一系列不对称花菁染料的合成和DNA结合研究：结构对与天然DNA结合的次要沟纹程度的影响。,Bioorganic & Medicinal Chemistry
合成了十二种新月形不对称染料，并通过光谱法研究了它们与DNA的相互作用。已经开发出一种新型的合成这种花菁染料的简便方法，该方法涉及以高收率制备6-取代的2-硫代甲基-苯并噻唑。新染料是我们最近报道的小沟结合不对称花青染料BEBO的类似物。在该染料中，已知的嵌入花菁染料BO的结构被6-甲基苯并噻唑取代基扩展。在本文中，我们进一步研究了扩展的苯并唑杂环以及花青生色团的吡啶或喹啉部分对于这些新月形染料与小牛胸腺DNA结合模式的作用。对这12种染料的流动LD和CD研究表明，小沟与混合序列DNA的结合程度在这些染料之间有很大差异。我们发现疏水性和大小是识别小凹槽的关键参数。与DNA结合的许多这些花菁的相对较高的荧光量子产率，以及它们在长波长处的吸收，可能使其在生物学应用中有用。特别地，当与DNA结合时，两种含苯并恶唑的染料BOXTO和2-BOXTO显示出高度的小沟结合，量子产率分别为0.52和0.32。与DNA结合的许多这些花菁的相对较高的荧光量子产率，以及它们在长波长处的吸收，可能使其在生物学应用中有用。特别地，当与DNA结合时，两种含苯并恶唑的染料BOXTO和2-BOXTO显示出高度的小沟结合，量子产率分别为0.52和0.32。与DNA结合的许多这些花菁的相对较高的荧光量子产率，以及它们在长波长处的吸收，可能使其在生物学应用中有用。特别地，当与DNA结合时，两种含苯并恶唑的染料BOXTO和2-BOXTO显示出高度的小沟结合，量子产率分别为0.52和0.32。
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