菠萝花过渡过程中的差异基因表达,Plant Direct
菠萝花过渡过程中的差异基因表达
Plant Direct ( IF 2.3 ) Pub Date : 2023-11-14 , DOI: 10.1002/pld3.541
Robert E Paull 1 , Najla Ksouri 2 , Michael Kantar 1 , Dessireé Zerpa-Catanho 3 , Nancy Jung Chen 1 , Gail Uruu 1 , Jingjing Yue 4 , Shiyong Guo 5 , Yun Zheng 5 , Ching Man Jennifer Wai 6 , Ray Ming 3, 4
菠萝 （Ananas comosus var. comosus） 和观赏凤梨科植物通过乙烯或其类似物处理在商业上诱导开花。顶端从营养分生转变为花分生组织，并在 8 至 10 天内表现出形态变化，花在 8 至 10 周后发育。在处理后 6 小时至 8 天的 8 个采样阶段中，发现 7961 个基因在施用乙烯后表现出差异表达 （DE）。在处理后的前 3 天，乙烯合成或乙烯反应的早期阶段几乎没有变化。随后，3 个乙烯反应转录因子 （ERTF） 上调，预测潜在基因靶点为阳性开花调节因子 CONSTANS-like 3 （CO） 、一个 WUSCHEL 基因、两个 APETALA1/FRUITFULL （AP1/FUL） 基因、一个表皮模式基因和一个茉莉酸合成基因。我们确认菠萝已经失去了开花抑制因子 FLOWERING LOCUS C。在初始阶段，SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS 1 （SOC1） 不显著参与该转换。另一个 WUSCHEL 基因和一个 PHD 同源框转录因子，虽然不是 ERTF 的明显直接靶点，但在治疗后 1 天内上调，它们的预测靶点是上调的 CO 、生长素反应因子、SQUAMOSA 和组蛋白 H3 基因，抑制脱落酸反应基因。乙烯处理后 2 至 3 天内，花位点 T （FT） 、顶花 （TFL） 、类似 AGAMOUS 的 APETELAR （AP2） 和 SEPETALA （SEP） 迅速增加。处理后，两个 FT 基因在顶端上调，在叶基部上调，表明没有发生转运。 这些结果表明，菠萝和可能大多数凤梨科植物中的乙烯反应通过 APETALA1/FRUITFULL （AP1/FUL） 及其与 SPL、FT、TFL、SEP 和 AP2 的相互作用直接促进营养到花的转变。开发了基于 AP2/ERTF DE 和预测 DE 靶基因的模型，以关注未来的研究。鉴定的候选基因是遗传操作的潜在靶标，以确定它们在花转变中的分子作用。
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更新日期：2023-11-14
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