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TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的方法.pdf

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1、(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201811057880.0 (22)申请日 2018.09.11 (71)申请人 西北农林科技大学 地址 712100 陕西省咸阳市杨凌示范区邰 城路3号 (72)发明人 张延龙张庆雨谢力行孙道阳 牛立新杨伟宗 (74)专利代理机构 西安通大专利代理有限责任 公司 61200 代理人 范巍 (51)Int.Cl. C12N 15/82(2006.01) (54)发明名称 TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种 牡丹花器官的方法 (57)摘要 本发明公开了一种TRV载体介导的病。

2、毒诱导 基因沉默系统接种牡丹花器官的方法: 将TRV病 毒载体转化农杆菌, 对含有TRV的阳性克隆经培 养后以注射接种方式侵染花器官。 经本发明方法 接种过的牡丹花器官, 在花瓣、 雄蕊、 雌蕊、 萼片 等组织中均可以检测到TRV病毒载体的存在, 并 出现TRV侵染的症状。 本发明为病毒诱导基因沉 默技术在牡丹花器官发育过程相关基因研究中 的应用提供了一种快捷、 高效的侵染方法。 权利要求书1页 说明书5页 序列表1页 附图2页 CN 109022483 A 2018.12.18 CN 109022483 A 1.一种TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的方法, 其特征在于: 该。

3、 接种牡丹花器官的方法包括以下步骤: 1)将病毒载体TRV1以及TRV2或者将病毒载体TRV1以及插入有目的基因的重组TRV2分 别转化农杆菌, 将转化得到的含有TRV1的阳性农杆菌与含有TRV2或重组TRV2的阳性农杆菌 经培养后于侵染缓冲液中混合, 得混合菌液; 2)经过步骤1)后, 用带针头的注射器吸取混合菌液, 然后将针头于发育中的牡丹花器 官处插入牡丹植株内部并进行注射接种, 直至该牡丹花器官表面有液体渗出时停止注射; 3)注射结束后采用以下条件对牡丹植株进行培养: 温度为2125, 湿度为6070, 光照强度为18002000Lx。 2.根据权利要求1所述一种TRV载体介导的病毒诱。

4、导基因沉默系统接种牡丹花器官的 方法, 其特征在于: 所述接种牡丹花器官的方法还包括以下步骤: 在牡丹植株培养过程中对 牡丹花器官进行表型观测, 并采样、 提取RNA后用半定量的方法检测花器官各结构的TRV病 毒载体的积累情况。 3.根据权利要求1所述一种TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的 方法, 其特征在于: 所述转化采用冻融法。 4.根据权利要求1所述一种TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的 方法, 其特征在于: 所述侵染缓冲液包括以下组分: 10mM 2-吗啉乙磺酸、 100 M乙酰丁香酮 及10mM MgCl2。 5.根据权利要求1所述一种TRV载体介。

5、导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的 方法, 其特征在于: 将对应阳性农杆菌培养至OD600值为0.60.8后, 经侵染缓冲液重悬并 调节OD600为11.5, 然后按照体积比为1:1进行混合。 6.根据权利要求1所述一种TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的 方法, 其特征在于: 所述花器官在接种时的发育阶段处于显蕾期至圆桃期之间。 7.根据权利要求1所述一种TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的 方法, 其特征在于: 所述针头的插入位置具体为萼片基部。 权利要求书 1/1 页 2 CN 109022483 A 2 TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹。

6、花器官的 方法 技术领域 0001 本发明属于植物基因工程技术领域, 涉及病毒诱导基因沉默中TRV载体侵染花器 官的方法。 背景技术 0002 牡丹(Paeonia suffruticosa)属于芍药科芍药属牡丹组, 是重要的观赏花卉和药 用植物, 近年来, 人们发现牡丹除了其花大色艳的观赏特性, 也是一种优良的油料作物, 其 籽油具有产油量高、 油用品质好的特点。 然而, 牡丹作为木本植物, 其遗传转化体系尚不成 熟, 且牡丹生长年限长, 从实生苗到开花需要34年的时间, 研究牡丹花发育以及果实发育 相关的基因存在极大的瓶颈。 0003 病毒诱导的基因沉默(virus-induced gen。

