了解农作物病毒性疾病的出现和流行需要对病毒进行系统的流行病学监测,并分析生态和进化过程如何结合起来形成病毒种群动态。在此,我们对西班牙2011年至2020年连续10个种植季节的甜瓜和西葫芦作物中六种蚜虫传播病毒的发生情况进行了广泛监测。最流行的病毒是葫芦蚜传黄化病毒(CABYV)和西瓜花叶病毒(WMV) ),分别有 31% 和 26% 的样品出现泛黄和马赛克症状。其他病毒,如西葫芦黄花叶病毒、黄瓜花叶病毒、摩洛哥西瓜花叶病毒和木瓜环斑病毒,检出频率较低(<3%),且大多为混合感染。值得注意的是,我们的统计分析显示,甜瓜和西葫芦宿主中的 CABYV 和 WMV 之间存在显着关联,这表明混合感染可能正在影响这些病毒性疾病的进化流行病学。然后,我们利用 Pacific Biosciences 单分子实时 (PacBio) 高通量技术对 CABYV 和 WMV 分离株的全长基因组序列进行了全面的遗传表征,以评估其群体的遗传变异和结构。我们的结果表明,CABYV 群体在正选择下显示出 7 个密码子,尽管大多数分离株聚集在地中海分支中,但随后的分子方差分析揭示了显着的、精细尺度的时间结构,部分原因是密码子水平单一感染和混合感染分离株之间的差异。相比之下,WMV群体遗传分析表明,大多数分离株属于新兴分支,没有遗传分化,并且处于纯化选择之下。这些结果奠定了 CABYV 混合感染流行病学相关性的基础,并在全基因组水平上提供了遗传多样性与 CABYV 动态之间的联系。
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网址: 甜瓜和西葫芦作物中蚜虫传播病毒的长期监测:葫芦蚜传黄化病毒和西瓜花叶病毒的遗传多样性和种群结构。,Phytopathology https://m.huajiangbk.com/newsview773231.html
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