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不同品种茶树花发育过程中的转录组分析及激素响应

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第一章文献综述

1.1茶花概述

1.2成花机理研究进展

1.2.1成花诱导机制

1.2.2花的发端机制

1.2.3花器官发育机制

1.3转录组测序技术研究进展

1.3.2RNA-seq测序技术在茶树花研究中的应用

1.4研究的目的与意义

第二章茶树花发育相关基因的转录组分析

2.1材料与方法

2.1.1植物材料

2.1.2总RNA的提取

2.1.3cDNA文库构建和转录组测序

2.1.4质控和比对参考基因组

2.1.5差异表达分析、功能注释及聚类分析

2.1.6WGCNA模块的构建及可视化分析

2.1.7差异表达基因的qRT-PCR验证

2.1.8数据处理

2.2结果与分析

2.2.1测序数据及质量分析

2.2.2不同品种茶花的转录组分析

2.2.3茶树花发育核心转录组的鉴定

2.2.4茶树花发育相关的转录因子鉴定

2.2.5茶树开花时间相关DEGs的鉴定和成花调控网络的构建

2.2.6利用WGCNA鉴定茶树花发育基因共表达模块

2.2.7差异表达基因的qRT-PCR验证

2.3讨论

第三章茶树花中激素合成和信号转导途径相关基因的转录组分析

3.1材料与方法

3.1.1植物材料

3.1.2仪器、材料与试剂

3.1.3标准溶液的配置

3.1.4样品前处理

3.1.5HPLC-ESI-MS/MS检测条件

3.1.6植物激素合成和信号转导相关基因的转录组分析

3.1.7差异表达基因的qRT-PCR验证

3.1.8数据处理

3.2结果与分析

3.2.1茶花中植物激素含量的测定

3.2.2生长素生物合成和信号转导途径相关差异基因表达分析

3.2.3赤霉素生物合成和信号转导途径相关差异基因表达分析

3.2.4细胞分裂素生物合成和信号转导途径相关差异基因表达分析

3.2.5脱落酸生物合成和信号转导途径相关差异基因表达分析

3.2.6水杨酸生物合成和信号转导途径相关差异基因表达分析

3.2.7茉莉酸生物合成和信号转导途径相关差异基因表达分析

3.2.8差异表达基因的qRT-PCR验证

3.3讨论

第四章结论与展望

4.1结论

4.2展望

参考文献

致谢

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所属分类:花卉
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