7、e silencing,VIGS)是一种转录后的基 因沉默技术, 其作为一种有效的反向遗传学技术已经被广泛的应用于多种植物。 VIGS的作 用原理是植物在抵御病毒侵染的过程中会产生特异性核酸内切酶Dicer, 将病毒复制过程 中产生的双链RNA切割成2124个核苷酸的小分子干扰RNA(siRNA)。 siRNA在植物细胞内进 一步扩增后, 以单链形式与Agronaute 1(AGO1)蛋白等结合, 形成RNA诱导的沉默复合体 (RNA-induced silencing complex,RISC)。 RISC能够特异地引起植物细胞质中与siRNA同 源的mRNA的降解, 从而导致目的基因的沉默。

8、。 0004 VIGS技术主要借助病毒载体来实现对内源基因的沉默。 烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)是一类应用比较广泛的病毒载体, 具有寄主范围广、 沉默效率高、 维持 时间长等优点。 VIGS实验常用沉默载体为烟草脆裂病毒(TRV)的RNA1和RNA2cDNA的双元表 达载体TRV1和TRV2(Wang S B ,Tian S L ,Shah S N ,et al .Cloning and characterization of the CarbcL gene related to chlorophyll in pepper(Capsicum annuum L。

9、.)under fruit shade stress.Frontiers in Plant Science,2015,6(6): 850.)。 TRV1包括编码RNA依赖的RNA聚合酶、 运动蛋白和16kD蛋白的基因, 是VIGS体系的辅 助病毒载体。 TRV2包括衣壳蛋白(Cp)基因、 多克隆位点(MCS)等, 用于插入目的基因。 0005 但牡丹作为木本植物, 突变体不易获得, 给这类植物的分子育种带来了诸多不便。 目前有关VIGS在牡丹花发育过程中的应用并没有相关报道。 发明内容 0006 本发明的目的在于提供一种TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器 官的方法, 该方法可以简。

10、单、 高效、 低成本的使TRV病毒载体浸染发育中的牡丹花器官。 0007 为达到上述目的, 本发明采用了以下技术方案: 0008 1)将病毒载体TRV1以及TRV2或者将病毒载体TRV1以及插入有目的基因的重组 TRV2分别转化农杆菌, 将转化得到的含有TRV1的阳性农杆菌与含有TRV2或重组TRV2的阳性 农杆菌经培养后于侵染缓冲液中混合, 得混合菌液; 说明书 1/5 页 3 CN 109022483 A 3 0009 2)经过步骤1)后, 用带针头的注射器吸取混合菌液, 然后将针头于发育中的牡丹 花器官处插入牡丹植株内部并进行注射接种, 直至该牡丹花器官表面有液体渗出(水渍状) 时停止注。

11、射; 0010 3)注射结束后采用以下条件对牡丹植株进行培养: 温度为2125, 湿度为60 70, 光照强度为18002000Lx, 16h光照/8h黑暗。 0011 优选的, 所述步骤3)中, 在牡丹植株培养过程中对牡丹花器官进行表型观测, 并采 样、 提取RNA后用半定量的方法检测花器官各组织结构的TRV病毒载体的积累情况。 0012 优选的, 所述转化采用冻融法。 0013 优选的, 所述侵染缓冲液包括以下组分: 10mM 2-吗啉乙磺酸(MES)、 100 M乙酰丁 香酮(AS)及10mM MgCl2。 0014 优选的, 将含有TRV1的阳性农杆菌与另一种阳性农杆菌(例如含有TRV。

12、2)分别培养 至OD600值为0.60.8后, 经侵染缓冲液重悬并调节OD600为11.5, 然后按照体积比为1:1 进行混合。 0015 优选的, 所述花器官在接种时的发育阶段处于显蕾期至圆桃期之间。 0016 优选的, 所述针头的插入位置具体为萼片基部, 与花梗连接处, 细胞组织较厚。 0017 本发明的有益效果体现在: 0018 本发明利用带针头注射器对发育过程中的花器官进行TRV病毒载体接种, 不需要 长周期的稳定表达和无菌操作即可达到侵染目的, 能够用于在短时间内验证目的基因在花 器官的不同结构中的功能, 以及对花发育和果实发育的影响, 本发明成本低、 操作简便, 适 合在牡丹等本体。

13、植物中验证基因的功能, 尤其是牡丹中与花和果实发育的相关基因, 为牡 丹中基因功能的研究提供了新的依据和方向。 0019 进一步的, 从萼片基部位置进行注射, 可以方便、 快捷的将包含病毒载体的侵染缓 冲液运送至花器官的各组织结构中, 并且使整个花苞出现明显的水渍状, 提高侵染效果。 附图说明 0020 图1为TRV1、 TRV2载体(pTRV1、 pTRV2)结构图。 0021 图2为接种方法示意图; 其中: (a)接种时期; (b)接种方法; (c)接种完成。 0022 图3为接种12天后的花器官表型; 其中: 下方视图为上方视图的纵向局部剖开。 0023 图4为接种12天后花器官不同结构。

