向日葵科（菊科）叶绿体苏氨酸 (trnT
向日葵科（菊科）叶绿体苏氨酸 (trnT-GGU) 基因的假化
Scientific Reports ( IF 3.8 ) Pub Date : 2021-10-26 , DOI: 10.1038/s41598-021-00510-4
Abdullah 1 , Furrukh Mehmood 1 , Parviz Heidari 2 , Abdur Rahim 3 , Ibrar Ahmed 4 , Peter Poczai 5, 6
叶绿体基因组在进化过程中不断进化。在叶绿体基因组中发现了各种类型的突变事件，包括插入-缺失 (InDels)、替换、倒位、基因重排和基因假基因化。叶绿体苏氨酸 ( trn T - GGU) 基因的假基因化先前在柳杉(Cupressaceae)、天竺葵(Geraniaceae) 以及 Gnaphalieae 族 (Asteroideae、Asteraceae )的Anaphalis sinica和Leontopodium leiolepis中被报道过。在这里，我们对菊科 13 个亚科的物种中的trn T-GGU 基因进行了广泛分析，发现该基因在核心菊科（裸露亚科、菊苣亚科、伞形花科和星菊亚科）中为假基因，与插入事件相关位于5′受体茎内，与物种的习性、栖息地和地理分布等生态因素无关。 trn T-GGU 的假基因化在密码子使用中没有被预测到，这表明超级摆动现象发生在核心菊科植物中，其中单个转移 RNA ( trn T-UGU) 解码了苏氨酸的所有四个密码子。据我们所知，这是使用超级摆动现象进行翻译的植物物种完整进化枝的第一个证据。
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更新日期：2021-10-26
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