版权所有，侵权必究。
基迪奥生物|专业定制测序服务
联系方式：020-39341079；service@genedenovo.com
责任编辑：
相关知识
数据库分享
“蓼”及其相关植物的原植物研究
室内植物墙怎么做？12个创意设计案例分享
植物科学常用数据库大全
面向对象的病虫害数据库研究与建立
中国植物物种信息数据库
信息·资源·研究 第16讲：古典文献全文数据库检索与利用
《园艺研究》作者分享会第40期
世界山茶属植物品种数据库正式开通
植物相关研究最新进展（2022年8月）
网址: 分享12个植物研究相关的数据库 https://m.huajiangbk.com/newsview676909.html
| 上一篇: 花的数据集分类 |
下一篇: 【免费】深度学习之图像分类数据集 |