14、的解剖图。 0024 图5为半定量检测花器官不同结构的病毒载体的积累情况。 具体实施方式 0025 下面结合附图和实施例对本发明作进一步详细说明, 其目的在于更好的理解本发 明的内容而非限制本发明的保护范围。 0026 本发明基于VIGS系统, 提出了一种可以在研究牡丹花发育相关基因中使用的TRV 载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的方法。 0027 (一)原料和试剂来源 0028 1)牡丹植株: 牡丹品种为凤丹(种子购买自陕西中资国业牡丹产业发展有限公 司), 种植于相同环境下(种植地点: 西北农林科技大学资源圃)。 说明书 2/5 页 4 CN 109022483 A 4 002。

15、9 2)VIGS实验所用沉默载体TRV1和TRV2(参见图1), 由清华大学刘玉乐教授馈赠 (2011年10月), 但均可根据现有文献自行构建。 0030 3)农杆菌GV3101购于上海生物。 0031 4)LB液体培养基配方: 10g/L胰蛋白胨、 5g/L酵母提取物、 10g/LNaCl; 0032 LB固体平板培养基: 制作平板, 则在LB液体培养基中再加入15g/L琼脂粉即可。 0033 5)YEP液体培养基配方: 10g/L胰蛋白胨、 10g/L酵母提取物、 5g/L NaCl; 0034 YEP固体平板培养基: 制作平板, 则在YEP液体培养基中再加入15g/L琼脂粉即可。 003。

16、5 (二)接种方法 0036 1、 农杆菌的转化及培养 0037 1.1)将TRV2、 TRV1质粒分别用液氮冻融法转化到农杆菌GV3101感受态细胞中, 液 氮冻融法转化农杆菌的具体方法为: 取12 L病毒载体质粒加入到1管感受态GV3101中, 冰 上放置30min; 再放入液氮中速冻5min, 取出置于28的水浴中5min, 之后冰浴2min。 加入 900 L YEP液体培养基, 180rpm, 轻摇24h。 室温下4000rpm离心1min, 弃800 L上清, 再轻轻 吸打使细胞悬浮, 得转化液。 吸取转化液200 L均匀涂布于YEP固体平板培养基(含50 g/mL Rif+50 。

17、g/mL Gen+50 g/mL Kan)上, 28倒置避光培养2天。 从平板上挑取单菌落于300 L YEP液体培养基(含50 g/mL Rif+50 g/mL Gen+50 g/mL Kan)中, 培养5h(28, 250rpm)。 然 后以菌液做模板, PCR检测阳性克隆。 将得到的阳性菌株保菌备用。 0038 1.2)将含有TRV2、 TRV1病毒载体的GV3101农杆菌分别接种于5mL YEP液体培养基 (含50 g/mL Kan+50 g/mL Rif+50 g/mL Gen)中, 分别于28振荡培养过夜。 0039 1.3)第二天取500 L菌液接种于25mL YEP液体培养基(。

18、含50 g/mL Kan+50 g/mL Rif+50 g/mL Gen)中, 28振荡培养过夜, 至OD600值为0.60.8(OD600值与培养物的侵染 活性有关), 4000r/min离心20min, 倒掉上清, 保留菌沉淀。 0040 1.4)用20mL侵染缓冲液(10mM MES+100 M AS(Acetosyringone)+10mM MgCl2, 溶 剂是水)重悬菌体, 并用侵染缓冲液调节OD600值为1.21.5。 0041 1.5)经过1.4)后, 将含有TRV1的GV3101菌液与含有TRV2的GV3101菌液按1:1的比 例(体积比)混匀, 28、 90r/min下放置。

19、3h(充分混匀), 得混合菌液。 0042 2、 侵染 0043 于牡丹圆桃期, 选取生长发育正常、 未受病菌感染的花苞, 进行接种(2018年3月)。 用带针头的注射器吸取混合菌液, 针对牡丹萼片基部, 进行注射接种。 从2到3个角度(周向 上)进行注射, 直至花苞表面充满水渍。 接种结束后, 将盆栽植株移到人工气候室中, 培养条 件为: 温度为232, 湿度为6070, 光照强度为18002000Lx, 16h光照/8h黑暗(该培 养条件有利于TRV病毒载体的繁殖, 以达到良好的侵染效果)。 0044 3、 检测 0045 于接种后12天, 对接种后的花器官进行表型观测, 并分组织采样提取。

