向日葵OSCA基因家族的进化分析及NaCl胁迫下的表达分析,PeerJ

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• 2024-11-25 20:34

向日葵OSCA基因家族的进化分析及NaCl胁迫下的表达分析
PeerJ ( IF 2.3 ) Pub Date : 2023-04-17 , DOI: 10.7717/peerj.15089
Feibiao Shan 1, 2, 3 , Yue Wu 3 , Ruixia Du 3 , Qinfang Yang 3 , Chunhui Liu 3 , Yongxing Wang 3 , Chun Zhang 1 , Yang Chen 1, 3

高渗透压门控钙渗透通道 (OSCA) 是 Ca2 + 非选择性阳离子通道，包含钙依赖性 DUF221 结构域，在植物对胁迫和生长的反应中起重要作用。然而，尚未在向日葵中完全鉴定和分析 OSCA 基因。在本研究中，我们全面分析了向日葵、6 种菊科植物（Arctium lappa、Chrysanthemum morifolium、Cichorium endivia、Cichorium intybus、Lactuca sativa var. Angustata 和 Carthamus tinctorius）中 OSCA 基因家族的数量、结构、共线性和系统发育。 )，以及其他六种植物（大豆、拟南芥、水稻、葡萄和玉米）。基于转录组数据和 qRT-PCR 分析了向日葵 OSCA 基因在九种不同组织、六种不同激素和 NaCl 胁迫条件下的表达。向日葵共鉴定出15种OSCA蛋白，分布在10条染色体上，全部位于内质网中。通过对 6 种菊科植物和其他 6 种植物的系统发育树、共线性、基因结构和基序分析，我们发现向日葵 OSCA 蛋白只有 3 个亚家族，缺少 Group 4 亚家族，该亚家族在菊科和受净化选择。向日葵和6种菊科植物OSCA基因结构和基序分析表明，大部分基因的基序数与基因长度呈正相关，不同亚科基序不同，第4亚科基序数最少基因和最简单的基因结构。RNA-seq和qRT-PCR分析表明，向日葵大部分OSCA基因的表达水平在盐胁迫下发生了不同程度的变化，其中HaOSCA2.6和HaOSCA3.1在向日葵对盐胁迫的响应中最为重要。基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）构建了盐胁迫下向日葵基因的共表达网络。总之，我们的研究结果表明 OSCA 基因家族在向日葵的进化过程中是保守的，并且在耐盐性中起着重要作用。这些结果将加深我们对向日葵OSCA基因家族进化关系的理解，为其在盐胁迫下的功能研究提供依据。1在向日葵对盐胁迫的反应中最为重要。基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）构建了盐胁迫下向日葵基因的共表达网络。总之，我们的研究结果表明 OSCA 基因家族在向日葵的进化过程中是保守的，并且在耐盐性中起着重要作用。这些结果将加深我们对向日葵OSCA基因家族进化关系的理解，为其在盐胁迫下的功能研究提供依据。1在向日葵对盐胁迫的反应中最为重要。基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）构建了盐胁迫下向日葵基因的共表达网络。总之，我们的研究结果表明 OSCA 基因家族在向日葵的进化过程中是保守的，并且在耐盐性中起着重要作用。这些结果将加深我们对向日葵OSCA基因家族进化关系的理解，为其在盐胁迫下的功能研究提供依据。我们的研究结果表明，OSCA 基因家族在向日葵的进化过程中是保守的，并且在耐盐性中起着重要作用。这些结果将加深我们对向日葵OSCA基因家族进化关系的理解，为其在盐胁迫下的功能研究提供依据。我们的研究结果表明，OSCA 基因家族在向日葵的进化过程中是保守的，并且在耐盐性中起着重要作用。这些结果将加深我们对向日葵OSCA基因家族进化关系的理解，为其在盐胁迫下的功能研究提供依据。

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