1.本申请属于生物分子检测及育种领域,具体涉及茄子紫色果皮基因的鉴定方法。
背景技术:
2.茄子(solanum melongena)是全球广泛种植的蔬菜,被全世界人民所喜爱;茄子果皮颜色影响消费者购买欲望,因此值得深入研究。
3.花青素的合成直接影响茄子果皮、花萼颜色,茄子基因影响花青素植物细胞的液泡中的分布以及表现,但并不是果色的完全性决定因素,环境因素也能影响花青素的合成,所以完全依靠样本的表皮颜色进行选种,并不完全可靠;鉴定茄子果皮颜色基因,能够为茄子果品培育选种提供严谨的科学依据;国内外学者在控制茄子紫色果皮基因做了大量研究;但是紫色果皮基因检测精准度、可靠性存在改进空间。
4.
技术实现要素:
5.茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:步骤1、准备检材;步骤2、对检材进行pcr扩增,引物对的核苷酸序列为:正向引物为:wz-1f:5
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cttgtcaaagactgattacacgata-3’;反向引物为:wz-1r:5
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cctatcacacctaattgttaaactg-3’;步骤3、观察扩增结果是否含有199bp的片段,如果不含则说明检材不含紫色果皮基因。
6.进一步的,步骤4、对199bp的片段进行测序,如果199bp的片段的dna序列为:ctcgtcaaagactgattacacgataataaaccaaaaaacataaaaaactttagacctcatacacccaactacttgtgacgtgtgatttgcagtggctattttaggctgaaattaaaaggttattaagttagtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacttgaaaagtaaggtatggtcagtttaacaattaggtgtgatagg,则说明检材含有紫色果皮基因。
7.进一步的,pcr反应体系(12μl)。
8.进一步的,pcr反应体系中,dna工作液2μl。
9.进一步的,pcr反应体系中,2xes taqmastermix 5ul。
10.进一步的,pcr反应体系中,正向引物和反向引物各1μl(10um/l)。
11.进一步的,pcr反应体系中,用3μl ddh2o将总体积补齐至12μl。
12.有益效果:本发明紫色果皮基因的检测结果更精准、更稳定、更可靠。
附图说明
13.图1为实施例1的扩增结果。注:a:sm524;b:sm518。
14.图2为实施例1的样本sm524的照片。
15.图3为实施例1的样本sm518的照片。
16.图4为实施例2的样本表。
17.图5为实施例2的扩增结果。
具体实施例
18.实施例1、茄子紫色果皮基因的检测试验,茄子基因组dna的提取采用改良ctab法;步骤1:获取紫红色外皮茄子sm524和花绿色外皮茄子sm518为试验材料,样本可从广西农业科学院蔬菜研究所获得;步骤2:对上述供试材料进行基因型检测,模板为上述供试材料的基因组dna;步骤3:进行pcr扩增pcr反应体系(12μl)为:dna工作液2μl、2xes taqmastermix 5ul、正向引物和反向引物各1μl(10um/l),用3μl ddh2o将总体积补齐至12μl;正向引物为:wz-1f:5
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cttgtcaaagactgattacacgata-3’;反向引物为:wz-1r:5
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cctatcacacctaattgttaaactg-3’。
19.pcr扩增反应程序:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,56℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环;72℃延伸5 min;扩增产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,硝酸银染色后观察照相。并对pcr扩增产物进行测序;得到如图1所示的扩增结果;对199bp的片段进行测序,其dna序列为:ctcgtcaaagactgattacacgataataaaccaaaaaacataaaaaactttagacctcatacacccaactacttgtgacgtgtgatttgcagtggctattttaggctgaaattaaaaggttattaagttagtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacttgaaaagtaaggtatggtcagtttaacaattaggtgtgatagg对193bp的片段进行测序,其dna序列为:cttgtcaaagactgattacacgataataaaccaaaaaacataaaaaactttagacctcatacacccaactacttgtgacgtgtgatttgcagtggctattttaggctgaaattaaaaggttattaagttagtttaaaaaaaaaaaaaacttgaaaagtaaggtatggtcagtttaacaattaggtgtgatagg实施例2、果皮紫色基因的检测1.试验材料本发明利用如图4所示的8份紫皮茄子自交系及品种和8份非紫皮茄子自交系及品种,对分子标记wz-1进行验证。所用自交系及品种可从广西农业科学院蔬菜研究所获得。