20、RNA, 用半定 量的方法检测病毒载体的积累情况。 0046 3.1)牡丹花器官各组织的RNA的提取 0047 取2mL离心管, 加入700 L裂解液(665 L SL和35 L -巯基乙醇); 0048 取100mg组织, 液氮中研磨组织成细粉, 震荡混匀, 样品较多时震荡后于冰上放 置。 12000rpm, 2min(4); 说明书 3/5 页 5 CN 109022483 A 5 0049 吸取上清液, 并转移至CS过滤柱中, 12000rpm, 2min(4), 轻轻吸取上清液, 并 转移到新的RNase-Free的离心管里。 0050 轻轻加入无水乙醇(为上清液体积的0.4倍), 混。

21、合均匀后, 将所有液体转入CR3 吸附柱中, 12000rpm, 15sec(4), 弃废液, 将CR3吸附柱重新放回收集管。 0051 在CR3吸附柱中加入350 L的去蛋白液RW1, 12000rpm, 15sec(4), 弃废液, 将 CR3吸附柱重新放回收集管。 0052 加80 L的DNase I(提前配好)于CR3吸附柱中央处, 静置15min(室温)。 0053 加入350 L的去蛋白液RW1于CR3吸附柱中, 静置1min, 12000rpm, 15sec, 弃废液, 将CR3吸附柱重新放回收集管。 0054 向CR3吸附柱中加入500 L漂洗液RW(用前加乙醇), 12000。

22、rpm, 15sec, 弃废液。 0055 重复步骤一次。 0056 之后12000rpm, 2min(4), 将CR3吸附柱放入新的离心管, 在吸附膜的中央滴加 3050 L ddH2O, 静置3min(室温), 12000rpm, 1min, 即为RNA提取液。 0057 3.2)cDNA的合成 0058 通过电泳检测RNA质量, 核酸蛋白定量仪测定RNA含量。 cDNA第一链的合成参照 RT reagent Kit with gDNA Eraser(TAKARA), 之后用18S扩增, 用于测定 cDNA的质量。 0059 3.3)半定量检测病毒积累情况 0060 取2 L上述合成的cD。

23、NA为模板, 用TRV2-U/TRV2-L引物PCR扩增, 检测TRV2, 反应体 系如下: 0061 0062 TRV2-U: 5 -TTACGACGAACCAAGGGAGTACTAC-3 0063 TRV2-L: 5 -AGTCACAATTAGCCCTATTTAGATGT-3 0064 PCR反应程序: 942min; 9430s, 5430s, 7230s, 28个循环; 725min。 0065 3.4)结果与分析 0066 如图2所示, 在牡丹显蕾期进行接种, 直到花蕾外苞充满水渍状。 接种后, 牡丹花朵 与对照(未接种)呈现明显的差异(图3、 图4)。 接种后12天, 花瓣出现显著。

24、的扭曲症状(病毒 说明书 4/5 页 6 CN 109022483 A 6 感染导致), 且相比于对照, 接种过病毒载体的牡丹花瓣出现褪色现象。 接种后12天, 雄蕊顶 端发黑, 且不散粉, 接种后20天, 雄蕊全部变黑、 焦枯。 萼片顶端出现失水现象。 提取花器官 不同结构的RNA进行病毒载体检测, 均能检测到病毒载体的积累(图5)。 0067 总之, 本发明公开的接种方法, 可以简便、 快速的将TRV病毒载体接种到发育中的 牡丹花器官中, 使牡丹花器官在花瓣、 雄蕊、 雌蕊、 萼片等组织结构中均可以检测到病毒载 体的存在。 本发明为病毒诱导基因沉默技术在牡丹花发育过程相关基因研究中的应用提。

25、供 了一种快捷、 高效的侵染方法。 对于研究牡丹花发育以及果实发育相关基因提供了新的思 路。 说明书 5/5 页 7 CN 109022483 A 7 西北农林科技大学 TRV载体介导的病毒诱导基因沉默系统接种牡丹花器官的方法 2 1 25 DNA 人工序列 1 ttacgacgaa ccaagggagt actac 25 2 26 DNA 人工序列 2 agtcacaatt agccctattt agatgt 26 序列表 1/1 页 8 CN 109022483 A 8 图1 图2 说明书附图 1/2 页 9 CN 109022483 A 9 图3 图4 图5 说明书附图 2/2 页 10 CN 109022483 A 10 。

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所属分类:花卉
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