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高通量测序技术——打开病原体诊断的“钥匙”

花匠小妙招
2024-11-24 11:52

新冠疫情肆虐之后，全球感染性疾病发病率明显提升，病原体的发展也逐渐呈现出复杂化与多样化趋势，包括新变异型冠状病毒、流感病毒、腺病毒，呼吸道合胞病毒以及肺炎支原体等感染性疾病。对于沙眼衣原体、HIV病毒以及结核分枝杆菌等感染性疾病，相关病原体也存在死灰复燃的情况，并表现出一些新的致病特征。对于不同种类的新发与再发感染性疾病，包括不容易发现的多重感染，同时还包括不明病因的发热症状，都严重威胁到人们的生命安全和健康。所以，需要高度重视病原体检测诊断，有效提升感染性疾病诊断的准确性，进一步保证诊断的时效性。在此过程中，需要有效运用高通量测序技术，以此来得到更为准确的病原体诊断结果。

一、感染性疾病概述

在医院临床治疗过程中，感染性疾病是一类常见疾病，通常与病原体感染有关，主要包括寄生虫、真菌、病毒以及细菌等，进而导致患者出现全身或者局部炎症，并可能导致其器官功能出现障碍，危害性较大，病死率也相对较高。从致病因素角度来看，感染性疾病存在着十分复杂的致病因素，而且有着多样化的临床表现。因此，需要对病原体进行快速、准确且全面的鉴别，确保临床医生可以采取科学有效的治疗措施，从而保证治疗工作的针对性与及时性。

二、病原体检测概述

针对传统病原微生物检测手段展开分析，其具体包括免疫学检测、生化检测、培养分离以及形态学检测等。对于此类检测方法，其使用周期相对较长，而且阳性率相对较低，缺乏足够的灵敏度，检测覆盖范围也相对较小。与此同时，在实际运用这些检测方法时，对相关操作人员的专业技术有着严格要求。针对分子生物学检测方法，其主要包括等温扩增技术、荧光定量PCR技术等，通过运用此类检测方法，可以使上述问题得到有效解决，并特异性的检测核酸序列，对病原体种类做出快速判断，确保可以准确检测分型与耐药基因。现如今，PCR分子检测手段，可以在临床病原体检测工作中进行有效应用，并针对罕见病原体引起或者混合感染的感染性疾病，采用此类检测手段仍无法有效保证病原体诊断的准确性。

三、高通量测序技术的应用

伴随着我国基因组学技术的快速发展，高通量测序技术的应用也变得更加广泛，并称之为下一代测序技术，对传统微生物培养不具有依赖性，可以在获取临床样本后，高通量的测序核算，并在比对数据库后，可以有效检测感染性疾病，实现对疾病的分型和溯源，有效评估其耐药性。高通量测序技术对微生物的鉴别，具体采用两种方法，分别为靶向测序与宏基因组测序。现如今，在临床治疗过程中，对于宏基因组测序，主要采用鸟枪法宏基因组，可以在对特定环境样品以及人体样本进行获取后，高通量的测序总核算，在与数据库充分对比后，可以对感染病原体信息有效获取。

在临床应用方面，宏基因组测序可以在相关感染病原体诊断方面进行应用，具体包括中枢神经系统病毒感染和急性感染、慢性中枢神经系统感染、疑难呼吸道感染、血流感染、腹腔感染、呼吸道重症感染等。对于宏基因组测序的适应症，在临床应用过程中具有规范检测策略，需要有效配合常规分子检测和传统微生物检验方法，从而有效开展检测工作。对于其适应证而言，具体包括免疫功能障碍、危重感染、疑似新病原引起的感染以及群体性感染事件等。与此同时，还需要对其检测成本进行充分考虑，对送检样本与时机加以明确。宏基因组测序检测属于二线检测手段，但对于送检样本，其需要和传统实验室检测过程中同时进行采样，根本样本类型展开分析，明确具体的检测要求，从而有效保存样本。对于多数宏基因组测序报告，需要合理采取微生物序列数，比运用降序排列形式，从而对样本当中的微生物组成充分呈现。针对无菌部位样本，通过采取此种检测方式，可以更好地获取诊断证据，确保对病原体进行准确判断。在此过程中，相关临床医师需要根据患者病情，详细展开分析工作，并对其病情结果做出判读。对于相关检测结果，需要具有明确的解读规范，主要包括临床标准以及检测阈值等。这样一来，可以更好地积累数据，并对来源不同的样本展开分析，确保获得更精准的检测结果。