20.2.试验方法对上述供试材料进行基因型检测,模板为上述供试材料的基因组dna。
21.pcr反应体系(12μl)为:dna工作液2μl、2xes taqmastermix 5ul、正向引物和反向引物各1μl(10um/l),用3μl ddh2o将总体积补齐至12μl。
22.pcr扩增反应程序:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,56℃退火30s,72℃延伸30s,35个循环;72℃延伸5 min;扩增产物用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,硝酸银染色后观察照相。并对pcr扩增
产物进行测序。
23.3.试验结果电泳结果如图5所示,泳道1:sm524;泳道2:sm167;泳道3:sm623;泳道4:sm005;泳道5:sm047;泳道6:sm011;泳道7:sm021;泳道8:sm613;泳道9:sm006;泳道10:sm279;泳道11:sm503;泳道12:sm544;泳道13:sm545;泳道14:sm530;泳道15:sm518);泳道16:sm546。验证材料对应的果皮颜色表型见表1,泳道1~10为紫皮材料,11~20为非紫皮材料。分子标记wz-1在紫皮品种(sm524;sm167;sm623;sm005;sm047;sm011;sm021;sm613)的pcr扩增产物均含有大小为199bp的片段且不含有大小为193bp的片段;分子标记wz-1在非紫皮品种(sm006;sm279;sm503;sm544;sm545;sm530;sm518;sm546)的pcr扩增产物均含有大小为193bp的片段且不含有大小为199bp的片段,供试品种的基因型与果色表型鉴定结果一致,说明本发明的分子标记wz-1有较强特异性,可用于茄子果色表型的鉴定筛选。
技术特征:
1.茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:步骤1、准备检材;步骤2、对检材进行pcr扩增,引物对的核苷酸序列为:正向引物为:wz-1f:5
’‑ꢀ
cttgtcaaagactgattacacgata-3’;反向引物为:wz-1r:5
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cctatcacacctaattgttaaactg-3’;步骤3、观察扩增结果是否含有199bp的片段,如果不含则说明检材不含紫色果皮基因。2.如权利要求1所述的茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:步骤4、对199bp的片段进行测序,如果199bp的片段的dna序列为:ctcgtcaaagactgattacacgataataaaccaaaaaacataaaaaactttagacctcatacacccaactacttgtgacgtgtgatttgcagtggctattttaggctgaaattaaaaggttattaagttagtttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacttgaaaagtaaggtatggtcagtttaacaattaggtgtgatagg,则说明检材含有紫色果皮基因。3.如权利要求1所述的茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:pcr反应体系(12μl)。4.如权利要求1所述的茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:pcr反应体系中,dna工作液2μl。5.如权利要求1所述的茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:pcr反应体系中,2xes taqmastermix 5ul。6.如权利要求1所述的茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:pcr反应体系中,正向引物和反向引物各1μl(10um/l)。7.如权利要求1所述的茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:pcr反应体系中,用3μl ddh2o将总体积补齐至12μl。
技术总结
茄子紫色果皮基因的鉴定方法,其特征在于:步骤1、准备检材;步骤2、对检材进行PCR扩增,引物对的核苷酸序列为:正向引物为:Wz-1F:5
技术研发人员:王鹏 王益奎 甘桂云 杨其洪 蒋雅琴 李文嘉 何小艳
受保护的技术使用者:广西壮族自治区农业科学院
技术研发日:2022.12.05
技术公布日:2023/3/2
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