西兰花 (Brassica oleracea var. italica Plenck) 的染色体尺度参考基因组为硫代葡萄糖苷的生物合成提供了见解
Horticulture Research ( IF 7.6 ) Pub Date : 2024-02-29 , DOI: 10.1093/hr/uhae063
Qiuyun Wu 1, 2, 3 , Shuxiang Mao 1, 2, 3 , Huiping Huang 1, 2, 3 , Juan Liu 1, 2, 3 , Xuan Chen 1, 2, 3 , Linghui Hou 1, 2, 3 , Yuxiao Tian 1, 2, 3 , Jiahui Zhang 4 , Junwei Wang 1, 2, 3 , Yunsheng Wang 4 , Ke Huang 1, 2, 3
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西兰花 (Brassica oleracea var. italica Plenck) 是一种重要的蔬菜作物,因为它富含对健康有益的硫代葡萄糖苷 (GSL)。然而,十字花科 GSL 多样性的遗传基础仍不清楚。在这里,我们报道了使用 PacBio HiFi reads 和 Hi-C 技术生成的西兰花染色体水平基因组组装。最终基因组组装大小为 613.79 Mb,重叠群 N50 为 14.70 Mb。不同品种的 GSL 谱和含量分析,结合系统发育树分析、序列比对和甲基硫代烷基苹果酸合酶 1 (MAM1) 蛋白的构建,揭示了基因拷贝数和氨基酸序列变异都有助于 B. oleracea 中 GSL 生物合成的多样性。BoMAM1 (BolI0108790) 在西兰花中的过表达导致 C4-GSL 的高积累和高比例,表明 BoMAM1 是 C4-GSL 生物合成中的关键酶。这些结果为芸苔属作物未来的遗传研究和营养成分应用提供了有价值的见解。
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更新日期:2024-02-29
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